Manes.01G014500.1.v6.1 (mRNA)

Overview
NameManes.01G014500.1
Unique NameManes.01G014500.1.v6.1
TypemRNA
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length3225
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:2433244..2436468 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
Pacid32360236
Longest1
AncestorIdentifiercassava4.1_006918m.v4.1
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G014500Manes.01G014500.v6.1Manihot esculentagene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G014500.1Manes.01G014500.1.v6.1-proteinManihot esculentapolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.1Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.1Manihot esculentaCDS
Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.2Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.2Manihot esculentaCDS
Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.3Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.3Manihot esculentaCDS
Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.4Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.4Manihot esculentaCDS
Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.5Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.5Manihot esculentaCDS
Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.6Manes.01G014500.1.v6.1.CDS.6Manihot esculentaCDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G014500.1.v6.1.three_prime_UTR.1Manes.01G014500.1.v6.1.three_prime_UTR.1Manihot esculentathree_prime_UTR


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Manes.01G014500.1.v6.1 ID=Manes.01G014500.1.v6.1|Name=Manes.01G014500.1|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=3225bp
ATGGTGAATTCTTTACAGAACCTCTGCATGGCCTTAGAGCCAATGCTCAG
GAGAGTGGTGAGTTTCAATCAAATTCTTGCAACCCTAAGACAACAAACAT
GTGCACAAGACAATTTGATCCTAATCAAAGGTTCTTGTTTGTGTTATCTT
AGGTGAATGAAGAAGTGGAGAATAGTCTGAAACGATGTTCATCTCGCTCT
TTCACTCGATCTCCTTCACTTCGAATCCAGGCACCTGAATCATCACCATC
TAGCCTGCAACTTAAGTTTAGAAAAAATCTTTTGCTCCCAATATTCACTG
GGAGCAAAATAGTTGACATAGATAATTCTTCTCTTCAAATACTTTTAGTA
GAAACAAGAGGTGATCTGGCAGTTCCGACGTCTCTCCCTCATCCAATCAA
AGTAGAAATCCTCGTCCTTGATGGAGATTTCCCTTCTGATGATCGGAAGA
CTTGGACTAGTGAAGAATTCGTCAACAATATATTGAAGGAGAGAACCGGC
AAGCGGCCTTTGCTTGCCGGAGATTGCTTGATGGTGACATTAAGAGATGG
AATTGCACCAATTGGTGAGATTGAGTTCACCGATAATTCAAGCTGGATTA
GGAGCAGAAAGTTCAGAATTGGTGCAAGAGTGGTTTCAGGGAGCTCTAAT
GGTGTTCGAATTCATGAAGCAATAACTGAAGCTTTTGTTGTCAAAGATCA
TCGTGGTGAATGTAAGTTTCTTTTTTCTAGCTATTAATTATTTTTAAATA
GCTTGCATATATTGTAGTTATTAATCTCTAGGTCTAATATCCAAAGAAAA
ATTCTTACAGAAACTCAGTTGATTGTCATAAAATTTAACCTCTAACTTGA
AAGCCAACACTAAATTCTACTCCAACTTTAGTAAATTCATTGTCATATTG
ATAGATTTCATAATATATTTATCATTTTTTTTTTCTTAAATTACGTATTA
GAATTTAGAGTCGAGACCTACTAATAACGTGTCGTGTAATCTCATATATT
TTATATAATAAAAATAAATTTTTAAAAATAAATTGTTATTATTCCGATCC
TGAAAATTAAAATTTTAGAAAAATTTATTTTATTTTAAGGAATTGCAAAA
TAAATCTTTAAAAATAGTGTCTACCACGCCTTAAGTTTTTATTATCATTT
TCTATTTTTTTTAATAAATTATTATCAAATACACTTTAATTATAACTACA
TGTCAATAGCAACTGCCTTTACATACAATGGTATAATTATTTTTTTTATG
GCGGTTAAAAAGCGCAGCTAAATTTATAATTTATTGAATATAAAATAAAT
TTTTTAAAAATAAGTTAATATAAATAGTAAAAAAATGAATTTTTTCTATA
ATAATTTTAAATTACTGTCAAATTATTATATTGTTAGTACTAAGATAATA
ATTTTATAACCGCTACGAACTGTTATCTAAACCTTCAAATATAGTAATTA
ATGTATATGTTGCATCTTATTTTGTTAACATTATTACTTATTAATGCTAA
TCAACTTGCATACGATTTTATACATGCAAGAAAATCAAGAAATTAGTTGA
TATTATGTTATTGTATTTTTTTTTATTTAAGAGTTAATTTATTATTTATT
TAAATTAAAATGATTAAATTATTATAATAATTAAAAAAATATGCTGGTTA
TATACCTCAATGGTTGGTTATGAATTAGTGATTTATGGTTAAGTAGCATT
TAAATTATTTTGCATCCATTTCAGTATCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAA
AAGGTTTTGCAAGTGATGGGTTCCAAATCCATTTCATCATTCAATGTCAG
TAGGTAACATCCTTTTCATTCTTTAAATATGGTATTTTCAGTCAAAAGAA
AGGTGATGTTTGGTAGTGCTGCCATTTAATATATTTTTCTTATTTTTCTA
AATTAAAAAAAAATAAAAAGCATAAATATCCCATTTTATTATAGACCTCA
CAGTTCCTGTTCTCCAGATATTTTTGAAATCTGATTCTATTTCAGCTTTT
ATTTAGTTAAAATTCTCTACTTTTTAGAAAGTTAATAACTTTTTCAGATT
TACTAAGCTTTTTCTTCTTACATGTAGTGTACAAGAAGCATCACCCACCA
ATGTTGGATGATGAAGTATGGCGTCTTGAGAAGATTGGGAAAGATGGAGC
TTTTCACAGAAAGCTATCTGCTGAGGGTATCAACACTGTTCAAGAATTCC
TCAAGTTGTCCACTGTCGACCAACACAGGCTTAGGAGGGTATGCAAATTT
TTCAGTTTTGAAGACGACTTCAGTATTAAAAATTAAAAATCTGTCAGTTA
TTTTATTTCTTAAATTAAGAAATTATTTATTAAATTTTATTTTTTTAATA
CAGATTTTAGGACCTGGAATGTCCGAGAAGACATGGGAAGTAACAATAAA
GCATGCAAAGACATGCGAGTTGGGAAACAAACGTTATATTCTTCATGGTC
AGAATTTTAGTATCACATTAAACCCTATATGCCAAGTTGTTAGTGCTGTC
ATTGATGGACAGACATTCTCTACTTCGGATCTTCCAAGACTTAGTAAGGT
ATGAATTGATTCTTATCTTAAACAGAAACTACTAGGTTTTTTTGTTTGGG
TCTCATTTCTTGATTTTGTTTATGTTGTCAGAGTTACATTCAGAATTTGG
TGAGACAAGCCTATGCAAATTGGAGCTCATTACAAGAAGTTGTTGGAGTT
TCAAGCGAGATTGCTTTGCTCACACAAGGTGGGTAAATTGGATACTATAG
GACTAAATAATAATTTTTTTCTTGTACTAATTAATTAACGAATTTTCTTG
GAAAATCATGACAGGAGAGCAAGTGGAGGAGTATCCCAACCACCATTCTC
AGGCAAAAACATTTCATCACCAAATTGGGTACTCATCTGAAAACAGAAGC
ATTGAGATGGGGGAGCAATACAACCAAGCCAACAGCACAAGTGCAAATAT
GGGTTACAGCAATTGGCATGGTGCTGCAGGCATCAATTACAGCATCTCTG
AGGCATCATCAGAGAGTGAATTGACGCCTACATCTTTCTTCAATAGGAAT
TAATGGTCAGTTTAGGTCTCCCACTCAACTGTAAATAGAAAAACTAAAGG
AATTAAAAGCTGCTGCTTGGATGTGGCTGATTCCTACTTCTATGATCAGT
GTGTTTTTCCTATGTTGTAATCCTGTTATTTCCTCATTTCTTTGCAATGA
TAAAGGTCTATAGAACAAACAATAC
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mRNA from alignment at Chromosome01:2433244..2436468+

Legend: CDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G014500.1.v6.1 ID=Manes.01G014500.1.v6.1|Name=Manes.01G014500.1|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=3225bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:2433244..2436468+ (Manihot esculenta)
ATGGTGAATTCTTTACAGAACCTCTGCATGGCCTTAGAGCCAATGCTCAG GAGAGTGGTGAGTTTCAATCAAATTCTTGCAACCCTAAGACAACAAACAT GTGCACAAGACAATTTGATCCTAATCAAAGGTTCTTGTTTGTGTTATCTT AGGTGAATGAAGAAGTGGAGAATAGTCTGAAACGATGTTCATCTCGCTCT TTCACTCGATCTCCTTCACTTCGAATCCAGGCACCTGAATCATCACCATC TAGCCTGCAACTTAAGTTTAGAAAAAATCTTTTGCTCCCAATATTCACTG GGAGCAAAATAGTTGACATAGATAATTCTTCTCTTCAAATACTTTTAGTA GAAACAAGAGGTGATCTGGCAGTTCCGACGTCTCTCCCTCATCCAATCAA AGTAGAAATCCTCGTCCTTGATGGAGATTTCCCTTCTGATGATCGGAAGA CTTGGACTAGTGAAGAATTCGTCAACAATATATTGAAGGAGAGAACCGGC AAGCGGCCTTTGCTTGCCGGAGATTGCTTGATGGTGACATTAAGAGATGG AATTGCACCAATTGGTGAGATTGAGTTCACCGATAATTCAAGCTGGATTA GGAGCAGAAAGTTCAGAATTGGTGCAAGAGTGGTTTCAGGGAGCTCTAAT GGTGTTCGAATTCATGAAGCAATAACTGAAGCTTTTGTTGTCAAAGATCA TCGTGGTGAATGTAAGTTTCTTTTTTCTAGCTATTAATTATTTTTAAATA GCTTGCATATATTGTAGTTATTAATCTCTAGGTCTAATATCCAAAGAAAA ATTCTTACAGAAACTCAGTTGATTGTCATAAAATTTAACCTCTAACTTGA AAGCCAACACTAAATTCTACTCCAACTTTAGTAAATTCATTGTCATATTG ATAGATTTCATAATATATTTATCATTTTTTTTTTCTTAAATTACGTATTA GAATTTAGAGTCGAGACCTACTAATAACGTGTCGTGTAATCTCATATATT TTATATAATAAAAATAAATTTTTAAAAATAAATTGTTATTATTCCGATCC TGAAAATTAAAATTTTAGAAAAATTTATTTTATTTTAAGGAATTGCAAAA TAAATCTTTAAAAATAGTGTCTACCACGCCTTAAGTTTTTATTATCATTT TCTATTTTTTTTAATAAATTATTATCAAATACACTTTAATTATAACTACA TGTCAATAGCAACTGCCTTTACATACAATGGTATAATTATTTTTTTTATG GCGGTTAAAAAGCGCAGCTAAATTTATAATTTATTGAATATAAAATAAAT TTTTTAAAAATAAGTTAATATAAATAGTAAAAAAATGAATTTTTTCTATA ATAATTTTAAATTACTGTCAAATTATTATATTGTTAGTACTAAGATAATA ATTTTATAACCGCTACGAACTGTTATCTAAACCTTCAAATATAGTAATTA ATGTATATGTTGCATCTTATTTTGTTAACATTATTACTTATTAATGCTAA TCAACTTGCATACGATTTTATACATGCAAGAAAATCAAGAAATTAGTTGA TATTATGTTATTGTATTTTTTTTTATTTAAGAGTTAATTTATTATTTATT TAAATTAAAATGATTAAATTATTATAATAATTAAAAAAATATGCTGGTTA TATACCTCAATGGTTGGTTATGAATTAGTGATTTATGGTTAAGTAGCATT TAAATTATTTTGCATCCATTTCAGTATCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAA AAGGTTTTGCAAGTGATGGGTTCCAAATCCATTTCATCATTCAATGTCAG TAGGTAACATCCTTTTCATTCTTTAAATATGGTATTTTCAGTCAAAAGAA AGGTGATGTTTGGTAGTGCTGCCATTTAATATATTTTTCTTATTTTTCTA AATTAAAAAAAAATAAAAAGCATAAATATCCCATTTTATTATAGACCTCA CAGTTCCTGTTCTCCAGATATTTTTGAAATCTGATTCTATTTCAGCTTTT ATTTAGTTAAAATTCTCTACTTTTTAGAAAGTTAATAACTTTTTCAGATT TACTAAGCTTTTTCTTCTTACATGTAGTGTACAAGAAGCATCACCCACCA ATGTTGGATGATGAAGTATGGCGTCTTGAGAAGATTGGGAAAGATGGAGC TTTTCACAGAAAGCTATCTGCTGAGGGTATCAACACTGTTCAAGAATTCC TCAAGTTGTCCACTGTCGACCAACACAGGCTTAGGAGGGTATGCAAATTT TTCAGTTTTGAAGACGACTTCAGTATTAAAAATTAAAAATCTGTCAGTTA TTTTATTTCTTAAATTAAGAAATTATTTATTAAATTTTATTTTTTTAATA CAGATTTTAGGACCTGGAATGTCCGAGAAGACATGGGAAGTAACAATAAA GCATGCAAAGACATGCGAGTTGGGAAACAAACGTTATATTCTTCATGGTC AGAATTTTAGTATCACATTAAACCCTATATGCCAAGTTGTTAGTGCTGTC ATTGATGGACAGACATTCTCTACTTCGGATCTTCCAAGACTTAGTAAGGT ATGAATTGATTCTTATCTTAAACAGAAACTACTAGGTTTTTTTGTTTGGG TCTCATTTCTTGATTTTGTTTATGTTGTCAGAGTTACATTCAGAATTTGG TGAGACAAGCCTATGCAAATTGGAGCTCATTACAAGAAGTTGTTGGAGTT TCAAGCGAGATTGCTTTGCTCACACAAGGTGGGTAAATTGGATACTATAG GACTAAATAATAATTTTTTTCTTGTACTAATTAATTAACGAATTTTCTTG GAAAATCATGACAGGAGAGCAAGTGGAGGAGTATCCCAACCACCATTCTC AGGCAAAAACATTTCATCACCAAATTGGGTACTCATCTGAAAACAGAAGC ATTGAGATGGGGGAGCAATACAACCAAGCCAACAGCACAAGTGCAAATAT GGGTTACAGCAATTGGCATGGTGCTGCAGGCATCAATTACAGCATCTCTG AGGCATCATCAGAGAGTGAATTGACGCCTACATCTTTCTTCAATAGGAAT TAATGGTCAGTTTAGGTCTCCCACTCAACTGTAAATAGAAAAACTAAAGG AATTAAAAGCTGCTGCTTGGATGTGGCTGATTCCTACTTCTATGATCAGT GTGTTTTTCCTATGTTGTAATCCTGTTATTTCCTCATTTCTTTGCAATGA TAAAGGTCTATAGAACAAACAATAC
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Coding sequence (CDS) from alignment at Chromosome01:2433244..2436468+

>Manes.01G014500.1.v6.1 ID=Manes.01G014500.1.v6.1|Name=Manes.01G014500.1|organism=Manihot esculenta|type=CDS|length=1308bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:2433244..2436468+ (Manihot esculenta)
ATGGTGAATTCTTTACAGAACCTCTGCATGGCCTTAGAGCCAATGCTCAG
GAGAGTGGTGAATGAAGAAGTGGAGAATAGTCTGAAACGATGTTCATCTC
GCTCTTTCACTCGATCTCCTTCACTTCGAATCCAGGCACCTGAATCATCA
CCATCTAGCCTGCAACTTAAGTTTAGAAAAAATCTTTTGCTCCCAATATT
CACTGGGAGCAAAATAGTTGACATAGATAATTCTTCTCTTCAAATACTTT
TAGTAGAAACAAGAGGTGATCTGGCAGTTCCGACGTCTCTCCCTCATCCA
ATCAAAGTAGAAATCCTCGTCCTTGATGGAGATTTCCCTTCTGATGATCG
GAAGACTTGGACTAGTGAAGAATTCGTCAACAATATATTGAAGGAGAGAA
CCGGCAAGCGGCCTTTGCTTGCCGGAGATTGCTTGATGGTGACATTAAGA
GATGGAATTGCACCAATTGGTGAGATTGAGTTCACCGATAATTCAAGCTG
GATTAGGAGCAGAAAGTTCAGAATTGGTGCAAGAGTGGTTTCAGGGAGCT
CTAATGGTGTTCGAATTCATGAAGCAATAACTGAAGCTTTTGTTGTCAAA
GATCATCGTGGTGAATTGTACAAGAAGCATCACCCACCAATGTTGGATGA
TGAAGTATGGCGTCTTGAGAAGATTGGGAAAGATGGAGCTTTTCACAGAA
AGCTATCTGCTGAGGGTATCAACACTGTTCAAGAATTCCTCAAGTTGTCC
ACTGTCGACCAACACAGGCTTAGGAGGATTTTAGGACCTGGAATGTCCGA
GAAGACATGGGAAGTAACAATAAAGCATGCAAAGACATGCGAGTTGGGAA
ACAAACGTTATATTCTTCATGGTCAGAATTTTAGTATCACATTAAACCCT
ATATGCCAAGTTGTTAGTGCTGTCATTGATGGACAGACATTCTCTACTTC
GGATCTTCCAAGACTTAGTAAGAGTTACATTCAGAATTTGGTGAGACAAG
CCTATGCAAATTGGAGCTCATTACAAGAAGTTGTTGGAGTTTCAAGCGAG
ATTGCTTTGCTCACACAAGGAGAGCAAGTGGAGGAGTATCCCAACCACCA
TTCTCAGGCAAAAACATTTCATCACCAAATTGGGTACTCATCTGAAAACA
GAAGCATTGAGATGGGGGAGCAATACAACCAAGCCAACAGCACAAGTGCA
AATATGGGTTACAGCAATTGGCATGGTGCTGCAGGCATCAATTACAGCAT
CTCTGAGGCATCATCAGAGAGTGAATTGACGCCTACATCTTTCTTCAATA
GGAATTAA
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