Manes.01G009900.1.v6.1 (mRNA)

Overview
NameManes.01G009900.1
Unique NameManes.01G009900.1.v6.1
TypemRNA
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length9217
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:1741571..1750787 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
Pacid32360275
Longest1
AncestorIdentifiercassava4.1_006347m.v4.1
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G009900Manes.01G009900.v6.1Manihot esculentagene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G009900.1Manes.01G009900.1.v6.1-proteinManihot esculentapolypeptide


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G009900.1.v6.1.five_prime_UTR.1Manes.01G009900.1.v6.1.five_prime_UTR.1Manihot esculentafive_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.1Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.1Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.2Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.2Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.3Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.3Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.4Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.4Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.5Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.5Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.6Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.6Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.7Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.7Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.8Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.8Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.9Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.9Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.10Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.10Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.11Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.11Manihot esculentaCDS
Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.12Manes.01G009900.1.v6.1.CDS.12Manihot esculentaCDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G009900.1.v6.1.three_prime_UTR.1Manes.01G009900.1.v6.1.three_prime_UTR.1Manihot esculentathree_prime_UTR


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Manes.01G009900.1.v6.1 ID=Manes.01G009900.1.v6.1|Name=Manes.01G009900.1|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=9217bp
ACAGCTTCTGCTCTCTTTTCTTCCTGATTCTTTTGTTGAGCGCACAATCG
CCAAAAAGAGAAACAGCTCGACTGAGACAGAGCAAGAAATGGTAGCATCA
GTAGGCGGCGTCATCCTAGACGAGTCGGTGCTAATAGACAATTCCGGCAC
CGCCGCATTACGGCCGGAGGCTCTCTCGCTCCTTCGTAAGCTCCGCCATT
CCAATCTCCACCTGGTAACTCACTTTCGTCTTCTTCAAAAAGTTCATGTC
TTCCCTTTTCTTAATCTACAGTAAATTAATTATCTATTGATCTATGCAGG
CAATTTCTTATTCACCTGCTCTTTCCGATGATAAGGTTATCGGCACTTAT
TTTCCCCCTTCATTGCAATATAACTAAGGTTTCAGTTGCTCAATTTCTTT
TAGTGCTAGTTATAATGTTTTATGTTTATGTATAGGTTAGTCTGCTCAAA
AAGACGGCAATGCAATACTCTTTTGATTGCTTTGCATTGGATAGTTCATC
TACGGATGATGCCTTGAAGGTGGTAACTTTGGCTTGGGGTCATATTGAAG
GGACTATTTTGTATCTTTTTTCTAACCACAAGAAGGGTTCTTATAATCAA
ATCAGCAATTTGGGTTGGATTGTTATTGTCATGGGTGAGTATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTATATTG
TTTGCCTTCTAGCATATGCTTCTGGTTTTGGGAAAAGAATTTGATGAGTT
GCGGCTTCGTTAATCACGTCTCTAGTGCTGAAACTGGCTTATGATCACCT
TTCAGGTGCTGAAGTTGCTACTGAATTTGATAATTCAAACGTGCTTTGTA
TAAATAAACTAGAAGAATTGCTTGTGACCATTTGCCACTTGAATAGAAAG
GTTGGTGGGCATGACTCTTATTTAGCAAATCTATGCTTCAATTATTTACA
ACTGTAACTTTTATTTCGGGAAAATATGTCAAGGCAGTTACTTAGGTTAA
TAATTATATATGTAGAAGTATCATTTTCATAAATAAAAATGTCATGCATA
GATTTTTGTTTTTTGAAAAAAATATTAGAAAAAACTTATTGATATTCTGA
GGAGAATAAATATTAAATCTATGCTGGCAAACTAAAAAATGGAGACATTT
TTATTTTGCAAATTTCTCTGGAAATGGAACTCTGTTTCTTTGGTAATAAG
CCAAGATCTTGAATCCATAATCAATTAAATGAAAAGATACTTCAGTCTGG
AAATTCCTACTAGATGGAATGAAAACTTTGAACATCGATTGTGGCCTTGC
TTTCATTTCAAAGTTTCAATGCCTTAGAACTGGGAAATATACTTCATTTA
CAAAAAAAATTTGATACTGATGTTTTGGTTTTGTTGAATTTCAAACAGGC
AGTTGGTAACAATGTTGTGACTGTCGGCTATATCATGAAGCCTTCTCGTG
AAGAAGATTTTGCTAAGGTGAGCCCTTGAAACTGATGATGTTGGAGAAGA
AAAATGAAGGAACTTATGAAGCAAGGAAAGAGTATGACCTTATAGAAGGT
CTTAATTATGTATGGAAGTTGATATGGAACTATTATGTCCCTTGAAACTG
ATGTTAGATAAAGAAAAGAGAAGGAACTGATAAAGAAAGGGAAAAAGTAT
GAGCCACTGATGTTAGAATCTTACGCTTCTCGATTCGAATCTTACAATTC
GAATCTATTTTCCAACAAATCAATTTGATATATGGGTGAATCTTAAACGT
ATCTGAATCTTACGATTATTGATTTGAATCTTACAATTCTCGATTTGATT
TGATTCTACATCTTAACAATTCAAATCTAAAGGTACATGAATTGTGACTA
AATAAAAAAAAAATGATAATGAATAAGGTGAATCAATATAAATAGACCGA
ATTTTCACCCAATCCAATTAAATTTTTATAAAGAATTTGTTAGGACTTTT
ATTTTTAAAATTTAAGATTTATTCATTTTTGCTATAGAAAAGGTTTTAGC
TATTTTTCTTCCATCAACTATTCTTTTCCCTCTCTTTCTTCTGTCGTTTT
CCTTTCTCTTTTTAGTTAATTTACTTAACTAATTGTAGTTGTCAAGTTGG
GACAATTTATATTTATAATATTCTAATCTGATACGTTTTTTTACTATTTA
ATTATTGGATTAAATTTAAATGAGAGTTTCAGTATATGTATATTGATAAC
TGTTGTGTACAATTTCAAAATTCATAATTTATAACATAATACATATATAT
TATTCTATTATGAAGAATATTTCTAATTAGATAAATGACAATTCTATATT
TATTTAAATGTCATTATTGATATTTCTTTTACTTATTTTTAGAATATATA
TTATTTTTAATTGATTTTTGGAAGTCTTAACAAATCTTTCGATTCAATTC
TCGATTCTTAATTCATGAAATGAAGATTTCGATTCTCGATTCGAATCTCG
ATTTGACAACTATGGTATGAGCTCATAGAAGTTCTCTAATCATCTGCAGA
AGTCAATACCAAACTATGATCTCCCTGATTGTACCTCTTTGCTGCTATTG
GAAACTGACCAGTTATAGTTTTATAAACTAGAGTTATATGTGTTTGAGCT
GTTCCACTACTTTCATATTGCTCCTAGTGTAGTAAATTAATTGGTTCTAA
ATCTAACATAAATAGGCTGTATAGATTGTGGCTGATTGCACAAAAAATTC
AATATGAAACTATGGTATATCCTTGATTAAATTCCTGTTTGCCCCTGATA
AACCAATCCTTTCTAGTTTTAGAACCTAGAATTAAAAATGGCTAAGCTCT
TCATTGCTTCAGCTTTGAACTTTCTAATGTAGTAATTATGTGGTTCTAAA
ATGCAATTTAAAGTCTGGATTATATCTACAAGTCTGATGTTATTCTTTTT
TTTTTAATTTTTCATTGTTGCAGAGGGGTGCATTGCCCATCTCTCCTACT
CCAAATGGATTGATTTTTCTTCCCCTGACATTTGGACTCCCCCTACTATC
TCAATTAAAACATGTTGACATGGTTCTGCATAAAGCAACAGATGAAATAG
TCTCTGTTGAATTAAGTGATTCTGCTGAATCCTCAAGCAAAATTACATAC
ACCACAGGAATGCAGGAATTGCAAAGGTAAATTTTCAAATAATTTTTTAA
CAATGTCATTTGTTAACATGTGTTGTAAATCAACATGCTACTGTTTTTAT
GTTCTCATATATTGCTTCTTCCTGATATTGTCTGTCACTAGAACCTACAT
CATGATATTGCCTTCCAAGTCACAATCTTACTGACACCCACCACCTTTTT
GCTCGTCAAATAGTTATATGATTGTTATACAGGAATGTGAGCATTACCCA
GGTTGAATAACCATGCAGTCATGTCAAAAAGGAACTTTAGATTGATGTCA
TAATATTTGGAGTCTTTTCTTACAAGTCTTTATCCTTATACAGGTATTTG
GAAAGTCACTCTGATTTCTTTGTGATTGACCCAATTAATAAAATATACCC
TCTATTGGATCGGCTAAAAATCCAAGAAATTCTTCTTGGGCTGGAGGATA
TCAATGCAGGAGGCAACCATACAATCAGAGGACCACATTTTCTAAAGGTC
TTTCGGTTATATTTGTGTCTATTTTATTCCATAGGCTGAACATTCAATGG
ACAGAGTGTGAAGTGATTCACTTTACTGAATTTACAACTCATGTTCCCAC
AAAAAACTAGGTATGATGTATCATGGATCTATGTTACTGAAACTATAAAA
GCCCAAGTTGTTATTTGTTAATATTATTAATGCAGTAGTGGACACCAATT
TAGGTTGTCAATATCATTTCAAACAAAGAAACTTCATTTTTTTGAACTTG
TTGCTTCCAAAATTTTAAATGTGCTTGTAGATTTGGAAGAACTTGCATTA
AGTTAAGGCATGACAATGAACTGATAACACAAAGTCTTTGGAACTGTAAT
ATTTTCACAGCAAGTAAGACAGATATTGACATGATTTTCTCATTGACAAT
TCAAGCCTTATGGTAGATCATTACAATAGATGAGCACTATCATATAATAA
TGTTGGGTGAGATGTATAAAGATACTACATATTCTTCTCAGTAGTTTGCT
CAAATCTGAATCAGGTTCAGAGTTTTCTTGTCCAGAGATGTTTATGAGAC
TTAGCATAGCCAGAGGATCCTTGAATTTAAAAAAAAAAAAATTAGTAACA
AGAATAGTGTTGTTTTCAGTCTTTTAATTGTCATGTTAGGCTGTTAACAA
TCAATATAGTGATATTTAGACTTATTGTTTTCAGTGCCTTTTTCATTGTT
GTTTGCAATTTATGGAATTAACCAATGGTCTCTATTTATGTAGGACTTTA
GGTAACTATAGAACAGAAGTAGTGGTCTGTATTGGAATGAACAAGAGTAA
GAAACTTGGAAACCAACCTTTGATACTTCTTTTTAGAATGATAATTAAGT
TCAGGCATAATGGTTGCTCCTAGCTTTCACCATTTTCTCCTTATGTTTAG
TTACATCAGGAATCCAATATGCAGGTTAATGATTTTAATGAGCCTGATTT
AATACTGGGGCTGTCAGAAGCTAAACTATCTCTCCCAAGTATAGTCAAAC
CTCAAATTGCCTGTGGAGTAGCTGATGCTCATAGTATGGTAAGAAATTGT
TTCTCTGCAAAAGAAAAGACTATGGGAGCCAAATTCAATCAGGGCTTCTT
GTTATCAAGTGCTATAATTTTTTTGGAGAGTTTCTTGTATTCCTTGTTTT
GTTTCACTTGTGAACTGATTTCTTCATAATAAAATTCGTAACTTGTTTTT
TGTTATTCAAGTTCTGACAATTGACATGTTTTGGATTATTTGTATTTCAA
CGCAAGATAGCTATAATCATCTGTTCCTTATCCCTACTTTTGTCTATTTA
AAGTGATAAATCTGCACATTGCAGGCAATTGTCTTCAGAGTTGAAGATTT
TAAGGATTTAAGAGTTCCTCTTCCAGCTGTTGTTCAGGTAAGCACAAGAG
TTCAAACCTTTGATGACCTCTGTGCTGTTGTTTTAGCCTTCAGCAATATA
ATTAATGTTTCAATCTTTTCTGAAATTTACATTACACAATTGATTCCCTT
AGATAAGAAGTATTTAGAGGCTAGTCTTTGCATTTGTTGGTTTATGACAT
TTACATGTCTTGACAATGATCTTTTGAATGCATTTGTTCCTCTTATTTTA
ATTCCTAAGTGTGATGTGTCTGTATTTAGATTCAAAATTGGAAATAATTG
GCATTTTCAGGAATATGTGAACCATTCATCCACTTTGTTCAAGATTTATG
TCCTGGGTGAAAAAGTTTTCTATGCCGTTAAGAAGTCTACACCAAATGTT
GATATCTTGGTGCAATTATCTGAAATGAATGGTCTTGGACCGTTGCTCTT
TGATAGGTAGCATGTTTTCCTTCTTCAGTTTTCCTGGTTATTTGGTCAAA
CTATGATTAAGGTTACATGTCTAATTTGATAATATTATGCTGAATGGCCA
CAGCTTAAAATCTCTTCCTACTAGCAGTGAGGATCCCTCAGCGGACAGTA
ATCATTTTGATCTTGCTCTAGTCACTGATGCCGCAAATTGGCTTGCAAGA
AAACTTGATCTTACCATCTTTGGTTTTGATGTTGTTGTAAGTTGTGCTTT
CTCAACTACATCTCTTGTGCATTCTGCATCTGTTTAACAGATAGAAATTT
TTAAGGCTTGACTAATTTGAATTAGTTTCGTTTAATAATAGAGTAGTGAT
TAATTATCTTGTGAACATATTTCATTGGGGAAAAGGGTTACAAATATTTC
ATTTGATCCTCACCATTCTAAGTATTTTTCTTTCTTCTAAATGATCCATG
TGCCCATTATCCTTGCTGCCTTTAATTGTTCATTAATTTTTTGGGCATTA
ATGGGCATGCGCTTGACTTCAGTTTGAATTTGTTCTATGATTGACACATT
TGAACTTTTGAATATCAATTTTGAACTAGCCTATGCTGTTAAACAACCTT
TAAATTTCCATATCATAACTCAATGGATGGTTTCATTGAATTTTTTTAAG
CAAATATTGTTATCTTTAATTGTATGTTAATTTGTGGCTTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCGATAATTGGTTGATTAGAATTTCCT
GATTTGTATCTTACATTTTATTGAGTAAGCATAATGATAACTTTCTCCTA
TTTTGATAGACCTGACCATGAGCAGGTTCAAATCATAAACCAAACTGGAA
CCTGCAGGGTCAATGGTTCCACTTCTTGAACTGAACTAGGACCACATACT
AGGCCTGTAGCACTAGAACCATTTGGTTTTCAATTTGATTTTATTTATTT
ATGTTGAAATTGCATGTATCAACTAGAAAGCGCCTTGTGGCATGATCCTG
TGAGCCACATGGTGCCTCTTAGTCCCTCCCTCCCCCTATATTAGTGCTGG
CGATATCCATTTGTCCAATTGTGGGTTGTTGGCTGTAATTTTTCAAAAAA
AAAAGGTCTTTTTTTTAATTTGAAATCCAAAAATACCCTTACCAATAAAA
AATAACACAGCTAGATTTTTGGATATCTTGAGCAAGCTAACTTTTTCCTA
TGAATACCCTGTGACCCATAACAAAAATTCATATTTACCCAATTCTTCAA
TTCTAGAGATGGCTATGGAGCAAGTTCGGCTTGGAATTGGCATAGATTTT
TCTCAGTTCGAAACAGTTCTGGTTGCTAGTTTCAGACTGCTTCCAGTTTC
AAAGCGGCTGGGATTATGGTATTTTTATGGTTATGGTTTTGGTTAGGCTT
AGGTTCAACATTGTTTGTCCTGATTTCAGTTTCTGATATGAATTTGGAGT
CAACACAAATAAATAAAAATTTGTAATACAAATCGAAAATAATAAAGTAC
CAAAAGAAGTAAATGAGCTAATGCTATGTTTGGCTACGAACATTTGAAAT
TGAGGATTTAGCTATAGTTTTACTATAAATTATTAATAAACTTTGGATTC
AAAATCTGCCCTTTTACTTACTAAGAGCTTTTTAGAGCAGATTTAAAATA
ACACTATCTTGTAAATCATTTCAAATTCACATTTAAATAAGACACTCTCC
TTATTTATAATTCTAACTTATATTATCACTCTAATCAATTGAATAAAACA
TATACTTTACTAAATCTAAATCTCATATTTCAAATACCTCCATCCAGACA
CAAGGTAAACAAATAAAAAATAACATTAAATATTATTGATTTATAACTCA
AATATTTAAGGAGTGACAATGATAATTGAAGAAAAACAAATTTATAAATG
GTTTATTATTGATTAACATAAAAAAATTAAATTATCAAATATAAGGGTTT
GATAACCATAACCATAAAAAAACCTTTGCCTAACCACAGTGAACCTTTGA
CTAACTGCAACCACAATCACTTTAGAGCCACACTAGAATAGTCAATTGAA
CTAAAACCATTTTGAATTGGAAAAATCCAGGCCGAACCACTTGTTCCAAA
CTGGAATTAGCCGATGGCCATGTCTAGAAGAAGATACCAAACCAAGCTAT
TAGATCACAGTTGTGGTCATGTTAATGAAACAGGCCTATAATTTTCATAA
CTATGCAAGTTTTTTTGAAAAAAATTCTTAAGTTAATGAAATGAAAGATA
TTTAAAGATATAACTAAAACTAAGATGCACAACTTAATAAACATCAAATA
AAAACTTTAAATCCATCATAATTAACATTATTAGCATTATTCAATTTAAA
ACTAAAATAACTAGGTAGAACTAACCTTATTACCTATAGATTAGGCAAAC
TAATACTTCATACTATAAGACTGTAAACAACCCATCATACGTCACTTTTA
TGTCAGATGGGCCAAAACCAGTAATAAATACAAATAACTCCCCCTATGTA
GAATATTTAAATGTAGAAGTGTAGATTTGCTCTTCTCCACTTTAAATGAA
CCTTGTCTATTTGATGATGGTAGCTCAAGAAATCAAGATTTTGTAAAGAA
GTATCATTCGCTCGAGAAATTTGAAACTGCTGGAGAAAGTATAGAACCAC
AAATGAACTCTACTGGAAGGGAAAAAAGAAAAGCTTCCCCTTATCTGCCC
AAGTGATTAACGGCTGTTACACTGGTTAAGTAATGGTAGTAATGGCCATT
ACACCCTGCATTTTATAATTTACATTGTATTATATATAGAGGCTGTTAAG
TGAAGCTATTAAGGGCTGTTTTAGCAGTGAAGTAATGGTAGTAACAACTA
TTACACTTGGCATTTTGTAGTTTGTCTTATATAATGGTAGCAATATATCA
GTTGTTTTCTCAAACCATGATTGTTATGTTAAAAGAGCTGTATCTGAACT
TTGGCAACAGTTTAGTACCCATATTTTATATTTTAATTCATTGGTTCTAA
AACTACTTCCATCTTAACAAGCATAGTTGTAGCTGGATTGCAGTACAATC
TAATCAAACATTCAACAGTTAAGCGTTGTAAGTGAACTAAGCACTGGTTG
TATCCTTGTGTCTCTGGTGGTGATGCTAAGTGTTGAATTGATAACCATTT
GATGGTATACATGATTCATGAAGATCCTTTGTTTTGGAAATTGTGGTGGA
TAGCGTTGTATCCTTGTGTCTCTGGTGGTGATGCTAAGAGTTGAACTGAT
AACCATTTGATGGTATACATGATTGAAGAAGATCCTTTGTTTTGGAAATT
GTGGTGGATAGCATGCATTAATCTACATCCTCTAATGATTCTGTTAATTT
TCAGGTCCAGGAAGGCACAGGTGACCATGTCATTGTGGATGTAAATTATC
TCCCATCATTCAAGGAAGTGCCAAATGATATTTGCATTCCTGCCTTCTGG
GATGCTATTAAAATGAAGTTTGAATCAAGACAGGGGAAATAGCAATGCAT
GCGTGGAGGTTCTGGACTGAACTTAAATCATATTGACTGAAACAAGAACT
GGAAAAGTTCCAAAATTTGATGATCTTAAAAACTTTTCTTGAGAGGACAA
GTGAGAAATAAAATCTTTTATATCCAAAAGGAACACACACTGGAGCAGTT
CAAGGAATGGAGAGTATCTGGATTCTGTTATAATGCCTGTTAGTAATCTT
TCTGCCATAGTTTATGTTACGACTCGAGAATCAAGATTCTCTGAGGCTTG
AAAAATAATATCCTTTTCCAGTCTCCATTTATTTTTTATTTTTCAGAAAA
TAACTTGCATGTGAAAA
back to top

mRNA from alignment at Chromosome01:1741571..1750787+

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G009900.1.v6.1 ID=Manes.01G009900.1.v6.1|Name=Manes.01G009900.1|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=9217bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1741571..1750787+ (Manihot esculenta)
ACAGCTTCTGCTCTCTTTTCTTCCTGATTCTTTTGTTGAGCGCACAATCG CCAAAAAGAGAAACAGCTCGACTGAGACAGAGCAAGAAATGGTAGCATCA GTAGGCGGCGTCATCCTAGACGAGTCGGTGCTAATAGACAATTCCGGCAC CGCCGCATTACGGCCGGAGGCTCTCTCGCTCCTTCGTAAGCTCCGCCATT CCAATCTCCACCTGGTAACTCACTTTCGTCTTCTTCAAAAAGTTCATGTC TTCCCTTTTCTTAATCTACAGTAAATTAATTATCTATTGATCTATGCAGG CAATTTCTTATTCACCTGCTCTTTCCGATGATAAGGTTATCGGCACTTAT TTTCCCCCTTCATTGCAATATAACTAAGGTTTCAGTTGCTCAATTTCTTT TAGTGCTAGTTATAATGTTTTATGTTTATGTATAGGTTAGTCTGCTCAAA AAGACGGCAATGCAATACTCTTTTGATTGCTTTGCATTGGATAGTTCATC TACGGATGATGCCTTGAAGGTGGTAACTTTGGCTTGGGGTCATATTGAAG GGACTATTTTGTATCTTTTTTCTAACCACAAGAAGGGTTCTTATAATCAA ATCAGCAATTTGGGTTGGATTGTTATTGTCATGGGTGAGTATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTATATTG TTTGCCTTCTAGCATATGCTTCTGGTTTTGGGAAAAGAATTTGATGAGTT GCGGCTTCGTTAATCACGTCTCTAGTGCTGAAACTGGCTTATGATCACCT TTCAGGTGCTGAAGTTGCTACTGAATTTGATAATTCAAACGTGCTTTGTA TAAATAAACTAGAAGAATTGCTTGTGACCATTTGCCACTTGAATAGAAAG GTTGGTGGGCATGACTCTTATTTAGCAAATCTATGCTTCAATTATTTACA ACTGTAACTTTTATTTCGGGAAAATATGTCAAGGCAGTTACTTAGGTTAA TAATTATATATGTAGAAGTATCATTTTCATAAATAAAAATGTCATGCATA GATTTTTGTTTTTTGAAAAAAATATTAGAAAAAACTTATTGATATTCTGA GGAGAATAAATATTAAATCTATGCTGGCAAACTAAAAAATGGAGACATTT TTATTTTGCAAATTTCTCTGGAAATGGAACTCTGTTTCTTTGGTAATAAG CCAAGATCTTGAATCCATAATCAATTAAATGAAAAGATACTTCAGTCTGG AAATTCCTACTAGATGGAATGAAAACTTTGAACATCGATTGTGGCCTTGC TTTCATTTCAAAGTTTCAATGCCTTAGAACTGGGAAATATACTTCATTTA CAAAAAAAATTTGATACTGATGTTTTGGTTTTGTTGAATTTCAAACAGGC AGTTGGTAACAATGTTGTGACTGTCGGCTATATCATGAAGCCTTCTCGTG AAGAAGATTTTGCTAAGGTGAGCCCTTGAAACTGATGATGTTGGAGAAGA AAAATGAAGGAACTTATGAAGCAAGGAAAGAGTATGACCTTATAGAAGGT CTTAATTATGTATGGAAGTTGATATGGAACTATTATGTCCCTTGAAACTG ATGTTAGATAAAGAAAAGAGAAGGAACTGATAAAGAAAGGGAAAAAGTAT GAGCCACTGATGTTAGAATCTTACGCTTCTCGATTCGAATCTTACAATTC GAATCTATTTTCCAACAAATCAATTTGATATATGGGTGAATCTTAAACGT ATCTGAATCTTACGATTATTGATTTGAATCTTACAATTCTCGATTTGATT TGATTCTACATCTTAACAATTCAAATCTAAAGGTACATGAATTGTGACTA AATAAAAAAAAAATGATAATGAATAAGGTGAATCAATATAAATAGACCGA ATTTTCACCCAATCCAATTAAATTTTTATAAAGAATTTGTTAGGACTTTT ATTTTTAAAATTTAAGATTTATTCATTTTTGCTATAGAAAAGGTTTTAGC TATTTTTCTTCCATCAACTATTCTTTTCCCTCTCTTTCTTCTGTCGTTTT CCTTTCTCTTTTTAGTTAATTTACTTAACTAATTGTAGTTGTCAAGTTGG GACAATTTATATTTATAATATTCTAATCTGATACGTTTTTTTACTATTTA ATTATTGGATTAAATTTAAATGAGAGTTTCAGTATATGTATATTGATAAC TGTTGTGTACAATTTCAAAATTCATAATTTATAACATAATACATATATAT TATTCTATTATGAAGAATATTTCTAATTAGATAAATGACAATTCTATATT TATTTAAATGTCATTATTGATATTTCTTTTACTTATTTTTAGAATATATA TTATTTTTAATTGATTTTTGGAAGTCTTAACAAATCTTTCGATTCAATTC TCGATTCTTAATTCATGAAATGAAGATTTCGATTCTCGATTCGAATCTCG ATTTGACAACTATGGTATGAGCTCATAGAAGTTCTCTAATCATCTGCAGA AGTCAATACCAAACTATGATCTCCCTGATTGTACCTCTTTGCTGCTATTG GAAACTGACCAGTTATAGTTTTATAAACTAGAGTTATATGTGTTTGAGCT GTTCCACTACTTTCATATTGCTCCTAGTGTAGTAAATTAATTGGTTCTAA ATCTAACATAAATAGGCTGTATAGATTGTGGCTGATTGCACAAAAAATTC AATATGAAACTATGGTATATCCTTGATTAAATTCCTGTTTGCCCCTGATA AACCAATCCTTTCTAGTTTTAGAACCTAGAATTAAAAATGGCTAAGCTCT TCATTGCTTCAGCTTTGAACTTTCTAATGTAGTAATTATGTGGTTCTAAA ATGCAATTTAAAGTCTGGATTATATCTACAAGTCTGATGTTATTCTTTTT TTTTTAATTTTTCATTGTTGCAGAGGGGTGCATTGCCCATCTCTCCTACT CCAAATGGATTGATTTTTCTTCCCCTGACATTTGGACTCCCCCTACTATC TCAATTAAAACATGTTGACATGGTTCTGCATAAAGCAACAGATGAAATAG TCTCTGTTGAATTAAGTGATTCTGCTGAATCCTCAAGCAAAATTACATAC ACCACAGGAATGCAGGAATTGCAAAGGTAAATTTTCAAATAATTTTTTAA CAATGTCATTTGTTAACATGTGTTGTAAATCAACATGCTACTGTTTTTAT GTTCTCATATATTGCTTCTTCCTGATATTGTCTGTCACTAGAACCTACAT CATGATATTGCCTTCCAAGTCACAATCTTACTGACACCCACCACCTTTTT GCTCGTCAAATAGTTATATGATTGTTATACAGGAATGTGAGCATTACCCA GGTTGAATAACCATGCAGTCATGTCAAAAAGGAACTTTAGATTGATGTCA TAATATTTGGAGTCTTTTCTTACAAGTCTTTATCCTTATACAGGTATTTG GAAAGTCACTCTGATTTCTTTGTGATTGACCCAATTAATAAAATATACCC TCTATTGGATCGGCTAAAAATCCAAGAAATTCTTCTTGGGCTGGAGGATA TCAATGCAGGAGGCAACCATACAATCAGAGGACCACATTTTCTAAAGGTC TTTCGGTTATATTTGTGTCTATTTTATTCCATAGGCTGAACATTCAATGG ACAGAGTGTGAAGTGATTCACTTTACTGAATTTACAACTCATGTTCCCAC AAAAAACTAGGTATGATGTATCATGGATCTATGTTACTGAAACTATAAAA GCCCAAGTTGTTATTTGTTAATATTATTAATGCAGTAGTGGACACCAATT TAGGTTGTCAATATCATTTCAAACAAAGAAACTTCATTTTTTTGAACTTG TTGCTTCCAAAATTTTAAATGTGCTTGTAGATTTGGAAGAACTTGCATTA AGTTAAGGCATGACAATGAACTGATAACACAAAGTCTTTGGAACTGTAAT ATTTTCACAGCAAGTAAGACAGATATTGACATGATTTTCTCATTGACAAT TCAAGCCTTATGGTAGATCATTACAATAGATGAGCACTATCATATAATAA TGTTGGGTGAGATGTATAAAGATACTACATATTCTTCTCAGTAGTTTGCT CAAATCTGAATCAGGTTCAGAGTTTTCTTGTCCAGAGATGTTTATGAGAC TTAGCATAGCCAGAGGATCCTTGAATTTAAAAAAAAAAAAATTAGTAACA AGAATAGTGTTGTTTTCAGTCTTTTAATTGTCATGTTAGGCTGTTAACAA TCAATATAGTGATATTTAGACTTATTGTTTTCAGTGCCTTTTTCATTGTT GTTTGCAATTTATGGAATTAACCAATGGTCTCTATTTATGTAGGACTTTA GGTAACTATAGAACAGAAGTAGTGGTCTGTATTGGAATGAACAAGAGTAA GAAACTTGGAAACCAACCTTTGATACTTCTTTTTAGAATGATAATTAAGT TCAGGCATAATGGTTGCTCCTAGCTTTCACCATTTTCTCCTTATGTTTAG TTACATCAGGAATCCAATATGCAGGTTAATGATTTTAATGAGCCTGATTT AATACTGGGGCTGTCAGAAGCTAAACTATCTCTCCCAAGTATAGTCAAAC CTCAAATTGCCTGTGGAGTAGCTGATGCTCATAGTATGGTAAGAAATTGT TTCTCTGCAAAAGAAAAGACTATGGGAGCCAAATTCAATCAGGGCTTCTT GTTATCAAGTGCTATAATTTTTTTGGAGAGTTTCTTGTATTCCTTGTTTT GTTTCACTTGTGAACTGATTTCTTCATAATAAAATTCGTAACTTGTTTTT TGTTATTCAAGTTCTGACAATTGACATGTTTTGGATTATTTGTATTTCAA CGCAAGATAGCTATAATCATCTGTTCCTTATCCCTACTTTTGTCTATTTA AAGTGATAAATCTGCACATTGCAGGCAATTGTCTTCAGAGTTGAAGATTT TAAGGATTTAAGAGTTCCTCTTCCAGCTGTTGTTCAGGTAAGCACAAGAG TTCAAACCTTTGATGACCTCTGTGCTGTTGTTTTAGCCTTCAGCAATATA ATTAATGTTTCAATCTTTTCTGAAATTTACATTACACAATTGATTCCCTT AGATAAGAAGTATTTAGAGGCTAGTCTTTGCATTTGTTGGTTTATGACAT TTACATGTCTTGACAATGATCTTTTGAATGCATTTGTTCCTCTTATTTTA ATTCCTAAGTGTGATGTGTCTGTATTTAGATTCAAAATTGGAAATAATTG GCATTTTCAGGAATATGTGAACCATTCATCCACTTTGTTCAAGATTTATG TCCTGGGTGAAAAAGTTTTCTATGCCGTTAAGAAGTCTACACCAAATGTT GATATCTTGGTGCAATTATCTGAAATGAATGGTCTTGGACCGTTGCTCTT TGATAGGTAGCATGTTTTCCTTCTTCAGTTTTCCTGGTTATTTGGTCAAA CTATGATTAAGGTTACATGTCTAATTTGATAATATTATGCTGAATGGCCA CAGCTTAAAATCTCTTCCTACTAGCAGTGAGGATCCCTCAGCGGACAGTA ATCATTTTGATCTTGCTCTAGTCACTGATGCCGCAAATTGGCTTGCAAGA AAACTTGATCTTACCATCTTTGGTTTTGATGTTGTTGTAAGTTGTGCTTT CTCAACTACATCTCTTGTGCATTCTGCATCTGTTTAACAGATAGAAATTT TTAAGGCTTGACTAATTTGAATTAGTTTCGTTTAATAATAGAGTAGTGAT TAATTATCTTGTGAACATATTTCATTGGGGAAAAGGGTTACAAATATTTC ATTTGATCCTCACCATTCTAAGTATTTTTCTTTCTTCTAAATGATCCATG TGCCCATTATCCTTGCTGCCTTTAATTGTTCATTAATTTTTTGGGCATTA ATGGGCATGCGCTTGACTTCAGTTTGAATTTGTTCTATGATTGACACATT TGAACTTTTGAATATCAATTTTGAACTAGCCTATGCTGTTAAACAACCTT TAAATTTCCATATCATAACTCAATGGATGGTTTCATTGAATTTTTTTAAG CAAATATTGTTATCTTTAATTGTATGTTAATTTGTGGCTTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCGATAATTGGTTGATTAGAATTTCCT GATTTGTATCTTACATTTTATTGAGTAAGCATAATGATAACTTTCTCCTA TTTTGATAGACCTGACCATGAGCAGGTTCAAATCATAAACCAAACTGGAA CCTGCAGGGTCAATGGTTCCACTTCTTGAACTGAACTAGGACCACATACT AGGCCTGTAGCACTAGAACCATTTGGTTTTCAATTTGATTTTATTTATTT ATGTTGAAATTGCATGTATCAACTAGAAAGCGCCTTGTGGCATGATCCTG TGAGCCACATGGTGCCTCTTAGTCCCTCCCTCCCCCTATATTAGTGCTGG CGATATCCATTTGTCCAATTGTGGGTTGTTGGCTGTAATTTTTCAAAAAA AAAAGGTCTTTTTTTTAATTTGAAATCCAAAAATACCCTTACCAATAAAA AATAACACAGCTAGATTTTTGGATATCTTGAGCAAGCTAACTTTTTCCTA TGAATACCCTGTGACCCATAACAAAAATTCATATTTACCCAATTCTTCAA TTCTAGAGATGGCTATGGAGCAAGTTCGGCTTGGAATTGGCATAGATTTT TCTCAGTTCGAAACAGTTCTGGTTGCTAGTTTCAGACTGCTTCCAGTTTC AAAGCGGCTGGGATTATGGTATTTTTATGGTTATGGTTTTGGTTAGGCTT AGGTTCAACATTGTTTGTCCTGATTTCAGTTTCTGATATGAATTTGGAGT CAACACAAATAAATAAAAATTTGTAATACAAATCGAAAATAATAAAGTAC CAAAAGAAGTAAATGAGCTAATGCTATGTTTGGCTACGAACATTTGAAAT TGAGGATTTAGCTATAGTTTTACTATAAATTATTAATAAACTTTGGATTC AAAATCTGCCCTTTTACTTACTAAGAGCTTTTTAGAGCAGATTTAAAATA ACACTATCTTGTAAATCATTTCAAATTCACATTTAAATAAGACACTCTCC TTATTTATAATTCTAACTTATATTATCACTCTAATCAATTGAATAAAACA TATACTTTACTAAATCTAAATCTCATATTTCAAATACCTCCATCCAGACA CAAGGTAAACAAATAAAAAATAACATTAAATATTATTGATTTATAACTCA AATATTTAAGGAGTGACAATGATAATTGAAGAAAAACAAATTTATAAATG GTTTATTATTGATTAACATAAAAAAATTAAATTATCAAATATAAGGGTTT GATAACCATAACCATAAAAAAACCTTTGCCTAACCACAGTGAACCTTTGA CTAACTGCAACCACAATCACTTTAGAGCCACACTAGAATAGTCAATTGAA CTAAAACCATTTTGAATTGGAAAAATCCAGGCCGAACCACTTGTTCCAAA CTGGAATTAGCCGATGGCCATGTCTAGAAGAAGATACCAAACCAAGCTAT TAGATCACAGTTGTGGTCATGTTAATGAAACAGGCCTATAATTTTCATAA CTATGCAAGTTTTTTTGAAAAAAATTCTTAAGTTAATGAAATGAAAGATA TTTAAAGATATAACTAAAACTAAGATGCACAACTTAATAAACATCAAATA AAAACTTTAAATCCATCATAATTAACATTATTAGCATTATTCAATTTAAA ACTAAAATAACTAGGTAGAACTAACCTTATTACCTATAGATTAGGCAAAC TAATACTTCATACTATAAGACTGTAAACAACCCATCATACGTCACTTTTA TGTCAGATGGGCCAAAACCAGTAATAAATACAAATAACTCCCCCTATGTA GAATATTTAAATGTAGAAGTGTAGATTTGCTCTTCTCCACTTTAAATGAA CCTTGTCTATTTGATGATGGTAGCTCAAGAAATCAAGATTTTGTAAAGAA GTATCATTCGCTCGAGAAATTTGAAACTGCTGGAGAAAGTATAGAACCAC AAATGAACTCTACTGGAAGGGAAAAAAGAAAAGCTTCCCCTTATCTGCCC AAGTGATTAACGGCTGTTACACTGGTTAAGTAATGGTAGTAATGGCCATT ACACCCTGCATTTTATAATTTACATTGTATTATATATAGAGGCTGTTAAG TGAAGCTATTAAGGGCTGTTTTAGCAGTGAAGTAATGGTAGTAACAACTA TTACACTTGGCATTTTGTAGTTTGTCTTATATAATGGTAGCAATATATCA GTTGTTTTCTCAAACCATGATTGTTATGTTAAAAGAGCTGTATCTGAACT TTGGCAACAGTTTAGTACCCATATTTTATATTTTAATTCATTGGTTCTAA AACTACTTCCATCTTAACAAGCATAGTTGTAGCTGGATTGCAGTACAATC TAATCAAACATTCAACAGTTAAGCGTTGTAAGTGAACTAAGCACTGGTTG TATCCTTGTGTCTCTGGTGGTGATGCTAAGTGTTGAATTGATAACCATTT GATGGTATACATGATTCATGAAGATCCTTTGTTTTGGAAATTGTGGTGGA TAGCGTTGTATCCTTGTGTCTCTGGTGGTGATGCTAAGAGTTGAACTGAT AACCATTTGATGGTATACATGATTGAAGAAGATCCTTTGTTTTGGAAATT GTGGTGGATAGCATGCATTAATCTACATCCTCTAATGATTCTGTTAATTT TCAGGTCCAGGAAGGCACAGGTGACCATGTCATTGTGGATGTAAATTATC TCCCATCATTCAAGGAAGTGCCAAATGATATTTGCATTCCTGCCTTCTGG GATGCTATTAAAATGAAGTTTGAATCAAGACAGGGGAAATAGCAATGCAT GCGTGGAGGTTCTGGACTGAACTTAAATCATATTGACTGAAACAAGAACT GGAAAAGTTCCAAAATTTGATGATCTTAAAAACTTTTCTTGAGAGGACAA GTGAGAAATAAAATCTTTTATATCCAAAAGGAACACACACTGGAGCAGTT CAAGGAATGGAGAGTATCTGGATTCTGTTATAATGCCTGTTAGTAATCTT TCTGCCATAGTTTATGTTACGACTCGAGAATCAAGATTCTCTGAGGCTTG AAAAATAATATCCTTTTCCAGTCTCCATTTATTTTTTATTTTTCAGAAAA TAACTTGCATGTGAAAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at Chromosome01:1741571..1750787+

>Manes.01G009900.1.v6.1 ID=Manes.01G009900.1.v6.1|Name=Manes.01G009900.1|organism=Manihot esculenta|type=CDS|length=1476bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1741571..1750787+ (Manihot esculenta)
ATGGTAGCATCAGTAGGCGGCGTCATCCTAGACGAGTCGGTGCTAATAGA
CAATTCCGGCACCGCCGCATTACGGCCGGAGGCTCTCTCGCTCCTTCGTA
AGCTCCGCCATTCCAATCTCCACCTGGCAATTTCTTATTCACCTGCTCTT
TCCGATGATAAGGTTAGTCTGCTCAAAAAGACGGCAATGCAATACTCTTT
TGATTGCTTTGCATTGGATAGTTCATCTACGGATGATGCCTTGAAGGTGG
TAACTTTGGCTTGGGGTCATATTGAAGGGACTATTTTGTATCTTTTTTCT
AACCACAAGAAGGGTTCTTATAATCAAATCAGCAATTTGGGTTGGATTGT
TATTGTCATGGGTGCTGAAGTTGCTACTGAATTTGATAATTCAAACGTGC
TTTGTATAAATAAACTAGAAGAATTGCTTGTGACCATTTGCCACTTGAAT
AGAAAGGCAGTTGGTAACAATGTTGTGACTGTCGGCTATATCATGAAGCC
TTCTCGTGAAGAAGATTTTGCTAAGAGGGGTGCATTGCCCATCTCTCCTA
CTCCAAATGGATTGATTTTTCTTCCCCTGACATTTGGACTCCCCCTACTA
TCTCAATTAAAACATGTTGACATGGTTCTGCATAAAGCAACAGATGAAAT
AGTCTCTGTTGAATTAAGTGATTCTGCTGAATCCTCAAGCAAAATTACAT
ACACCACAGGAATGCAGGAATTGCAAAGGTATTTGGAAAGTCACTCTGAT
TTCTTTGTGATTGACCCAATTAATAAAATATACCCTCTATTGGATCGGCT
AAAAATCCAAGAAATTCTTCTTGGGCTGGAGGATATCAATGCAGGAGGCA
ACCATACAATCAGAGGACCACATTTTCTAAAGGTTAATGATTTTAATGAG
CCTGATTTAATACTGGGGCTGTCAGAAGCTAAACTATCTCTCCCAAGTAT
AGTCAAACCTCAAATTGCCTGTGGAGTAGCTGATGCTCATAGTATGGCAA
TTGTCTTCAGAGTTGAAGATTTTAAGGATTTAAGAGTTCCTCTTCCAGCT
GTTGTTCAGGAATATGTGAACCATTCATCCACTTTGTTCAAGATTTATGT
CCTGGGTGAAAAAGTTTTCTATGCCGTTAAGAAGTCTACACCAAATGTTG
ATATCTTGGTGCAATTATCTGAAATGAATGGTCTTGGACCGTTGCTCTTT
GATAGCTTAAAATCTCTTCCTACTAGCAGTGAGGATCCCTCAGCGGACAG
TAATCATTTTGATCTTGCTCTAGTCACTGATGCCGCAAATTGGCTTGCAA
GAAAACTTGATCTTACCATCTTTGGTTTTGATGTTGTTGTCCAGGAAGGC
ACAGGTGACCATGTCATTGTGGATGTAAATTATCTCCCATCATTCAAGGA
AGTGCCAAATGATATTTGCATTCCTGCCTTCTGGGATGCTATTAAAATGA
AGTTTGAATCAAGACAGGGGAAATAG
back to top