Manes.01G008900.2.v6.1 (mRNA)

Overview


Name	Manes.01G008900.2
Unique Name	Manes.01G008900.2.v6.1
Type	mRNA
Organism	Manihot esculenta (Cassava)
Sequence length	12044

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
Chromosome01	chromosome	Chromosome01:1534795..1546838 -

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)	2015-07-22

Properties


Property Name	Value
Pacid	32358641
Longest	0

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Manes.01G008900	Manes.01G008900.v6.1	Manihot esculenta	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Manes.01G008900.2	Manes.01G008900.2.v6.1-protein	Manihot esculenta	polypeptide

The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Manes.01G008900.2.v6.1.three_prime_UTR.2	Manes.01G008900.2.v6.1.three_prime_UTR.2	Manihot esculenta	three_prime_UTR
Manes.01G008900.2.v6.1.three_prime_UTR.1	Manes.01G008900.2.v6.1.three_prime_UTR.1	Manihot esculenta	three_prime_UTR

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.11	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.11	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.10	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.10	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.9	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.9	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.8	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.8	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.7	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.7	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.6	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.6	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.5	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.5	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.4	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.4	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.3	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.3	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.2	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.2	Manihot esculenta	CDS
Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.1	Manes.01G008900.2.v6.1.CDS.1	Manihot esculenta	CDS

The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Manes.01G008900.2.v6.1.five_prime_UTR.2	Manes.01G008900.2.v6.1.five_prime_UTR.2	Manihot esculenta	five_prime_UTR
Manes.01G008900.2.v6.1.five_prime_UTR.1	Manes.01G008900.2.v6.1.five_prime_UTR.1	Manihot esculenta	five_prime_UTR

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
mRNA from alignment at Chromosome01:1534795..1546838-
coding sequnece from alignment at Chromosome01:1534795..1546838-

mRNA sequence

>Manes.01G008900.2.v6.1 ID=Manes.01G008900.2.v6.1|Name=Manes.01G008900.2|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=12044bp
GCAAATAAAACACAATCACACCTGGTAATGGTAATTCAAATTTAAGAACA
TTCTGCTTCTACTGCATAGTACATACCATTAGTGAGCCAGAAAAAACCCT
CCTAACCTATGGAAATGAGGTCCAACAAATGGGAGAAAAAATACCAAACA
TATTATTTGTTACAGTCTGGCTTTGGCTATAACTTAAATCCCATCCTCAT
ATTTTGAAAATATGTTCTTTCGTTCAGTTTTGAAAGTTTAATTCAAAACT
GAACGACTATTTCAACAGCCCAAATTATCTCATCTCCTCCTAGCACAGTC
GCTTCTAGCGGAGCCCCCATCAAACCACTCTAATAAACCTATCAAAACCT
ATCTTTCTTTTTTTTTTTAAATAAGACATATCAGTTCCCCACTTGATTTC
GACTTCTGAGCATACAATTGCGATGATACTTCAAAGTATTCTTGCAAATG
GCACAATCAATATGAAACATAGGATATGGTACTACTGACCATTGTTAGAA
CACTGGATCAACTTGTTGGACAAGTTAACCTACTTGCTGTATTTCCATCA
GCCTCCAAAGTCTGACCTGCCGCGAGCAGTCTAATTTGAAGAGCGGCTCC
TCCAGCATACTGTTTTCTCCGACAGCTACAGTTTAAAATTCCTTATTTTA
TCAAGACAAAAAATGCATATGATATTTTTGTTTACAACATTCTTGCAGAC
CAAGTGCAAGAACCAATCTTGTCTTTTGTGAGCACAGAACAGGATACTAG
AATCAAATATTACAACATTTTCCAATGACGAGTTCGTTGTCACCTGTAAA
GAAATAGAATGAAATGTATTACAATGAGAAATCATCTCTTTTTTTTTTCA
GAGAAAAAAAAAAGCTCATCAGTGCGCTTGCACCAAAGAAACATGTTGCA
ATTGCTTATTACCCGAATTAAACAAATTTTTTAGTAATTAACTCAATATC
AACTAAACTTTAATCGGAAACTAGTTAGGACCTTTTCTCCATTCAGCTTT
GTTTGAAAACTAATTCCACAGCAATATTCAAAAATTGTAAATCTCTTAAT
ACTATTTTCCTTCACGTTATTTAAGCAATCAACTCAGAAGGAAACAGTTT
GGTTTACCAAAAAATTTCTGTATCTTTTTACAAATTTTAAATTTTAGTTA
ATTAGAGGGTGACTTCAGTATAACAGTAAAGTTAACCCATTTGTGATATG
AGGTCATGGGTTCAAGCCATGAAAACACCCTCTCTACAAAGCAAGGGGAA
GGCTATGTAAATACCCTCGCAGAGCCCAAAAATGTGGATGCACTAGGTCA
CCCTCTTTAATAAATTTTAGTTAATTCTTCTAATTTTGTGCCTCAATTTT
TTCACATTTGTATAATGGTTTAGCAGTCATTAATCAAATTTAAATTAATA
ATTTAATACTGTTTTATTATTGAATCAAATCGAACATTATAACTATAATT
TTTCATTTATTTTCTTCTCCTGCCACAATTCCACAATCCCTCTTCCTCTT
TCACCCGAATTCAAATTTCAGGCCATTTCAGGCCTAATAAATGAAAGAAT
CCAATGATTGAAGTAAAGGAATTACCAATAATATGATGGCTGAAAGCAAT
CTAATTTTGGCCTCAAAAGAGTCATGCATTTGTAGAAAAATAAGTTAAGG
AAAAGCAGCAAATGTGGGAGGGGAAGAAGAGAGGAGGGAGACAAAAATAT
AAACTAAACAAAATAATATAAAATATTCATGTCATCAAATCGAGTATAGC
TGTTAAAAGTGAGATGAATCTAAGATTGGTGGAATCACAATTGAAAAAGG
TAGGTAAATATTTAGTCCCTAAGGTTTGACAACATTAATTAGTTCATCCT
CCTACTTTCCAAACTCAATTAGTTAAAACGTCATGTTTATGTCTATTAAC
TACATGGTCCTTCCATCCAATTAAACACAAACTTTCTGTTAAATGGATGT
TATGACAATTATAACCTTCCATCCTATTGAAAATTGGATCATTAATGATT
AAGAAATGATAGAATAACCCTTCCATCAATGCATATGGGCATAAACTCTC
TGTGGATCAATTCTTCCTTTCTGCCTCCATTAGCAACACCTCGACAAATA
TATCTGCCTCCCTCTCCACTACTGCCTCAGCTTCCAAATCACTGCCCACA
GCCCATGAATGCCAAAACTTCTCTTCCACTTTCCTTACCCACATCATCCA
GATTCACCAGAACCAAGCGATACACTTTCCTTCCAAACATGAAGGATGGT
CTCTCCACACAAACTCCGAATGTCATCAAAATATCCTCTTCGTCATACAA
TCCAACCAAACAGCAGGAATTGTACCACATTTTTGCAAGCAAAATGGATT
ACCATGAATGATTGGGTGCAATCCCTACCACATGAAGTTTATAATAACTG
GGAGATTGGAAGATTGGGCTTGGAGTCCCCAACCAGAGCATTAACCTTTC
CCTACAAGATTGAGTCCAAGTCCTATTCCAAAATTTCTAGCTAAAACCTA
TCAAGGGAATGATATAAAAAGGTGTTTTATATCAAAGGAGCAAGCAGAGT
GGAAGGAGGGAGATATGAGAGGAAATGGAAGGGGATCAATCACAGATGAT
GTTGCAGGGATCAAAGTCGAGGTGTAATGCAGGGAGCAAGAACGGTTTTG
ACACACAAGTGAGGGAGAATGATAGCAAAGGTAGTACCTATGCAACGGGA
CGAGCAATGTGGAGGAGCTAAGGAGGAAATGGAAGTTGCATGCCCAAGGA
GAAGTTGAGGGACCCATTCCCATTGGTGTTTCCCTGTGGGTACCAAGGGA
AATTTGGTTCAGAAAAATGGTGAGAAGAGATGGTTGACTTTGCTGCAGAA
GATGGGTTTGCGGTTCGTGAGAGAGCTAGGGCTCAGAAAGTGGGTCTCCA
TAGGTGATGTATAGCTATATGGTCATGGGCGAGAGCACTGTGGAGTTTTG
AGATTACCGGATTTTGTGGGAGCCATGACCTAAGGATGGGAGATGACAAT
TGGCGAATGTTGAGGCCTTAAAGTGCTACGAATTGATTTTGGATTAGTGG
TGGAGGAAAATGTGCAAGTTGGTGTTGATGATGAGTGGGAAGAAGGTAGG
TCTCTACCTGTTTTGCTTGACTACGGGGAAGGGGATGGATTTGGTTCTTT
GAGAGGGAAAACGATAGAGGAGACAGGTAATGGGCATGGATATTTCTGAA
AAAAAGATTTTGAGAATTCCTGACTAACAGGAAATTATTGTCTAATTGGA
TGGAAGGATTAAAGGTTTTACATAGATAAATATTACCTACCAACAAGTTG
AGTTTGAAAATGGAAAGATTAACTAATTATTTACCCTAAAAAGATATACT
AAAATGTTTAGAAGGCAAACAAATATTTGCATTTGTTCAGTAAATGGCTA
CCCAATTGAACTAATTGCCAATGTCAAAGTTTCAAATACAAACTGAGAAG
CTAGAAGAATTGGCTAAAATTTAAAAAGTTTGCAAAAGCACGAATTTTTT
CTTCATTTGGCCTTGATGACAATGTATTAGAAATATAAATAATTTACAAA
TTAGAAAATAATAAGGTAAGGATACCCATATCCCAAAACCACTTTAAGTG
GTAATGCGATCCAAATAAATGACAAATTCTATATATTATAGTATACATTT
TATATTATATATATATAGCTTCTGGATCAATGCCTATACATACATACATA
TATATATACCAGTGGCTTCAGCATTTATCATTTGTGCATGTGTGTGAGAG
GAAGGCAAAAAGTGAGCACCATAAATCATAATGATTACCTCAAGGCTAGA
TCACAAAGTTACAAATTCCCAATCTTCTTTTGACATGTCTAGAAATTCAA
CTGCACCGTCTTCAAACATTATCTACAATGAAATAAATTAAATTAGGCAT
GATCATAATGACCATTTGTATCAGTCACAGGGAATGAACTGTTCTCACCG
CATGTTTTCTTGAGTGCTTATCAAACCGTTTGATCATCCCAAAAGATCTG
GAACAATGAAGCGTATTAAAAAATAATAAATGAAAGATGGAATATTTAGC
AGAATAATAGCAGATGTAAAAATTCAGAACTCACCTAAAGAAACGATTAG
AAAATAAAGTTCGTTGATCTCATCTAAAATTCAAACCTATATCAGTATGC
TAAAGCAGCTAAACATACTATTTTTAGAAGTGAATAATTGACCACCACCC
CAAACTCTTTCCATGCTCCCAAAAAAAACTGAAAATTATCCATTCAACCT
TTGAATCTTTAAAGTTGCATTTAGTTAGAAAACTACACCTAAGGAAATGA
TTAGAAAATAAAGTTCGTTGATTTATTATAAAAAATTTCTAAATGCATAA
TTATATATCAGTTCTCCAAATTTTATAAATTTATGTTAGTCTTTAGAAAA
CTAGTTTTAAATGTTTTCTGTTTCATGCTTATATCAAAGGAAGCTTTTTT
CATTGGAAACCACAGTCTTCCAGCTAACTTACGCATTGACACTTCAATGT
GGGGATCAAGTGTTGGCGAAGGCATTGCTTTTTTCTTTTTCATTCTTTTC
TTTTAAATTTTGGCCATATAATTATGCTACCTATAACTGCAAATTCACTT
GGTTAATTTTTTGCATATCCTATCCTTAAGTCACATCAATTCAGCAATGC
TGCACTTCAAATCCCAACAAATGCATTTTTTATTTTTGTGTAACTGCCTC
TTTTTTATTGATTTTTCCTAAGCATAATTGCATTTATTTTTATGGTTGCA
TTCAAATGTATATTCCTATTGATTAATTTTAGATGAACTTAAGAGTTTCT
ATTTTGTTATACAAATTGTTGGTCAGTTATGCCATCACTTCAAATCGAAA
ACTATATTGGATTATTTATATAATCACATTTCAATAATCATTATTTCAAT
GTAATAATACTTATTAGAAAATTGGACAACTAAATATGTTCTCCAGTTTC
CAATTTTCTATTTGGAAAAATGAAAAATTAGAAATATGGAATCAAGATGA
AAACTAGAAATGAAAAAAGAAAATGATTTTCACAACTAAATGAAGTCTTT
TCATTGTCACCCTTATACCTGACCCCTCAAATCTTGAAGTTCTAGTTCTA
CCACTAACCAAAAAAAGTCAATTTCCCACAGGGAAATGCATATTTATTGC
AAAATTTTACAAGAAAAAAAATGTACCTATTACTATATGGACGAAACATG
TGAATCACTTCACCAATGCAATTATGAGATCGTGTCTGTCGTTTACTGTA
TGCATGTTCTGAATTCCCTGAAATATAAGATAAATGCAAAAACATGATGA
AAATAGCATATTTTCCAATTTTGCCAAGGTACTCCAGCTCCAGCAGCTAA
ACAGACAAAGAAGGCAGTTTGTTAAAGGATTACTGGTTACCTGTATGCAA
ACCTCCATTCTGATAAACCTTTAGAAAACAAATTCCAGAATTAGTTTTAG
CTACATTTGAATAGGTGCCCAATATATATAAATTTAAAAAAAAAAAAGAG
AGTAGAAGTTGCAAAGCATTATATCATTTATATGGCATGAATAAACAACC
TCCTATACATACATCTTTTCCAGATAAAATTGCTTTCAATTTGGGAGAGG
ACACTGCCACCTGGCATGCTACTAATTGTAATGCAGCATCTGAAGAAATC
TTAGGCTTGCTGGGTTTAACCCCTAGTTTTCTCCTGCAGCCAACAGCACC
ACAATGGCAGTCCTGATCTGCACCGAATTGGACAAACCTGCTAAATTTAT
TAGATTGGACTAGGAAACCCGGAACTTAAAGAAAATAGCGTCATTAGTGG
TCATATTTAACCTTACAAAAATTTCTTTTGTCGATAACAAATTTAAATAT
GCACGATAAGTTCACAAGGAAGAAGAGACCAATCACTAAATATACAATGC
AATACAGATGATGCAAGTACTCTTACTGATAATCATAGGTCAAATGCTCG
CCCTTTTTTATGTCACGAGTTGCAAATATGCCAATTCTTGTCTCACCATC
AATTATCCTTAAAGAAAAAAGGGGAAATAAACAATAAACAATAAAATGGA
GTAAGTAGAGTAAACAAGCAAGATTCCCAACTAACTGTTAAAATTGAGAT
TAAGAATGAGCTCAGCAATAGAACCATTTCTGCATCTCAGTATTAGGAGA
ACAACTGTGGTTTATGTATCTTGACTTGTTTCCCTTGTATGTGGCATCAA
TTACCATATCTCGATTAATTTCACACAAGTAAAAATTTGTCTCTCCACGG
TGTTTCATATTCCAAAGCCTTTCCTCACATGTTTTATCATCTATGACTGC
AATAATAAAGATTAAACAAAAAGCATTATGTTTTAATACTGATGCAACAG
TAAACGTTAAGATGTATATCAAATTATCAATAATGATAACACTGCACAAG
CTAGAAATATCACCTTCTCCAACATATTCTATTACAAACTCTCCCTGTGC
AATATCTTCATCCGCCACAATTCCAGCTCCACATTTCTCAGTCTAGAAGA
AATAACTTGCTTAACTTCACATATTTTTAGTGTGTGTATAGAAAACAACA
TGTTCATGCAAAGCAAATGATATAAAGAAAAGGCACCAAAACATGTAAAC
AAAAATGGAAAAAAAGAATACTGTGAATAAAATTACTTAGAAGAGGTAAG
GAATTTTTTCCCAGTCCACAACCTGAAAACAAGGTGATTGTGTGAGAGAG
CATGCACTTGTGTGCGTAAAAGTTAGAGAAAGAGAGTGAATGGCATTAAT
ATAATACTTGTTATTTACAACTACTAGCACATATAATATATTGTTTTGCT
CCTCTAGTATCTTTTGTCCTTATGGGGAGCATCACTTTTATCCCTCCTCA
TAAGTCTTTTCTCATTATTAATGGAATCATCCTTCTCTACATGTTACTAT
TTGTCCTTCTTCCCTGAATATGTGAGTCATATACCTGTACTAGTTTCATT
TTCTTCACAGGTCGGTGTTGAAAGGGTTTGTTGAGACATGAACTCCCACA
TCTGCATCCAGTGGAGCAGCTAGAGAGTAGCATCCTGAGGGGAAAGGGAG
CAAAAAAATTGTTTCTTATTATTGTGAAAGAAGATTTCAGATCCAGCATT
TGAAATAATAACTAAACATAAGGCATGCACATAAAGCTACATAGTATACC
AGTAAACCAGTCATGGATGACTACAAACATGACATAATGATGTTTCTTGT
TATAGTTTAGCATCATTTTCTCTTAATAGTTAATAACTATTAAGTATGAA
CCCAAACATTCTTTTTTTTTGGCCTTACCAAGAAAGGTGGCATCATCAGA
AAAATAAAAATAAAAATAGATCCAGTCAGATTCAAGTGGACAACATCTAG
ACTGTCATCAAATTTATATTCTGAATAGAAGCTGACTTATCAAATTGCAG
AAACTCATAGCCTTGACTTGCTTCTTGCATTAAGCTAAATTCTAACGTAG
TAACACTTGAGTATTTAGGTTGTAAAAGCTTATTAAAAGAAAAAAAAAAT
GAAGGTTGCTAGAGAAGTGTGGGGGATCATGAGGAAACAAAAACAAGTGC
TGCCAGCCAGAGAGGAGAGAGAGAAGGGAGAAGAAGTAGCCTTTATCAAG
CAGTGGGAAAAAAATGTCCATTATATATAGGCATTAACAGCAGTGGGAGT
TGCAATATTTGTTAAACCACATCTGACAGAAGCAGCCCAATCAAGGCCTC
TACAAGTCTGGGCCAGGATCCATGGCCTCTTAGAGTTTATTATAGTCAAG
AATATGGGAATGAAGGAAATGGGAACAGAAGAATCCAGAGGGGACCAACT
GTAGATGATGGCAATGGGGAGGTTAAGCCATTTGAGAGATTCTCAGATCC
AGCTCACAAGGAATAGGGAGCAGATGATTCTCCAACCTGTTATATAAATA
ATTTGTTGTTTTGTAGAAAGGCATGTTATGTCTTATTAGAAATTTGCGGC
TGAGTGCTGGGCTACGCTAGCTGATTGCTGGACTGAAGCTTTCTCCTGGT
TATTTCTTTCTTTCTTTTCATTTCAAGAGTTGAGAAAAACATTGAATGCT
GTTTGTAAACAAGACTATAGCCATTTTATTCAATAGAATAAGCCATACTA
TGTCATTTTACTGTTTCATCGGTAAACTCTATTCCTCACTCTACCAACAT
CCATCTCAATACTTGCGACTATGAAATTCAATTACACCAGAAAGAACTTT
CCTGCTCATTTTGGATAATTAACAATTTAAAATGATATCACAAAACATAT
AGTCCTAACTGTGAGCTTCACAAAAGTTGACTGCCTGTTCATTTCCTTCA
TTTATTGTGTTACTATACTCTATTTCTACTTTTTACCCTTATCTTCCCTT
TGTTTCTTTCCTACATTTTTGTTCTTTAACCATGCCTCTAACCCCTCTTC
TTTTTTTCGATAATAACTTTATAATATATTCCACATTCTTTACCTTTATT
CCATGTGTCATCCACTCTCCCGCTTTCCTTGATTTTATCTTCACAACTAA
CTCTTATAAGATTTAACTTCAAAATTTTCTAACTTTAAGAGCCTATTATT
TTTACAGTTTTATCCATCTATTAGAATTATAACCTAAATTTAAATATCAA
AAGTAAGTTGTGCATCTAAAGAGATAAAGTTAATAATTTCTAACATAAGT
CTGCACTAGAATCAGCAAGACAGACTCAGCACTTTTCCCAATAATACAAT
ATGAATTTAAATAAAAATATTAGCATATATATTGCTTATATGCATACATA
AGGAATACTTAATGCTTCACATATCTGAGATCAACCAGAACAAACGAACA
AAAACTTATAATCTGGACATCATACCCATTGTAGTCATCCCATCAGCAAC
AGCATTACTAAACCATAAAAAAGTTCACTACGACGAGCTATTCTCTGTAA
AGGAATTGAATCCCAATTTGCATGTACCATATCATGAACAAGGACAATGG
ATTTCAAACACAACCAGGACAAATCAAGCATCAGTTACTTCAATGGCTAG
AACGTGTTTTTAAATTATAAGACATGAGAACATAGAATGACAATTCTCAG
TCTACCTCTCAAAGGAAAAAACAAATGAAAGAGAACATATTATGCAAGGG
AAGGAGAAGATAATTAGGGACAAGAGCGATACGTCCTTCAATCAACAGAA
AGAAATAAAAAAATAGAATTAGCATTGTGATTGAATGTCCACCAAAGACT
AAGGAAATGGTAACACTTCAACAATGAGAAAATGGACCAGGTCTAACCTC
ATCCCAACAGCTAACTCAAGTGAGAAGGATTGCCTAAGACATCATATTTA
GCACCAAATTCTTGTCCCAGACCAATGTGTGACAATACATCTCCCTCACT
CCCAAACATGAACATCTGGAATGTGAAGTTCAAAAGCATAAACATCTGCA
AATGGCCCAAACCAGAGACAAGCTCCAATACCATGTTTAGAAAAATGGAC
CGAGCCTAACTCTATCCCAAAAGCTAGCTCAAGAGAGAATGGTCGTCCAA
ATCATTATATTTAACACTAAATCTTTATCCAAAACCAATGTGCGAAGAGA
AGAATGCCATAAGCAAGCCCAGAAGAGGCTTGGCCAATTAAAAAGACAAA
TCATTATATCCCAATTAAATACCTTGAGGCAACTATTGCCTCTTAAGAAT
ACAAGCATTTCTCTAACCAAAAACAGCCTACCATAGAAGCCTTGAAAGTT
GAAATTGATCATGGAAGACTAGAAAAATAAATTACAATACAACAGCAATG
GATCAAAAGAACTCATCAGAAAGATGATCAATGCAAATGCTTTTAGCCCT
TAAAGATGTCATACATAAGTCTGAACAATCGTAATAGACAAGATTAATCT
TACCCACAATGGCAATCTCTACCACAGACACCAGAAGCACCTGGTGATGA
ACTGCAGGAACAGAATATGCCATCATCCTCAAGGCGCCTTTTAATTCTCT
TTGTGAGATATATATCTAAAATTGTCAGTATCAACAAAAATGGAATAATG
AGGAAAGACACTTTAATGCATGTAGGAAAAAAAAAATTATCAGACCAAAA
ATAAAATGGAAAAATTACTATTTAGTCGTTATGGTATAGGAAAACTCACT
AGTTCATCTCTTGGTTTTGGAAAATGCATTAAATTGTCCTTCATGTTTTA
AAAATTCTACTAATTAGTCTCTCTGTCAATTTTAGCTGTTAAGCACTAAG
AAAAATCTAAAATGCCCTCAATCGAAGGGACTAATTAGTTTACATTTTTA
TAAAATTGAGGGACCAACTAATAAATTTTTTTTCCACTATAGTAATTAAA
TAGTAGAACATTTAATGTATAAAATTAACGAAGTACCGATTACTATATTT
TTTAATACTTCAAGAATGTTTAATGTATTTTCCAAAACTAAAGGACTAAC
TAGTAAGTTTTCCTATACCATAGGGACTAAATAGTAATTTACCCAAATAA
AATCTGTGAACTGACAAAATGCAGAATTCAGATGTAATCAAAGATATTTA
AAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAACTACACTAAATTTCTTGCGAAAA
CAAAACTATATTAGTAACCACTATGAAATTGCAACAGGAAACTAATGTAT
TTTGAGTGGATACTGCGTTTTATGAAGGTGTAAGGAGTGAGCTTCCATTT
ATTAAAACACTCTGGGAGTTCAAACTCAACTGGATTGCCTATCTGCTTCA
TCAACTTGCTGAATGCAAGTTTGATGCAATTGTGATCACAATCAAAATTC
TGTTAAACAGAAGAAACAATATCTCATCAAAATTCTAACAAACAGAAGAA
TGCCCAAAACAAGTAATTTTGTACTGAACATATAAGAGCCTGAAATTTCC
GGTAATGCAATCAATACCAAGAAACAGACATCCCATATATTAGAAGTCCT
AGAATTTTAACTAACATATTAATTCATAAAGAAACAAGAATCCAGTAGAA
ACTCGAAAAATAACCTCTTTTGTTGCAGGCATGACCTCAAGCATCATAGC
CAAACGGAATATGAATCATGAATATAACTACCTACACAGCATTAACATCA
TATACGAAGTCAATATCATTATTTATATATAACCATTGAACAATTTCTGT
AAATCCCAAGAGGAGAGTTCAAACAATTGAATGAGTGTCCATGCCAAAAC
CCTAAACCAAATTAGGGAAATACCTAGAAATCTGGCAAAATCTGTCAAAT
AAAATTACAAGAATGGCGAAAGAACACAATATGTAAGCCAAATTGACTGC
AACAAGAAGAAGAAGGAGAAAGTATAGAGGAGAAATGAAAAGATTGAGTG
ACGAATTCTACCTCGAGTTAGTCCAACTAAGAGAACGAATCTTGGATGTG
AGGGAGAGACTACTCAGGGATGTTAGTGGGTAGTGTACCCGTGAAGTTTT
AAATACCGGACCCAATACATTTATAGATACACTATCTGAACCCGTTTAAA
AATTATATTTGACTAACCTAATCCGATTAACTCATATCCCAACAAAAAAG
AAATAAGAAATACACACAAAATCTCACATTTCAACAAAATTCTAAAACAC
AGCTCAATCTCACAAAAACAAATCTGAATGGTAGTGTTTATTTCAAATTT
TTCATTATTCTCACTAAAACAACTCTCAATCCATTCACAATAATCTTTAT
TACAAAGAATTTTCAATAATCTCACCAATTCAACATTCCCATAAATTTTA
ATATTTTCACAAATTTCAGCAATCCACATCAAATAGATCTCACAAATCTC
AGAAAGTACACATCTGAAATCAAAGTTTCAAAAAACCCATCCAAACCTGC
AATGACAGAGGATGCAGCCAGGAGCAGCACCGGACGGCAAGACTGGACCA
GCAGACGCAGCGACGACGACCAGAGGAAGCGGCGGAGGAGACAAAGAAGC
AACCAGGACCAGCAAACGCAGCAACCACGTTGACAGCGTGAAGAGCAGAG
GGACGAACGGCTGGAGGCGCACGGCTTCACCAGAGGAGAGGCGGAGAGGC
CGAATGGGGGAGGGGAGAGCGGCAGTAGAGAGTTCAGAGAGATT

mRNA from alignment at Chromosome01:1534795..1546838-

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Manes.01G008900.2.v6.1 ID=Manes.01G008900.2.v6.1|Name=Manes.01G008900.2|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=12044bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1534795..1546838- (Manihot esculenta)
AATCTCTCTGAACTCTCTACTGCCGCTCTCCCCTCCCCCATTCGGCCTCT
CCGCCTCTCCTCTGGTGAAGCCGTGCGCCTCCAGCCGTTCGTCCCTCTGC
TCTTCACGCTGTCAACGTGGTTGCTGCGTTTGCTGGTCCTGGTTGCTTCT
TTGTCTCCTCCGCCGCTTCCTCTGGTCGTCGTCGCTGCGTCTGCTGGTCC
AGTCTTGCCGTCCGGTGCTGCTCCTGGCTGCATCCTCTGTCATTGCAGGT
TTGGATGGGTTTTTTGAAACTTTGATTTCAGATGTGTACTTTCTGAGATT
TGTGAGATCTATTTGATGTGGATTGCTGAAATTTGTGAAAATATTAAAAT
TTATGGGAATGTTGAATTGGTGAGATTATTGAAAATTCTTTGTAATAAAG
ATTATTGTGAATGGATTGAGAGTTGTTTTAGTGAGAATAATGAAAAATTT
GAAATAAACACTACCATTCAGATTTGTTTTTGTGAGATTGAGCTGTGTTT
TAGAATTTTGTTGAAATGTGAGATTTTGTGTGTATTTCTTATTTCTTTTT
TGTTGGGATATGAGTTAATCGGATTAGGTTAGTCAAATATAATTTTTAAA
CGGGTTCAGATAGTGTATCTATAAATGTATTGGGTCCGGTATTTAAAACT
TCACGGGTACACTACCCACTAACATCCCTGAGTAGTCTCTCCCTCACATC
CAAGATTCGTTCTCTTAGTTGGACTAACTCGAGGTAGAATTCGTCACTCA
ATCTTTTCATTTCTCCTCTATACTTTCTCCTTCTTCTTCTTGTTGCAGTC
AATTTGGCTTACATATTGTGTTCTTTCGCCATTCTTGTAATTTTATTTGA
CAGATTTTGCCAGATTTCTAGGTATTTCCCTAATTTGGTTTAGGGTTTTG
GCATGGACACTCATTCAATTGTTTGAACTCTCCTCTTGGGATTTACAGAA
ATTGTTCAATGGTTATATATAAATAATGATATTGACTTCGTATATGATGT
TAATGCTGTGTAGGTAGTTATATTCATGATTCATATTCCGTTTGGCTATG
ATGCTTGAGGTCATGCCTGCAACAAAAGAGGTTATTTTTCGAGTTTCTAC
TGGATTCTTGTTTCTTTATGAATTAATATGTTAGTTAAAATTCTAGGACT
TCTAATATATGGGATGTCTGTTTCTTGGTATTGATTGCATTACCGGAAAT
TTCAGGCTCTTATATGTTCAGTACAAAATTACTTGTTTTGGGCATTCTTC
TGTTTGTTAGAATTTTGATGAGATATTGTTTCTTCTGTTTAACAGAATTT
TGATTGTGATCACAATTGCATCAAACTTGCATTCAGCAAGTTGATGAAGC
AGATAGGCAATCCAGTTGAGTTTGAACTCCCAGAGTGTTTTAATAAATGG
AAGCTCACTCCTTACACCTTCATAAAACGCAGTATCCACTCAAAATACAT
TAGTTTCCTGTTGCAATTTCATAGTGGTTACTAATATAGTTTTGTTTTCG
CAAGAAATTTAGTGTAGTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTAAATA
TCTTTGATTACATCTGAATTCTGCATTTTGTCAGTTCACAGATTTTATTT
GGGTAAATTACTATTTAGTCCCTATGGTATAGGAAAACTTACTAGTTAGT
CCTTTAGTTTTGGAAAATACATTAAACATTCTTGAAGTATTAAAAAATAT
AGTAATCGGTACTTCGTTAATTTTATACATTAAATGTTCTACTATTTAAT
TACTATAGTGGAAAAAAAATTTATTAGTTGGTCCCTCAATTTTATAAAAA
TGTAAACTAATTAGTCCCTTCGATTGAGGGCATTTTAGATTTTTCTTAGT
GCTTAACAGCTAAAATTGACAGAGAGACTAATTAGTAGAATTTTTAAAAC
ATGAAGGACAATTTAATGCATTTTCCAAAACCAAGAGATGAACTAGTGAG
TTTTCCTATACCATAACGACTAAATAGTAATTTTTCCATTTTATTTTTGG
TCTGATAATTTTTTTTTTCCTACATGCATTAAAGTGTCTTTCCTCATTAT
TCCATTTTTGTTGATACTGACAATTTTAGATATATATCTCACAAAGAGAA
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GAGTTAATTACTAAAAAATTTGTTTAATTCGGGTAATAAGCAATTGCAAC
ATGTTTCTTTGGTGCAAGCGCACTGATGAGCTTTTTTTTTTCTCTGAAAA
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GGTGACAACGAACTCGTCATTGGAAAATGTTGTAATATTTGATTCTAGTA
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AAGAATGTTGTAAACAAAAATATCATATGCATTTTTTGTCTTGATAAAAT
AAGGAATTTTAAACTGTAGCTGTCGGAGAAAACAGTATGCTGGAGGAGCC
GCTCTTCAAATTAGACTGCTCGCGGCAGGTCAGACTTTGGAGGCTGATGG
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CAATGGTCAGTAGTACCATATCCTATGTTTCATATTGATTGTGCCATTTG
CAAGAATACTTTGAAGTATCATCGCAATTGTATGCTCAGAAGTCGAAATC
AAGTGGGGAACTGATATGTCTTATTTAAAAAAAAAAAGAAAGATAGGTTT
TGATAGGTTTATTAGAGTGGTTTGATGGGGGCTCCGCTAGAAGCGACTGT
GCTAGGAGGAGATGAGATAATTTGGGCTGTTGAAATAGTCGTTCAGTTTT
GAATTAAACTTTCAAAACTGAACGAAAGAACATATTTTCAAAATATGAGG
ATGGGATTTAAGTTATAGCCAAAGCCAGACTGTAACAAATAATATGTTTG
GTATTTTTTCTCCCATTTGTTGGACCTCATTTCCATAGGTTAGGAGGGTT
TTTTCTGGCTCACTAATGGTATGTACTATGCAGTAGAAGCAGAATGTTCT
TAAATTTGAATTACCATTACCAGGTGTGATTGTGTTTTATTTGC

Coding sequence (CDS) from alignment at Chromosome01:1534795..1546838-

>Manes.01G008900.2.v6.1 ID=Manes.01G008900.2.v6.1|Name=Manes.01G008900.2|organism=Manihot esculenta|type=CDS|length=1047bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1534795..1546838- (Manihot esculenta)
ATGAAGCAGATAGGCAATCCAGTTGAGTTTGAACTCCCAGAGTGTTTTAA
TAAATGGAAGCTCACTCCTTACACCTTCATAAAACGCAATATATATCTCA
CAAAGAGAATTAAAAGGCGCCTTGAGGATGATGGCATATTCTGTTCCTGC
AGTTCATCACCAGGTGCTTCTGGTGTCTGTGGTAGAGATTGCCATTGTGG
GATGCTACTCTCTAGCTGCTCCACTGGATGCAGATGTGGGAGTTCATGTC
TCAACAAACCCTTTCAACACCGACCTGTGAAGAAAATGAAACTAGTACAG
ACTGAGAAATGTGGAGCTGGAATTGTGGCGGATGAAGATATTGCACAGGG
AGAGTTTGTAATAGAATATGTTGGAGAAGTCATAGATGATAAAACATGTG
AGGAAAGGCTTTGGAATATGAAACACCGTGGAGAGACAAATTTTTACTTG
TGTGAAATTAATCGAGATATGGTAATTGATGCCACATACAAGGGAAACAA
GTCAAGATACATAAACCACAGTTGTTCTCCTAATACTGAGATGCAGAAAT
GGATAATTGATGGTGAGACAAGAATTGGCATATTTGCAACTCGTGACATA
AAAAAGGGCGAGCATTTGACCTATGATTATCAGTTTGTCCAATTCGGTGC
AGATCAGGACTGCCATTGTGGTGCTGTTGGCTGCAGGAGAAAACTAGGGG
TTAAACCCAGCAAGCCTAAGATTTCTTCAGATGCTGCATTACAATTAGTA
GCATGCCAGGTGGCAGTGTCCTCTCCCAAATTGAAAGCAATTTTATCTGG
AAAAGATGTTTATCAGAATGGAGGTTTGCATACAGGGAATTCAGAACATG
CATACAGTAAACGACAGACACGATCTCATAATTGCATTGGTGAAGTGATT
CACATGTTTCGTCCATATAGTAATAGATCTTTTGGGATGATCAAACGGTT
TGATAAGCACTCAAGAAAACATGCGATAATGTTTGAAGACGGTGCAGTTG
AATTTCTAGACATGTCAAAAGAAGATTGGGAATTTGTAACTTTGTGA