Manes.01G002100.1.v6.1 (mRNA)

Overview
NameManes.01G002100.1
Unique NameManes.01G002100.1.v6.1
TypemRNA
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length8015
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:425694..433708 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
Pacid32357646
Longest1
AncestorIdentifiercassava4.1_033148m.v4.1
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G002100Manes.01G002100.v6.1Manihot esculentagene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G002100.1Manes.01G002100.1.v6.1-proteinManihot esculentapolypeptide


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G002100.1.v6.1.five_prime_UTR.1Manes.01G002100.1.v6.1.five_prime_UTR.1Manihot esculentafive_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.1Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.1Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.2Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.2Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.3Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.3Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.4Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.4Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.5Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.5Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.6Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.6Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.7Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.7Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.8Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.8Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.9Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.9Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.10Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.10Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.11Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.11Manihot esculentaCDS
Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.12Manes.01G002100.1.v6.1.CDS.12Manihot esculentaCDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G002100.1.v6.1.three_prime_UTR.1Manes.01G002100.1.v6.1.three_prime_UTR.1Manihot esculentathree_prime_UTR


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Manes.01G002100.1.v6.1 ID=Manes.01G002100.1.v6.1|Name=Manes.01G002100.1|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=8015bp
TTTTTCGAAATAAAAGATATCTATCACGGGCATTGCAATTACATATTTTT
ATATTGTCTGTTTCCATTTCAGTGCGGGATCGGTATTGAGTAACTGTTCT
GATTTTGGAAGGAAGGATGTTTGGTTCTACTACTGGTATGTGCTTCCTTT
TATATATGTGCGTATACATATATATTCATATTTTTTATGATTGGTTAGTA
GCTGGTTTTATCTATTTTCATCCTAATTGCCTGTTCTGAGGGCTGTGATT
TTATTTTTGTAGTCTTATCTTTTACATTGCTGGGGTGTTTGAGCTTGAAA
TTAAACGCCTTTGTTCATCTCCAATATATTAAATCCATGGAAGATTGATC
ATGGCTAAGCTATTTATTTTCACGTGCGTGCATCTTTCTGAATTGCACTG
TTGGTCATAGTTAGAACTTAGAATGAAGCTTATTGACCGTTGCTTTCTTG
GTTCCCTTCATTTACTCGTACATATTAAATATTTCAGTCACCTTTGGATC
ATTTTTGAGTATGCAATGCATTTCCTGTCATAAGATTTTTCTTGTTTTTA
TACACAATTTATTCTTTAATAATTTTATATTGATCAACTTAAATTTATGT
GAAAAAATGTCATCTATTTTGGTAAACATATTAAGATTTTCATTTAATGA
TAATTAATTATCTAGAAAATGGTCTTAGAATGGGATTCTTGGATAGGAGA
AATCAAGATCCATTCCATTCAAATCATACTGCACTTATGCCTGCGTTATT
TGCTATTCATTTGTTTTTTTTTTTGGTTCTATTATTTATTTTTTCTGAGA
ACATTTATGTTTTCTTTTATCTTACGCCTTTAATTGTTAGAAAATCTTTG
ATTATATCTTCTGGGTTTGTTGTCTGATTATGTTTGCTAACTTAGTTATG
CTCTGGATCTTGTGTTGGAGTGGCTTATTTAAGGTTTTCACATGGCTTCA
GGATGTGGAAATGTGCTTTTCCAAAACAGTCTAACAGTGCTTGTCCTGAC
TTTTATTGAGCTTCTTTTATGGAATGTACTATTGTTTTGATGGAAATTTT
ATATTTTTAGTATTTGCCATTTTCATTACATATGAATGTATATGTTCCAT
GAAGATTATAGCTAATAGTGTTTGTATGCGTGACTCTGTGCGATAAACAT
TCTGATACTTTGAATTTAATTTAACAGCTTTTGGGCAGTCATCTAGTAGC
CCCTTTGGTTCCCAAACAGTATTTGGTCAAACAAGTAATGCCAACAATAA
TCCGTTTGCTCCTAAACCCTTTGGTAGTACAACTCCTTTTGGTTCACAAA
CAGGGGGCTCCATTTTTGGGGGAACTTCAACTGGCATGTTTGGTACCCCC
CAAACTTCCTCACCTTTCTCTTCCACTCCTTTTGGCGCTTCATCTTCACC
AGCATTTGGGAGCACTATGCCTACATTTGGAGGTTCTTCTTCTACATCTG
CTTTTGGTAATTCATCAACTTCATTTGGTGGTAAGTATGCCGTAGATTTA
ATTATACCATTAATTGTTTTTTTTTGTTATAACAACTCTGCTTCTTGTTG
TTTACCTATGTTTCTTTTCTTGTATTTGTTGCATATAAACGTCTACATTT
TGAACATTACCATCTTTTCTGATCTAGCAAATATAGACCATGTTTTATCA
GGTAATGCATGCATGTTGGGTTAATGCGAACTTATTTGAATACCAATGGA
CATTTATCCTGGAAGCCATTTTTTATGAACTATTATGAGAACATCATATG
CCAGGAACGTATTCCAGGGAAAAACATGTATTTTAGGAGATGATAGTTAA
ATGGCTGCATATTTCTCCAACGCTTTTCTTATTTTGTAAATATCCTCTTA
GTTTTTATCTCTGTCTTTTGCTTATTTCTCTGTAATATTTTTAGGATGAT
AGATTACTAGTTAATATTTATCTTCCCTTGTTTCATTTTGTCTATCCACA
TGGGGAGATGCACAGTGTATATACATATGCATGGATATTCATTTTACTCC
TATAACTATCTGCATCTGATATGTTCTTTACTCATTAGTTAAACTATATT
TCTTACTTTATTTATTTCAATGTTTCATTTTCCATGTTTACCAAATGCAC
TATTAATCTGTATATTTATCTCACTGGGTTGTTCCTGGTCTTCTAAACTG
ACAACTATATGTATCACTGTAATTGTTTGTTAGGATCTTCTGTCTTTGGC
CAGAAACCTGCTTTTGGAGGCTTTGGGTCTACTACTCAAACAAGTCCATT
TGCAACTACAAGTCAGCAATCACAGCCTACTTTTGGTAGCAGCTTATTTG
GTTCTACCACACCTTTTGGTGCATCAAGTCAGCCTGCTTTTGGTTCAACA
GGTTCTCCCTTTGGTTCTTCCAGCACGCCTTCCTTTGGTACAAGCAGCAC
TCCGGGCTTTGGTGCTAGCACTCCATCCTTTGGTACCACAAGTGCATTTG
GGTCAACAGCGAGTCCAGCATTTGGTACGGGAACTGGATTTGGCGCGTCC
AGCACACCAGTATTTGGATCTGGGGGCAGCTTTGCAACTTCAAGCACCCC
TGCTTTTGGTGCTTCAGGTGCTCCTGGATTTGCAACTTCTAGCACTCCTG
CCTTTGGGGCTTCAACTACTCCTGCCTTTGGGGCTTCAACTACTCCTGTC
TTTGGGGCTTCAACAACTCCTGCCTTTGGGAGTACCCCTGCATTTGGGAC
TTCAAGTACTCCATCCTTTAGCTTTGCATCCAGCCCAGGTTTTGGCCAGT
CAGTGTCTGCATTTGGAAGCAGTCCATTTGGGACTACTACATCTCCCTTT
AGTTCCCAGAGTTCACCATTTGGTAAGTTACTTTAAATATTCTATATTAT
ATAATAGGACTGCTAAGCTTTGATGAACTATAAATTTTCAGTTTGCAGCC
ACTATTATATCCTTTCTTCTTCCTTCCTATGAGAAGTAAAAATTGTGTAT
ATATTGCATGAGTTATGTACATTTATGAGCTTGTATGTAGGATCCCAGGC
TACAACAGCAACATTTGGGAACCCCGGATTTGGCCAGTCTGCATTTGCCG
GAAATCGTGGGGGTAGCAGAGCAGTGGCTTACTCGGCGACAGCTGAGACA
GACAGTAGTGGTGGGCAGCCTGGAAAGTTAGAGTCAATATCAGCAATGCC
TGTGTACAAAGATAAAAGCCATGAGGAACTGAGATGGGAAGATTATCAAT
TAGGAGACAAAGGTAGTGCATAGTAAATATGTTTGTGAAATCTGACATGT
TTATTTTATAGATTTCTTTTTTCTAATAATAAATGCTACTTTACTAATAT
TATATTTCCTGGTTTCCAATTGCAGGTGGACCACTTCCTCCTGGTCAAGC
CTCTGCTGGGAATAACTTTGGTGTCTCTAGCGCACCAGCAAATCCTTTTG
CTCCTTCAAATGCATTTACTCAGTCATCTTCTAGTCCCTTTTCTTCAACA
ATTTCCTCCAACCCGTTTTCTACCAAACCTTTTGGAACCTCTAGTACACC
TTCATTCAGTCCTTCACCTTTCACTGCAACACCGTCATCTAATCCTTTTC
AGTCAACCTCAGCTTTTCCGTCCACTTCATCCACTGCATTTCCAGGCAGT
GCAGTTCCATCTCTTTTTGGCACATCCAGCTCCTCTGCATTTGGTTCATC
ACCATCCTTGTTTAATACAAGCACAGGACAAACAAGTTCATCACTATTTG
GAAATTTTGCAAACACTCAGCCATCTCTCTCATTCCCATCCACTGCACCT
TCAATTGGCCAGACAGGTTCTGCTTTTGGACAGGCTACCTCCGCTTTTGC
TCCGAGTACCACCCCTTCTTTTACCCAATCTAGCATCTTCAATACTCCTA
GTGGTTTTGCATTCTCTAGCACTTCATCTCTGATGTCTTCGACCAACCAA
GGGGTGTTTGGTCAAGCAAGTGTGAGTAAATTAAGATCTTTATAATATCT
CTGATTCTCTCTTTGTTAGTATCTTCAATTTCTCCACTATGTGACAAGAT
TTTTATGTTCTGTTTGGGATATTGGGATGTAATCTTTCATTTCATATATT
TTCTGTTGCCATTCCTATCCGTAGTTTTCTGCTGGGTGTTGTAAAGTATT
GGAGTAGAATGTAAAATGTCAGAAATGAAAAGAAATCAAAGTCCTACTTC
TGATTCATTTTTTTTTTTAACTACTGGGTGATTATCTACAAGGCTGGGGT
TTGCACATTCATACATCCTTGAACTTGCATAGGTGTCTTTCGAGTTTTGG
GTCTACTTAGCTTTATTCAACTGCTACATTTCTTTACTTGCAGTTGTCTC
AGTCTACTCCTTTTCAACTCTCTCAACCTTCTCAGGCTACAAGTCTCCCT
GGCTTTGGCAATTTTGGTCAGTCACAAGCAGGTATCTTCTTGTTTCTTTG
CTCTTTTCTCTCTGCATTTTTATGATTCTCATGGTTATTAATGGAGGTTC
TTGACTTTGCTTACTGTCTTCACAGCTGGCACAAGCGGATTTGCTGGTTC
ATCAAGCATCTTTGGTCAGAGTACTTTTGGACAATTGTATGTCTTCCCTT
AACTCTGTTAGTTTGTCTTCATGCATGCTTCCATCTTTTCATATCATTGC
ATCTGATATGATTGGTTTGTTGTTAGTGTTCTTTTTATGTCGCAACATCC
TGATTTGGTTCCTTCTTGCTTGTGTCAGTATGTGTACTCATTTATAATGT
TCTTAATTTTTTCTGTCCTTTTTATGAACAGTGAAATGGATGTAATTTCA
TTCTTGGTGTTCAGTACATCAATTTATGATTCATGCAAAGTAGTAAACAT
GTTTTCTGTTTGCAGGTCTAATATTCAGAGTTCTGCTGCTGTACAGCCAG
CACCTGTTACAAATCCATTTGGGACACTACCTGCAATGCCTCAAATGTCT
ATTGGTCGAGCTGGGACTGCACCTTCAGTTCAATATGGGATTTCTAGCAT
GCCTGTAAATCATTTGTCTTGAACTTTGTTTTCCGCTTAAGGAACTATTC
AATTGCAAAATGATCTTTCATGTTCGTCTAACTTGGTACTTGAGCCATTA
ACTTCAATAATTTGCACATGGAGAGAGAGATTGGGGGGGGGTATTTTTAT
ACCTAAAACGATTTACTTCCATAAACTGGATAGTTGTGGTTTTGACTATT
GATAGTTGTCTTCTAGGTGGTTGACAAACCTGCTCCTGTTAGAATATCAT
CCTTGCTGACTGCTAGGCACCTGTCACAAAGACGAATCAGGTTACCCACA
AGAAAATATAATCAAAAGCATGATGGTCCAAAGGTGAGGAATTTACTAAA
GATTGGTAGATGAGCACAAATATACCTGCTTTTCTTTCACCTATAACTGT
GGTCAGGAACGCATGTTAAGGGTGCACCGTGCACATCTGACTTACATTTT
AGTCATGTACTTGAATATTGCATTCAGGTTCCATTTTTTAGTGATGAAGA
GGAAACCACCAGCACGCCAAAGGCAGATGCTCTCTTTATTCCTCGGGAAA
ACCCAAGAGCTCTAGTCATTCATCCTACAGACCAGTGGCCCATGAGGGCC
AATGCAGAAAAAGCTTCTCCACTGAGAGATGCATCCACGCCAGTGTATGA
AAATGGTAAGTCCTTTAAAAGGTCTATTATATTTTCTCTATGCTGAGGGA
AATATATGAATATGTTCTTTCATTGTTATTTTTTTTTTTAATTCAATTGT
CCAGGCAAGCATTCAGAAACTGTTGATGTTCCATCCTCAAGTGGTGCTGG
TGGTAAAGATAGTAAGATTTCGTTGTTATTTTGACAGTTCTTATATGCAT
TCTCATTCTTTTAATTTGCTCAAATTCCCTTGTGGTTATTTTACTTGTGT
GAGAAGTTAGAAAACCGATTTGTAAAATTTGGATTCTTTTGGATCTGGTA
ATAAGTATGGGCCCTGAACTTTTGATTGATAAAGGAAATCTTAACAATCT
ATTAACACAATCCAAACTTTCGTATGAACCTCATGTTACTCACCCAATTA
CTCGAGTGGCTACATCTAAATATGATGCTCTGTTGGGAGAGTATGGAGAA
TCGAAGAACTTGGTTTATAGTGTCTTTCAGCTTCTCTCTTTTATTGATGA
TGAACAGTTATGACAGTTTTTATTTGGCAATGTTCTTTTCTGAAACCTAA
GTTCTCTTGGGGTGGTAAACTTTTTGAGAATGGATCTGAAGTTTATTAAA
GATGTAAGATTGGCTAAGAATGTGTTATTCTAAATATTCACCGGAGCATT
TTCAATATGCTTTGCAAGTCAACTAGTATTTCTTAACAATTTGAGCAAAG
TTTTTTATTCAAAACCTAGGGTTTCAAAATACCCTATTCAAATGCAACCT
CATGGTGTTTGTGAATGGTACTTCGTGGATGTTTGATTTAGCTGTTAGAT
GCAGTTGATAGTTGACAGATGTCTAAACAACTAAACCATGATGTTTGATA
AAATTTTTAAGGACTAGCTTATAGCTAATGGGCTCCTATATGAGGCCTAG
TAGCTGCATTTCTTATTAACTCTACAATTAGAACTGTTTTTCATTAGCAT
TTTTTGATTTTATTTTTTATTTAGATGGTATTATGCTTTTAAATTTATAA
TTTTAACTTTAAAGTAAATTTTTACATCAACAAATTATTTAAAATTACAA
GACATAATAGATAAACTAAAAATACTATCAAATAGAAAAATTGTGATTTT
CATGTTCTAGGTTAAAAAGTTATATATATGCATGGGTAATATATTTTAAA
AATTACGTTTTCAATTATCATATATGTTGTATAATAAATTAATACTTCTA
TATTTATTTCGTTAATATAGTAAATTGATATATATCCTTATTATCTATTT
TACATACCAATAATAATAGTTAGACATAGTTTACCAAAAACTTTAGATAT
TTTAGTGAAGATCAGTTATTAGCTACCCGTTATAATAAGATAACTATCAG
CTGTATCCAACATCTAAAATGCTCTTCATTGTGCATGATGATCATTATTT
TTTGCAGAGAATGTAGTTGATGGGTTTGGGAAGGAACCAGTTTATTTTAA
ACTCAATCAGAAGCCTAATGGAGTTCATGAGGACAAAGAAGCTCAGAAAG
AGGAGTCGTATATGACGCTTAGTGGTCATAGAGCGGGTGAAGCTGCAATA
GTTTATGAACATGGGGCTGATATTGAAGCACTAATGCCAAAACTCCGAAG
ATCTGACTACTACACGGAGCCTCGAATCCAAGAATTGGCAGCTAAGGAAA
GGGCTGAACCGGGGTTCTGCCGCCATGTCAAGGACTTTGTGGTTGGACGA
CATGGTTATGGGAGCATTAAGTTCTTGGGTGAGACAGATGTTCGCCGGCT
TGATCTGGAGTCCCTTGTGCAATTTAATAATCGGGAGGTTATTGTGTACA
CAGATGACACGAAGAAACCACCTGTTGGACAAGGTCTCAATAAACCTGCT
GAGGTAACACTTCTTAACATAAAATGCTTTGACAAGAAGACTGGACGTCA
GTATACAGAAGGCCCAAAAATTGAGAAATACAAGGAGATGCTTAAGAGGA
AGGCTGAGGACCAAGGTGCTGAATTTGTGTCATATGACCCCATTAAAGGA
GAATGGAAATTCAGGGTGAACCATTTCAGCAAGTATAGCCTGGGAGATGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACTGGGTGGTTGTGCATTCTGCGAGAG
GCTTTTGTTAATCATGTGGGTTTGGAGGATTTTTATCTTGCGTTGTGCAG
GGGATCCTTTTTTCTTTGGGTTGTACTGGAGAGTCATATTTTGGATCTGT
ATAGGATTTTTATCAAATTGTGATATGTTAGTTTTGAGTGGTGTGATTTT
GTATAATGTGCTTTCTTATTGTTTCTCTCCATGTTCTCTAAAAAATATTT
CCTTTTTCCCCTTTGTAGGATTGTGATTTTATCTAGATTGCCATGTTTGT
GTCTCGGGTTTTGTTGTTAAAATGGTTAGCCTAAATAGTAAATACCTGTG
TGCCTGTTTATGTAA
back to top

mRNA from alignment at Chromosome01:425694..433708+

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G002100.1.v6.1 ID=Manes.01G002100.1.v6.1|Name=Manes.01G002100.1|organism=Manihot esculenta|type=mRNA|length=8015bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:425694..433708+ (Manihot esculenta)
TTTTTCGAAATAAAAGATATCTATCACGGGCATTGCAATTACATATTTTT ATATTGTCTGTTTCCATTTCAGTGCGGGATCGGTATTGAGTAACTGTTCT GATTTTGGAAGGAAGGATGTTTGGTTCTACTACTGGTATGTGCTTCCTTT TATATATGTGCGTATACATATATATTCATATTTTTTATGATTGGTTAGTA GCTGGTTTTATCTATTTTCATCCTAATTGCCTGTTCTGAGGGCTGTGATT TTATTTTTGTAGTCTTATCTTTTACATTGCTGGGGTGTTTGAGCTTGAAA TTAAACGCCTTTGTTCATCTCCAATATATTAAATCCATGGAAGATTGATC ATGGCTAAGCTATTTATTTTCACGTGCGTGCATCTTTCTGAATTGCACTG TTGGTCATAGTTAGAACTTAGAATGAAGCTTATTGACCGTTGCTTTCTTG GTTCCCTTCATTTACTCGTACATATTAAATATTTCAGTCACCTTTGGATC ATTTTTGAGTATGCAATGCATTTCCTGTCATAAGATTTTTCTTGTTTTTA TACACAATTTATTCTTTAATAATTTTATATTGATCAACTTAAATTTATGT GAAAAAATGTCATCTATTTTGGTAAACATATTAAGATTTTCATTTAATGA TAATTAATTATCTAGAAAATGGTCTTAGAATGGGATTCTTGGATAGGAGA AATCAAGATCCATTCCATTCAAATCATACTGCACTTATGCCTGCGTTATT TGCTATTCATTTGTTTTTTTTTTTGGTTCTATTATTTATTTTTTCTGAGA ACATTTATGTTTTCTTTTATCTTACGCCTTTAATTGTTAGAAAATCTTTG ATTATATCTTCTGGGTTTGTTGTCTGATTATGTTTGCTAACTTAGTTATG CTCTGGATCTTGTGTTGGAGTGGCTTATTTAAGGTTTTCACATGGCTTCA GGATGTGGAAATGTGCTTTTCCAAAACAGTCTAACAGTGCTTGTCCTGAC TTTTATTGAGCTTCTTTTATGGAATGTACTATTGTTTTGATGGAAATTTT ATATTTTTAGTATTTGCCATTTTCATTACATATGAATGTATATGTTCCAT GAAGATTATAGCTAATAGTGTTTGTATGCGTGACTCTGTGCGATAAACAT TCTGATACTTTGAATTTAATTTAACAGCTTTTGGGCAGTCATCTAGTAGC CCCTTTGGTTCCCAAACAGTATTTGGTCAAACAAGTAATGCCAACAATAA TCCGTTTGCTCCTAAACCCTTTGGTAGTACAACTCCTTTTGGTTCACAAA CAGGGGGCTCCATTTTTGGGGGAACTTCAACTGGCATGTTTGGTACCCCC CAAACTTCCTCACCTTTCTCTTCCACTCCTTTTGGCGCTTCATCTTCACC AGCATTTGGGAGCACTATGCCTACATTTGGAGGTTCTTCTTCTACATCTG CTTTTGGTAATTCATCAACTTCATTTGGTGGTAAGTATGCCGTAGATTTA ATTATACCATTAATTGTTTTTTTTTGTTATAACAACTCTGCTTCTTGTTG TTTACCTATGTTTCTTTTCTTGTATTTGTTGCATATAAACGTCTACATTT TGAACATTACCATCTTTTCTGATCTAGCAAATATAGACCATGTTTTATCA GGTAATGCATGCATGTTGGGTTAATGCGAACTTATTTGAATACCAATGGA CATTTATCCTGGAAGCCATTTTTTATGAACTATTATGAGAACATCATATG CCAGGAACGTATTCCAGGGAAAAACATGTATTTTAGGAGATGATAGTTAA ATGGCTGCATATTTCTCCAACGCTTTTCTTATTTTGTAAATATCCTCTTA GTTTTTATCTCTGTCTTTTGCTTATTTCTCTGTAATATTTTTAGGATGAT AGATTACTAGTTAATATTTATCTTCCCTTGTTTCATTTTGTCTATCCACA TGGGGAGATGCACAGTGTATATACATATGCATGGATATTCATTTTACTCC TATAACTATCTGCATCTGATATGTTCTTTACTCATTAGTTAAACTATATT TCTTACTTTATTTATTTCAATGTTTCATTTTCCATGTTTACCAAATGCAC TATTAATCTGTATATTTATCTCACTGGGTTGTTCCTGGTCTTCTAAACTG ACAACTATATGTATCACTGTAATTGTTTGTTAGGATCTTCTGTCTTTGGC CAGAAACCTGCTTTTGGAGGCTTTGGGTCTACTACTCAAACAAGTCCATT TGCAACTACAAGTCAGCAATCACAGCCTACTTTTGGTAGCAGCTTATTTG GTTCTACCACACCTTTTGGTGCATCAAGTCAGCCTGCTTTTGGTTCAACA GGTTCTCCCTTTGGTTCTTCCAGCACGCCTTCCTTTGGTACAAGCAGCAC TCCGGGCTTTGGTGCTAGCACTCCATCCTTTGGTACCACAAGTGCATTTG GGTCAACAGCGAGTCCAGCATTTGGTACGGGAACTGGATTTGGCGCGTCC AGCACACCAGTATTTGGATCTGGGGGCAGCTTTGCAACTTCAAGCACCCC TGCTTTTGGTGCTTCAGGTGCTCCTGGATTTGCAACTTCTAGCACTCCTG CCTTTGGGGCTTCAACTACTCCTGCCTTTGGGGCTTCAACTACTCCTGTC TTTGGGGCTTCAACAACTCCTGCCTTTGGGAGTACCCCTGCATTTGGGAC TTCAAGTACTCCATCCTTTAGCTTTGCATCCAGCCCAGGTTTTGGCCAGT CAGTGTCTGCATTTGGAAGCAGTCCATTTGGGACTACTACATCTCCCTTT AGTTCCCAGAGTTCACCATTTGGTAAGTTACTTTAAATATTCTATATTAT ATAATAGGACTGCTAAGCTTTGATGAACTATAAATTTTCAGTTTGCAGCC ACTATTATATCCTTTCTTCTTCCTTCCTATGAGAAGTAAAAATTGTGTAT ATATTGCATGAGTTATGTACATTTATGAGCTTGTATGTAGGATCCCAGGC TACAACAGCAACATTTGGGAACCCCGGATTTGGCCAGTCTGCATTTGCCG GAAATCGTGGGGGTAGCAGAGCAGTGGCTTACTCGGCGACAGCTGAGACA GACAGTAGTGGTGGGCAGCCTGGAAAGTTAGAGTCAATATCAGCAATGCC TGTGTACAAAGATAAAAGCCATGAGGAACTGAGATGGGAAGATTATCAAT TAGGAGACAAAGGTAGTGCATAGTAAATATGTTTGTGAAATCTGACATGT TTATTTTATAGATTTCTTTTTTCTAATAATAAATGCTACTTTACTAATAT TATATTTCCTGGTTTCCAATTGCAGGTGGACCACTTCCTCCTGGTCAAGC CTCTGCTGGGAATAACTTTGGTGTCTCTAGCGCACCAGCAAATCCTTTTG CTCCTTCAAATGCATTTACTCAGTCATCTTCTAGTCCCTTTTCTTCAACA ATTTCCTCCAACCCGTTTTCTACCAAACCTTTTGGAACCTCTAGTACACC TTCATTCAGTCCTTCACCTTTCACTGCAACACCGTCATCTAATCCTTTTC AGTCAACCTCAGCTTTTCCGTCCACTTCATCCACTGCATTTCCAGGCAGT GCAGTTCCATCTCTTTTTGGCACATCCAGCTCCTCTGCATTTGGTTCATC ACCATCCTTGTTTAATACAAGCACAGGACAAACAAGTTCATCACTATTTG GAAATTTTGCAAACACTCAGCCATCTCTCTCATTCCCATCCACTGCACCT TCAATTGGCCAGACAGGTTCTGCTTTTGGACAGGCTACCTCCGCTTTTGC TCCGAGTACCACCCCTTCTTTTACCCAATCTAGCATCTTCAATACTCCTA GTGGTTTTGCATTCTCTAGCACTTCATCTCTGATGTCTTCGACCAACCAA GGGGTGTTTGGTCAAGCAAGTGTGAGTAAATTAAGATCTTTATAATATCT CTGATTCTCTCTTTGTTAGTATCTTCAATTTCTCCACTATGTGACAAGAT TTTTATGTTCTGTTTGGGATATTGGGATGTAATCTTTCATTTCATATATT TTCTGTTGCCATTCCTATCCGTAGTTTTCTGCTGGGTGTTGTAAAGTATT GGAGTAGAATGTAAAATGTCAGAAATGAAAAGAAATCAAAGTCCTACTTC TGATTCATTTTTTTTTTTAACTACTGGGTGATTATCTACAAGGCTGGGGT TTGCACATTCATACATCCTTGAACTTGCATAGGTGTCTTTCGAGTTTTGG GTCTACTTAGCTTTATTCAACTGCTACATTTCTTTACTTGCAGTTGTCTC AGTCTACTCCTTTTCAACTCTCTCAACCTTCTCAGGCTACAAGTCTCCCT GGCTTTGGCAATTTTGGTCAGTCACAAGCAGGTATCTTCTTGTTTCTTTG CTCTTTTCTCTCTGCATTTTTATGATTCTCATGGTTATTAATGGAGGTTC TTGACTTTGCTTACTGTCTTCACAGCTGGCACAAGCGGATTTGCTGGTTC ATCAAGCATCTTTGGTCAGAGTACTTTTGGACAATTGTATGTCTTCCCTT AACTCTGTTAGTTTGTCTTCATGCATGCTTCCATCTTTTCATATCATTGC ATCTGATATGATTGGTTTGTTGTTAGTGTTCTTTTTATGTCGCAACATCC TGATTTGGTTCCTTCTTGCTTGTGTCAGTATGTGTACTCATTTATAATGT TCTTAATTTTTTCTGTCCTTTTTATGAACAGTGAAATGGATGTAATTTCA TTCTTGGTGTTCAGTACATCAATTTATGATTCATGCAAAGTAGTAAACAT GTTTTCTGTTTGCAGGTCTAATATTCAGAGTTCTGCTGCTGTACAGCCAG CACCTGTTACAAATCCATTTGGGACACTACCTGCAATGCCTCAAATGTCT ATTGGTCGAGCTGGGACTGCACCTTCAGTTCAATATGGGATTTCTAGCAT GCCTGTAAATCATTTGTCTTGAACTTTGTTTTCCGCTTAAGGAACTATTC AATTGCAAAATGATCTTTCATGTTCGTCTAACTTGGTACTTGAGCCATTA ACTTCAATAATTTGCACATGGAGAGAGAGATTGGGGGGGGGTATTTTTAT ACCTAAAACGATTTACTTCCATAAACTGGATAGTTGTGGTTTTGACTATT GATAGTTGTCTTCTAGGTGGTTGACAAACCTGCTCCTGTTAGAATATCAT CCTTGCTGACTGCTAGGCACCTGTCACAAAGACGAATCAGGTTACCCACA AGAAAATATAATCAAAAGCATGATGGTCCAAAGGTGAGGAATTTACTAAA GATTGGTAGATGAGCACAAATATACCTGCTTTTCTTTCACCTATAACTGT GGTCAGGAACGCATGTTAAGGGTGCACCGTGCACATCTGACTTACATTTT AGTCATGTACTTGAATATTGCATTCAGGTTCCATTTTTTAGTGATGAAGA GGAAACCACCAGCACGCCAAAGGCAGATGCTCTCTTTATTCCTCGGGAAA ACCCAAGAGCTCTAGTCATTCATCCTACAGACCAGTGGCCCATGAGGGCC AATGCAGAAAAAGCTTCTCCACTGAGAGATGCATCCACGCCAGTGTATGA AAATGGTAAGTCCTTTAAAAGGTCTATTATATTTTCTCTATGCTGAGGGA AATATATGAATATGTTCTTTCATTGTTATTTTTTTTTTTAATTCAATTGT CCAGGCAAGCATTCAGAAACTGTTGATGTTCCATCCTCAAGTGGTGCTGG TGGTAAAGATAGTAAGATTTCGTTGTTATTTTGACAGTTCTTATATGCAT TCTCATTCTTTTAATTTGCTCAAATTCCCTTGTGGTTATTTTACTTGTGT GAGAAGTTAGAAAACCGATTTGTAAAATTTGGATTCTTTTGGATCTGGTA ATAAGTATGGGCCCTGAACTTTTGATTGATAAAGGAAATCTTAACAATCT ATTAACACAATCCAAACTTTCGTATGAACCTCATGTTACTCACCCAATTA CTCGAGTGGCTACATCTAAATATGATGCTCTGTTGGGAGAGTATGGAGAA TCGAAGAACTTGGTTTATAGTGTCTTTCAGCTTCTCTCTTTTATTGATGA TGAACAGTTATGACAGTTTTTATTTGGCAATGTTCTTTTCTGAAACCTAA GTTCTCTTGGGGTGGTAAACTTTTTGAGAATGGATCTGAAGTTTATTAAA GATGTAAGATTGGCTAAGAATGTGTTATTCTAAATATTCACCGGAGCATT TTCAATATGCTTTGCAAGTCAACTAGTATTTCTTAACAATTTGAGCAAAG TTTTTTATTCAAAACCTAGGGTTTCAAAATACCCTATTCAAATGCAACCT CATGGTGTTTGTGAATGGTACTTCGTGGATGTTTGATTTAGCTGTTAGAT GCAGTTGATAGTTGACAGATGTCTAAACAACTAAACCATGATGTTTGATA AAATTTTTAAGGACTAGCTTATAGCTAATGGGCTCCTATATGAGGCCTAG TAGCTGCATTTCTTATTAACTCTACAATTAGAACTGTTTTTCATTAGCAT TTTTTGATTTTATTTTTTATTTAGATGGTATTATGCTTTTAAATTTATAA TTTTAACTTTAAAGTAAATTTTTACATCAACAAATTATTTAAAATTACAA GACATAATAGATAAACTAAAAATACTATCAAATAGAAAAATTGTGATTTT CATGTTCTAGGTTAAAAAGTTATATATATGCATGGGTAATATATTTTAAA AATTACGTTTTCAATTATCATATATGTTGTATAATAAATTAATACTTCTA TATTTATTTCGTTAATATAGTAAATTGATATATATCCTTATTATCTATTT TACATACCAATAATAATAGTTAGACATAGTTTACCAAAAACTTTAGATAT TTTAGTGAAGATCAGTTATTAGCTACCCGTTATAATAAGATAACTATCAG CTGTATCCAACATCTAAAATGCTCTTCATTGTGCATGATGATCATTATTT TTTGCAGAGAATGTAGTTGATGGGTTTGGGAAGGAACCAGTTTATTTTAA ACTCAATCAGAAGCCTAATGGAGTTCATGAGGACAAAGAAGCTCAGAAAG AGGAGTCGTATATGACGCTTAGTGGTCATAGAGCGGGTGAAGCTGCAATA GTTTATGAACATGGGGCTGATATTGAAGCACTAATGCCAAAACTCCGAAG ATCTGACTACTACACGGAGCCTCGAATCCAAGAATTGGCAGCTAAGGAAA GGGCTGAACCGGGGTTCTGCCGCCATGTCAAGGACTTTGTGGTTGGACGA CATGGTTATGGGAGCATTAAGTTCTTGGGTGAGACAGATGTTCGCCGGCT TGATCTGGAGTCCCTTGTGCAATTTAATAATCGGGAGGTTATTGTGTACA CAGATGACACGAAGAAACCACCTGTTGGACAAGGTCTCAATAAACCTGCT GAGGTAACACTTCTTAACATAAAATGCTTTGACAAGAAGACTGGACGTCA GTATACAGAAGGCCCAAAAATTGAGAAATACAAGGAGATGCTTAAGAGGA AGGCTGAGGACCAAGGTGCTGAATTTGTGTCATATGACCCCATTAAAGGA GAATGGAAATTCAGGGTGAACCATTTCAGCAAGTATAGCCTGGGAGATGA AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACTGGGTGGTTGTGCATTCTGCGAGAG GCTTTTGTTAATCATGTGGGTTTGGAGGATTTTTATCTTGCGTTGTGCAG GGGATCCTTTTTTCTTTGGGTTGTACTGGAGAGTCATATTTTGGATCTGT ATAGGATTTTTATCAAATTGTGATATGTTAGTTTTGAGTGGTGTGATTTT GTATAATGTGCTTTCTTATTGTTTCTCTCCATGTTCTCTAAAAAATATTT CCTTTTTCCCCTTTGTAGGATTGTGATTTTATCTAGATTGCCATGTTTGT GTCTCGGGTTTTGTTGTTAAAATGGTTAGCCTAAATAGTAAATACCTGTG TGCCTGTTTATGTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at Chromosome01:425694..433708+

>Manes.01G002100.1.v6.1 ID=Manes.01G002100.1.v6.1|Name=Manes.01G002100.1|organism=Manihot esculenta|type=CDS|length=3123bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:425694..433708+ (Manihot esculenta)
ATGTTTGGTTCTACTACTGCTTTTGGGCAGTCATCTAGTAGCCCCTTTGG
TTCCCAAACAGTATTTGGTCAAACAAGTAATGCCAACAATAATCCGTTTG
CTCCTAAACCCTTTGGTAGTACAACTCCTTTTGGTTCACAAACAGGGGGC
TCCATTTTTGGGGGAACTTCAACTGGCATGTTTGGTACCCCCCAAACTTC
CTCACCTTTCTCTTCCACTCCTTTTGGCGCTTCATCTTCACCAGCATTTG
GGAGCACTATGCCTACATTTGGAGGTTCTTCTTCTACATCTGCTTTTGGT
AATTCATCAACTTCATTTGGTGGATCTTCTGTCTTTGGCCAGAAACCTGC
TTTTGGAGGCTTTGGGTCTACTACTCAAACAAGTCCATTTGCAACTACAA
GTCAGCAATCACAGCCTACTTTTGGTAGCAGCTTATTTGGTTCTACCACA
CCTTTTGGTGCATCAAGTCAGCCTGCTTTTGGTTCAACAGGTTCTCCCTT
TGGTTCTTCCAGCACGCCTTCCTTTGGTACAAGCAGCACTCCGGGCTTTG
GTGCTAGCACTCCATCCTTTGGTACCACAAGTGCATTTGGGTCAACAGCG
AGTCCAGCATTTGGTACGGGAACTGGATTTGGCGCGTCCAGCACACCAGT
ATTTGGATCTGGGGGCAGCTTTGCAACTTCAAGCACCCCTGCTTTTGGTG
CTTCAGGTGCTCCTGGATTTGCAACTTCTAGCACTCCTGCCTTTGGGGCT
TCAACTACTCCTGCCTTTGGGGCTTCAACTACTCCTGTCTTTGGGGCTTC
AACAACTCCTGCCTTTGGGAGTACCCCTGCATTTGGGACTTCAAGTACTC
CATCCTTTAGCTTTGCATCCAGCCCAGGTTTTGGCCAGTCAGTGTCTGCA
TTTGGAAGCAGTCCATTTGGGACTACTACATCTCCCTTTAGTTCCCAGAG
TTCACCATTTGGATCCCAGGCTACAACAGCAACATTTGGGAACCCCGGAT
TTGGCCAGTCTGCATTTGCCGGAAATCGTGGGGGTAGCAGAGCAGTGGCT
TACTCGGCGACAGCTGAGACAGACAGTAGTGGTGGGCAGCCTGGAAAGTT
AGAGTCAATATCAGCAATGCCTGTGTACAAAGATAAAAGCCATGAGGAAC
TGAGATGGGAAGATTATCAATTAGGAGACAAAGGTGGACCACTTCCTCCT
GGTCAAGCCTCTGCTGGGAATAACTTTGGTGTCTCTAGCGCACCAGCAAA
TCCTTTTGCTCCTTCAAATGCATTTACTCAGTCATCTTCTAGTCCCTTTT
CTTCAACAATTTCCTCCAACCCGTTTTCTACCAAACCTTTTGGAACCTCT
AGTACACCTTCATTCAGTCCTTCACCTTTCACTGCAACACCGTCATCTAA
TCCTTTTCAGTCAACCTCAGCTTTTCCGTCCACTTCATCCACTGCATTTC
CAGGCAGTGCAGTTCCATCTCTTTTTGGCACATCCAGCTCCTCTGCATTT
GGTTCATCACCATCCTTGTTTAATACAAGCACAGGACAAACAAGTTCATC
ACTATTTGGAAATTTTGCAAACACTCAGCCATCTCTCTCATTCCCATCCA
CTGCACCTTCAATTGGCCAGACAGGTTCTGCTTTTGGACAGGCTACCTCC
GCTTTTGCTCCGAGTACCACCCCTTCTTTTACCCAATCTAGCATCTTCAA
TACTCCTAGTGGTTTTGCATTCTCTAGCACTTCATCTCTGATGTCTTCGA
CCAACCAAGGGGTGTTTGGTCAAGCAAGTTTGTCTCAGTCTACTCCTTTT
CAACTCTCTCAACCTTCTCAGGCTACAAGTCTCCCTGGCTTTGGCAATTT
TGGTCAGTCACAAGCAGCTGGCACAAGCGGATTTGCTGGTTCATCAAGCA
TCTTTGGTCAGAGTACTTTTGGACAATTGTCTAATATTCAGAGTTCTGCT
GCTGTACAGCCAGCACCTGTTACAAATCCATTTGGGACACTACCTGCAAT
GCCTCAAATGTCTATTGGTCGAGCTGGGACTGCACCTTCAGTTCAATATG
GGATTTCTAGCATGCCTGTGGTTGACAAACCTGCTCCTGTTAGAATATCA
TCCTTGCTGACTGCTAGGCACCTGTCACAAAGACGAATCAGGTTACCCAC
AAGAAAATATAATCAAAAGCATGATGGTCCAAAGGTTCCATTTTTTAGTG
ATGAAGAGGAAACCACCAGCACGCCAAAGGCAGATGCTCTCTTTATTCCT
CGGGAAAACCCAAGAGCTCTAGTCATTCATCCTACAGACCAGTGGCCCAT
GAGGGCCAATGCAGAAAAAGCTTCTCCACTGAGAGATGCATCCACGCCAG
TGTATGAAAATGGCAAGCATTCAGAAACTGTTGATGTTCCATCCTCAAGT
GGTGCTGGTGGTAAAGATAAGAATGTAGTTGATGGGTTTGGGAAGGAACC
AGTTTATTTTAAACTCAATCAGAAGCCTAATGGAGTTCATGAGGACAAAG
AAGCTCAGAAAGAGGAGTCGTATATGACGCTTAGTGGTCATAGAGCGGGT
GAAGCTGCAATAGTTTATGAACATGGGGCTGATATTGAAGCACTAATGCC
AAAACTCCGAAGATCTGACTACTACACGGAGCCTCGAATCCAAGAATTGG
CAGCTAAGGAAAGGGCTGAACCGGGGTTCTGCCGCCATGTCAAGGACTTT
GTGGTTGGACGACATGGTTATGGGAGCATTAAGTTCTTGGGTGAGACAGA
TGTTCGCCGGCTTGATCTGGAGTCCCTTGTGCAATTTAATAATCGGGAGG
TTATTGTGTACACAGATGACACGAAGAAACCACCTGTTGGACAAGGTCTC
AATAAACCTGCTGAGGTAACACTTCTTAACATAAAATGCTTTGACAAGAA
GACTGGACGTCAGTATACAGAAGGCCCAAAAATTGAGAAATACAAGGAGA
TGCTTAAGAGGAAGGCTGAGGACCAAGGTGCTGAATTTGTGTCATATGAC
CCCATTAAAGGAGAATGGAAATTCAGGGTGAACCATTTCAGCAAGTATAG
CCTGGGAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACTGGGTGGTTGTGC
ATTCTGCGAGAGGCTTTTGTTAA
back to top