Manes.01G015800.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G015800
Unique NameManes.01G015800.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length12679
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:2595466..2608144 -
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
AncestorIdentifiercassava4.1_002211m.g.v4.1
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G015800.1Manes.01G015800.1.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G015800.v6.1 ID=Manes.01G015800.v6.1|Name=Manes.01G015800|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=12679bp
AAATTATAATAAATGGGGAGATTTCCAAATTCAAGATTTATTAACTATTA
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TCCGCACACCGTCAACTTCATTTTTTACACTGGGAGTACTCGTCTAGTTT
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TTCTTGGCTGCAAAAATCCCAAATGTCCTTAGATTTTTGGATCCAATGTG
CAGTCTCAATGCCAAGATTGCGAATCCAGTAGCCAAAATTGTACTCAGAC
ATGTCCTCCGTATATAATTCAGTATGGGTTAGGCTCCACAGCAGGACATT
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TGGTTGCTCCATCATCTCCACTTGCTGACCTGAAGGAATTGTTGGGAAGG
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TGTTTATGCTGTCTGTTATATTGCACACTGTTTTTCCTTCCCTTGGCTCC
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TTCAGCTGAACTTCGCCTGCTATCCCAAGTTGCTTTTGATGGACGAGGAG
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GGCGCGAGAAAAAGGAACTTCACCTTCAACGTAAGCTGACGGAGACGGGA
TTCAACCCACCCTTTCCAGTTTCTTAAATCATCTTCATTTTCTGCATTAA
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AAAAGTGTATCCCAATCAGCCTTGTTTGCCTCCATAGCCTGCAAGTACCA
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ATGCCTAATGAAATACATGCCACATAAAACATAAACCACGAAACGAACTG
ACCCTTCTCTTTTATAAGTCTCCAAAAATAAATAGACAAATAAGAAGGGC
TCGCTTGTCCACCCTTGACCAATAATAGAAAGCAAAAGAAAGAATTATAC
TCTAATTGGATCCATTTGGGAAATCAGCAACCGCCTAGTTGTTAGAGATA
AAGATTTTAACACCCTCAATTACTAAGACTGGGAAACAAGCCCAAAGTTT
AAAGCATAAAAAAAGAGCATAATGCACAGGTTGATATATATATAATAGTT
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AAGAAAGTCAAGATTCCATGAGAAATTAATTGGAAAAAAAAATGGGAAGG
GAAAAAAGAAACAAGAAAAGGGAAACAAAGAAAGAAGACAGTAGAATACT
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TTATAAATCACAAAATCATACCTCACAAATCTCATTCCCCCTTTGAAACT
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TGGATTTCTTCTAGGGTCCCAGACCTGAAGACCAAGAGATTTTTCTTCAA
TGGCACAGAGCATGACAGGATTTGGCCAACGCCACTGAGTATATACCCTG
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GAAATTCTGCAACTCAGGAAAAGAAACAAAGTTAGAAACAAGAAATATGA
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CTATCAGCCAACAAGCATGCAAAACCTTTATGCTTTGAACTTGAATATTT
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TCATGAAGCACAAATAACTCCCTGGTTCTAATATTAAGAGAATAAAAAAA
AAACACAATAATTTTGTTATTAATTGAAATTTTTTATTAAATACAGGTGT
CAGGAAATGCAAGGAGAAAAGGAGACAAGGACTAATAAGGAGCTCTCTAG
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CCTTTTCCCAGCCAAAAATTCCAGTAATTCTCCCTTGGAAAATCCCCATC
TAGTCCTCCTTTCTCCAATGCCCAGCTGAATTTTCTTGTTTTTCCAAAAT
TATGGGTCAAAGAATCAAGTCTTTGTACTGCTGTTCTCACCACTACAGCC
TCTCTGACGTCACCCACTCACTGGATTCTTTCATTACCTTTTGATAATGC
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CTGTTTCATAATGGTAGACCTTAGCCATGTATTCCAGTTTTTGGTACATA
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TCTTGTGCCTTCAAATTCAGGATACTTGTTGAGTTTTAAGTTGCAGCAGT
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TCTTTTTGGAAAATTTTCTTCTACGACCCCCTTTTTTCTAATTTAATTTG
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GTTGCTCAATGATACTTTTGATTATTTATTTATTTATCTATTTTTCATTT
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TATGATATTTACTTGGCTTAAATGTTTCTTAGCACTTTCATTTATTTTGT
TTTTATTAAATGGCTGCAGTAGTACTTGATATTATTTTGGGAAATAAATT
TCCTTTCAGTTGCCAAACGTAAAAAGATCCAAATATTTGCTGCAGTTACT
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AAACAACCTTTTCCTTTTTTTGGCTACTCACTATGATTCTAGCATTCATG
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AATGGTCTATACTTGTGACAAAAGCTTAAATTGAAATACATAAGCTGTGC
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AATAGGCACACCTCAGTTATGCCAGCTCAAAAAGAGCCAGTGACCCATAC
AATTTCCCATAAGTCATGACCCATATAGAGCCAAAAGAAACAAAGACACA
AATAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGAGGAGGATGAGGAGGATATATGT
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ATCCTGGGCTTGAATTTTCCTTTTGTTTTCGTTCCTTCATGCTCCTTCCC
TCCACCCACTTGGTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTTGCATGAATTCATGCTGTCATGCTGCCCTTTTTTTATACC
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ATTATTGTTTTAACAGAAATTTCTTGTCTCTACCATTGTATCAGATGGCA
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ATACATACAAACAAAGGTGAAATAAATCAGCTAGCTCAATATAGAGCATC
AAATGACAGCATCCTTCTTTTCTCCCCCTCAAGATCCAAGCCAGAATTCA
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ACCCAATTCTTCACAATCTGTTCCATTTTATATTATCAACAGAACATATT
TTAGAAAGCAGAAAAGAGACAAATTAAAAGTTGCTTTATTAAATTCCCAA
GAGAACATAGTGAACTTCAACAAACGAAGAACTATATATATATATATTTC
AACCTGGTCCAGCCTCCCAAGCACTTCCTCTCTACTCACAGCTTCCTCCC
TACTCTCATACAGTCCCACATCCTGCAAAAACTGGACAGGCAAAACATAC
TCAAATATTTTTAGAACTACTACTTTGAAAAGATCACAATAAGGAAACAA
AATAAAACAAACCACAAATGAACCTTTTCAAGTTCTCGGGTCTTTATCTC
ATCGTACTCTGTTGGACCACCCAAGGAAATGGGTTCTGTAATGCCTAATC
GCTGTTGCTGTCCACCATTATTTCCAGTGCTTAATCCTGGACTCCCCATA
CGCAACTCTTTTCACAAGTTTTGTTACTCTTCTGTTTTTCCCTTTTTCTT
TTTCTTTTAATTTTCTACTTTTCTCTCTTTCTCTTAGCTTTTGAATATGT
GTATATCAGGCACAAAATTTATTCATGATATCTTCCACACACATGTTAAA
AGAAAAGGAGAAACAAAATAAGAAAGGGGACAAAAAACTAAGAATGAAAA
AATAATTGTTGACTGTACAGTACTTGGGAGAAGACTGCTACCATAATTTT
GGACCATAACACAAGCAACCCCGAAACTCTCTTAAAGCATACACAAAAAA
AGAAAACAGCAAACCCTAAATTCAATTGTATTATAAATATAATATAACCA
TAAGAACAGAATACAGCAGAATTTAGGGCGTCCCGAATGGGGAAGAAAAC
CCTAAACCTAATTTAATTTAAACAGCAGAGCTCAAATATACACAGAAAAG
GGGGCGAAACTAGCGCTGTCACTTTATTAAGGATCTGTTCCTGTTCTGGT
GAAATTTTCCGACCATGGCGAACAATTGAGTCTCAGAGCTTCAAATGGAA
CCTGAAAATGATACACTGTCAGATACACATACACCTATCCATAACACGCA
GAGAAAGGGGGAGACGCTCACTCTGAGACGCGGAAAGAAATAGCCAATGA
GTTGATCGGGAGAGGTTGCCCTTAATGATTTTTCCTTTTCTTTGGGCAAG
TATAAAAAACTCTTGGTTTCTTTGGTTTT
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gene from alignment at Chromosome01:2595466..2608144-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G015800.v6.1 ID=Manes.01G015800.v6.1|Name=Manes.01G015800|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=12679bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:2595466..2608144- (Manihot esculenta)
AAAACCAAAGAAACCAAGAGTTTTTTATACTTGCCCAAAGAAAAGGAAAA ATCATTAAGGGCAACCTCTCCCGATCAACTCATTGGCTATTTCTTTCCGC GTCTCAGAGTGAGCGTCTCCCCCTTTCTCTGCGTGTTATGGATAGGTGTA TGTGTATCTGACAGTGTATCATTTTCAGGTTCCATTTGAAGCTCTGAGAC TCAATTGTTCGCCATGGTCGGAAAATTTCACCAGAACAGGAACAGATCCT TAATAAAGTGACAGCGCTAGTTTCGCCCCCTTTTCTGTGTATATTTGAGC TCTGCTGTTTAAATTAAATTAGGTTTAGGGTTTTCTTCCCCATTCGGGAC GCCCTAAATTCTGCTGTATTCTGTTCTTATGGTTATATTATATTTATAAT ACAATTGAATTTAGGGTTTGCTGTTTTCTTTTTTTGTGTATGCTTTAAGA GAGTTTCGGGGTTGCTTGTGTTATGGTCCAAAATTATGGTAGCAGTCTTC TCCCAAGTACTGTACAGTCAACAATTATTTTTTCATTCTTAGTTTTTTGT CCCCTTTCTTATTTTGTTTCTCCTTTTCTTTTAACATGTGTGTGGAAGAT ATCATGAATAAATTTTGTGCCTGATATACACATATTCAAAAGCTAAGAGA AAGAGAGAAAAGTAGAAAATTAAAAGAAAAAGAAAAAGGGAAAAACAGAA GAGTAACAAAACTTGTGAAAAGAGTTGCGTATGGGGAGTCCAGGATTAAG CACTGGAAATAATGGTGGACAGCAACAGCGATTAGGCATTACAGAACCCA TTTCCTTGGGTGGTCCAACAGAGTACGATGAGATAAAGACCCGAGAACTT GAAAAGGTTCATTTGTGGTTTGTTTTATTTTGTTTCCTTATTGTGATCTT TTCAAAGTAGTAGTTCTAAAAATATTTGAGTATGTTTTGCCTGTCCAGTT TTTGCAGGATGTGGGACTGTATGAGAGTAGGGAGGAAGCTGTGAGTAGAG AGGAAGTGCTTGGGAGGCTGGACCAGGTTGAAATATATATATATATAGTT CTTCGTTTGTTGAAGTTCACTATGTTCTCTTGGGAATTTAATAAAGCAAC TTTTAATTTGTCTCTTTTCTGCTTTCTAAAATATGTTCTGTTGATAATAT AAAATGGAACAGATTGTGAAGAATTGGGTCAAAGCGATTAGCCGCTCAAA ATGTTTGAATGAGCAACTAGTACAAGAAGCAAATGCTAAGATTTTCACCT TTGGTTCTTATCGGCTAGGGGTATTCTTCCACTCTTTTCATTCTCAGAAA TCATTTCCAATTGTCAATTTTCTTATACATGAATTCTGGCTTGGATCTTG AGGGGGAGAAAAGAAGGATGCTGTCATTTGATGCTCTATATTGAGCTAGC TGATTTATTTCACCTTTGTTTGTATGTATATGGATTAGATAGAAAGCTAT TGTCATGCAATCTGCTCACGATGTCAGCTGGTTGTGTAGTTTTTTAGTGA TACTGTTAATATCATTTTCATTTTCCCTTATTCCATCTTCAAGCCTTAAG ATTGTGAACTTCCATTTGACATATTTTTGAGATGTGTGTAATTCAATCTC TTATAAATCCCTGTTTCTGAAAGGTAACTGCAATATATAAATGTGAGAGA TTGAAATCATATCTAGGGAATGTGCACTAAGTGGATTCATGGTCATTATT TTAACAGTTTGTTAAGCTACCATGTCAATGTTAATGCGATTCCTGCACCT TTGACATGTAAAGGTTGAGGTCCTGTCCCTGAGCTTAGTGTGTGTGTGTT TTATCTCTGACAAAAAAAAAGGTTGAGGTTCTGCTATTGACCTCTTTACC TTCACAGTTGGGTTTTCTCTAGATCATAAATTTTGGGATTTTTCCTTTAA 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