Manes.01G015300.v6.1 (gene)

Overview


Name	Manes.01G015300
Unique Name	Manes.01G015300.v6.1
Type	gene
Organism	Manihot esculenta (Cassava)
Sequence length	4280

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
Chromosome01	chromosome	Chromosome01:2497340..2501619 +

Analyses

This gene is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)	2015-07-22

Properties


Property Name	Value
AncestorIdentifier	cassava4.1_009288m.g.v4.1

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Manes.01G015300.1	Manes.01G015300.1.v6.1	Manihot esculenta	mRNA

Sequences

The following sequences are available for this feature:

gene sequence
gene from alignment at Chromosome01:2497340..2501619+

gene sequence

>Manes.01G015300.v6.1 ID=Manes.01G015300.v6.1|Name=Manes.01G015300|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=4280bp
ATAGCAAATAAAGAAAGCAAAAGCTCTTTAATGGATTCCAGAGTCTTGAG
TCTTGTGCTCTTTCTTTGTTAAGCAATTGACCATCTTTCTTTTCTTTTAT
TTTCTTTTCTCTCCTTTCCTTTCTTTTCCTTTCCAACAAACAACAAAGAC
AAACACTAGCCCACCTAACTACACCCTCTTTCAAATTAATCTCAAAGGTC
CCTTCTTTACTATTTCCATTTTCATTTTAATTTAAAAAATCTCAATAAAG
AGACAAACTCATCAATGCTAATCAAAATCTCTTCTTTTTCATCGCATAAT
AACTAAAAAACAAATCTCTTCCTCATTCCCTATCTCTTTTACTCTCTCTG
AAGCTTAATTACTTGTGATTTTCCTTTTCTTTCTGTTTGTTTCTCTGTAA
AATCATGCCTGTTTTTGCAGAGAGTTCATCCACTATAGCAGACCAAATCA
AGCTAAGAAAACCCAGAAACCAATTCCATCACCATCATCAGCAAGAAGAA
AATCCCATTTCTATACAAGAAACAGATCCAAACCCACATATCTCTCGCTC
CTCCAAATCCACAATCTCCTCTATTTTCCTTTCCCCTTTCTCCACAAACA
CCGCTGAGCCCACCACCAAGAAAAAGAGCACCACATTCAGAGGTTTAGGA
TGCACCGCTGGGGCCGCGCAGCAAGTGTCGGTGCCGGCGATGATACGGTC
ATCGGCGGAGTGGGAGGGGAAGAGGCTGAAGAAGAAAAATAATCTGCAGC
GGCAGAAAAGGAAGAAAGACAATATAAGGATTTGCGGTGAGAGTAACAAA
CCAAGCTTGCAGGGTCTGGGTGAAGGGAGCAACAGCAATGGAAACAGCGA
CAACAATGGGAATAGTGGGAGTTTGAATCCTGGGAGTTGTTTGGTTATTC
AGGATGTGTGGTGTGGCCCTGGAATTGGGTTTTCTTCGGATGCTGTTGTT
GGGTCTGTGGATTGTGTTGTGGGGAGGAGAAATGCGTCTGGGAGAGGGAA
GATTGATGGGGACAACAACAAAATCAATCAAAGGGAGAGGGAGGTATACT
TTTAATGCTTCTTTCTTTGACACTTCACATCACTTCACTTCATTTTCTTG
CTTTCTTGTACGTATAATGCAGCTATGGCCAGGTATAGTATGGATGCTGA
CAGATTCTCAATTGGAAAACATCTATCTATATAATAAAAGGTTCAATTTG
TGTTTGATCTCAGGAGGGTTATTGACTTTCTGCTCGGCAATTGATCTAAG
ATTTAATGCATTTATTGCTGTTATTCAACAAAATTTATTTTGGGTTTGAA
CTAAGTTATTTTGAGGGGCAGTTGATCGAGTTAATTGCTTGATTTATTTA
CTACCAAAATCTATCCTATAATTATGATATTGGGTTGCTTTTTATTTTTG
ATTTTTCTGCTATTTATTAATGTCTTGTTTGGGATTGCAGGGGCTGGTAA
ATCCCAATACCAATCTCTTTAGAAAAGTATTAGGGTTTTCTAAACTTTCA
TCTATTAGATATCAATCCATAGTTTATGAGTGTAATTAGCATCAGTATTA
GTGTTATATTTTTGGGTATCATCACCATTGGAGTCCAAGATCCCTTTTGC
TTCTATTCTGTTCTTTCCACCTTCCCTGTTTTCTCATTGTTCTATGTAAA
TTACTTTTTCTTTTGATGGTGGTGGTGGTAGTGTGTGTGTTTTCTTTTTT
GAGAGGATGGGGGCTCTGCTATGTGCTATTGTTTTATTAATCTCTGTATG
CGTGCACGTATGATCTTACATGGTTAATGACAAAAAAAAAAATTCTATGG
GGCTAAAATTGCGGACCCTACCATATCAGCTTAACTGTTAACTTATACGG
AGATTGTTGATAAGTACCGCAGGTTTTAGAATTAGAGGACACACTTCTCT
CGGGTGTTGATTTTCTTGGCTTCATATTTAGATTGTTTTTTCTTGGATTC
ACTTCTTGTTTAGGTTTGTTTTTCATGTGCAGAGCTAAGAATTTGATTTT
CTTCTGCTTAACTGTTCACTTTGTGCATGTAGTTTTTGTGTTTATGACTT
ATTTTTGTATGTAGCTTATTGTGTCCTGTGAATCTTGTCAGCGCTCTGCA
TATTTAGGGAGGCGGGCCACAGTGAATCCTGAAACTCTTCCTTTTCTGGA
TACGGACCCTGCTTTTGTAGCATCTTACCCTGAATCTGAAGTCTTTGGAA
GTAGATATTACCGGCATGTTCGGCATCCTTCTCCTGATGGTTTAGCTGAG
GTGTGCCCATTGCTTAAAGTTTTTCTACTCTAATGTCTCTGTGTGTCATG
TTATCTTGGCGTGCTTGTGCTTCCACTGGGTGATCAGAGAGCACTGCATT
ATGAATAGGTGTTGATTATTATGGTGGATAGGCTGATTTTCTCATGGAAA
TGATTTTTCTTTATTGAAACATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATATATTA
GATAACTAAATTTGATTTTTAATATACAACAACAGCCCTCAACTTAAATT
TAATGATTTCTTCTGTACTTCTTGTCATAGGGGAGTGAAGAGGATGGAGA
ATTGTTACTTTTATCTTTTTTAATCTCCACTGTTATCCTAGTGTCAATTT
TTCTCAATTTTCAATTTCTTGTTGGAGAGGGGGAGAGATAGAGATTGTTT
CTGGGTTAACAGTTTGAGGGCCAGCTAGCAACCAAGTTGTGAAAACGGAA
GTGAATCCTCTATAACCCTGATGTTTGATATTGATCTGCTTAGAAGAAGA
AACTATTACGATTTAAAGTGTTCAAAGCTTGTAAGCTGTTTCCTTCTTTC
ATCTTGCTTTGTCAAATATTGCAACATATAATTCTACCCGGGNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGTTAAAGGGTGATGTTTCAATGGGACATAACGATATC
CTAAAGATTGAAACAAGAACTCAAAGATGGGCTAAGAAATGACACTTTGC
AGGTATTCCGTAATGACATTGCTGGTTGAATTCTTAGTTTGCATTAGTTT
ATTTGCCTACATTGTTTAGGATTTTGATCATTCGTAAGCTACAAACCGAG
TTGTATCATGACTTGCGGATTAGGACAGGGCAAGTTGAAGTTTTGTTTCA
GTTCACTTATTCCTAACTTTGGCCAAAGAAATTAAGATGTCTATGATCTT
TTCTAAAAAAATTATTTCTTAAAGGTTTGGTGAATGAGTTATAACTTATA
ATTAAGAGTCTGTTGGGTGGAAGCTTTCAATCATATGTTTCTTAAATTGC
TCTTTGGAATATTTCTTCTTGGAATTTAAGACAATTTAAATCCCCTTTGC
TAAATTGCAGATAATGATGCTCCAGAATAGTTTTATGATGGGAGGAAGGT
TGGATAGATATAGCGACTGGAGGCTCGATATCGATCACATGTCATATGAG
GTAGTTTATATCCCTTTAGTTGCCTTTTATTTCGATTATACTTCCTGGCA
ATGGTGTGTCGGGCTACTGAGTGCAAATCGGAGGGGTTCGGTTCTTCCGG
TGGGCAATTTTGTAAGTAAAATGCTGAAGAGTGGGAGTGGAATTGTATTG
TGGGAACCCCTTTTTCAGTCTCTGCTTAAGCTTGTCCACCAGGCTCACTA
TAGCTATGTTATATCACGCAATGCTGGTAAAATAATTTAGAATTTCTTTG
TCTTGGTGCTAACAGCAACTGCTGGAGTTAGGTGAGAGAATTGGTCATGT
GAGTACTGGACTGAAAGAAGATGAAATGAGCCAATGTGTCAGGAAAATGA
AGCTCTCAATTATCAACGACCTTTCATCACATTTACCCATAATACCGGAT
AAGAACTGCAGCATTTGTCAGGTAATACTTCCAGCATCATATTTCATCTC
TCATTTCTTTAATTATCTCATCATTGCTCTCATTTACACGTCTATATACA
GGAGGATTATGAAGCAGATGATGAGCTGGGGAAGCTGGATTGTGGACATG
GCTTTCACATGCAATGTATAAAGCAATGGCTTGCACAGAAAAATATTTGC
CCGGTTTGCAAGACTGAACCGGTGGCTCGAGGATAAAGCCGGTGTTCTTT
CATTATCGTCTTGGATGTAGTTCTTTCAGATTGCTGCTGCTCTTTAGTCC
TCTCCTCGTCTCCCAACATGGTGTATAGATTTTACCAGTATACATAATCT
GAATTCATTCATTGGTGTGAAGCTTCAAATTTTTGAGTTGAAATGATAGG
GGTCCGGACGATTTAGCAGTTCATGCTTATTGAAATTATAGTACTGGAAT
TTTTATGGAAATGATTTATTTTGATATTCA

gene from alignment at Chromosome01:2497340..2501619+

Legend: mRNA

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Manes.01G015300.v6.1 ID=Manes.01G015300.v6.1|Name=Manes.01G015300|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=4280bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:2497340..2501619+ (Manihot esculenta)
ATAGCAAATAAAGAAAGCAAAAGCTCTTTAATGGATTCCAGAGTCTTGAG
TCTTGTGCTCTTTCTTTGTTAAGCAATTGACCATCTTTCTTTTCTTTTAT
TTTCTTTTCTCTCCTTTCCTTTCTTTTCCTTTCCAACAAACAACAAAGAC
AAACACTAGCCCACCTAACTACACCCTCTTTCAAATTAATCTCAAAGGTC
CCTTCTTTACTATTTCCATTTTCATTTTAATTTAAAAAATCTCAATAAAG
AGACAAACTCATCAATGCTAATCAAAATCTCTTCTTTTTCATCGCATAAT
AACTAAAAAACAAATCTCTTCCTCATTCCCTATCTCTTTTACTCTCTCTG
AAGCTTAATTACTTGTGATTTTCCTTTTCTTTCTGTTTGTTTCTCTGTAA
AATCATGCCTGTTTTTGCAGAGAGTTCATCCACTATAGCAGACCAAATCA
AGCTAAGAAAACCCAGAAACCAATTCCATCACCATCATCAGCAAGAAGAA
AATCCCATTTCTATACAAGAAACAGATCCAAACCCACATATCTCTCGCTC
CTCCAAATCCACAATCTCCTCTATTTTCCTTTCCCCTTTCTCCACAAACA
CCGCTGAGCCCACCACCAAGAAAAAGAGCACCACATTCAGAGGTTTAGGA
TGCACCGCTGGGGCCGCGCAGCAAGTGTCGGTGCCGGCGATGATACGGTC
ATCGGCGGAGTGGGAGGGGAAGAGGCTGAAGAAGAAAAATAATCTGCAGC
GGCAGAAAAGGAAGAAAGACAATATAAGGATTTGCGGTGAGAGTAACAAA
CCAAGCTTGCAGGGTCTGGGTGAAGGGAGCAACAGCAATGGAAACAGCGA
CAACAATGGGAATAGTGGGAGTTTGAATCCTGGGAGTTGTTTGGTTATTC
AGGATGTGTGGTGTGGCCCTGGAATTGGGTTTTCTTCGGATGCTGTTGTT
GGGTCTGTGGATTGTGTTGTGGGGAGGAGAAATGCGTCTGGGAGAGGGAA
GATTGATGGGGACAACAACAAAATCAATCAAAGGGAGAGGGAGGTATACT
TTTAATGCTTCTTTCTTTGACACTTCACATCACTTCACTTCATTTTCTTG
CTTTCTTGTACGTATAATGCAGCTATGGCCAGGTATAGTATGGATGCTGA
CAGATTCTCAATTGGAAAACATCTATCTATATAATAAAAGGTTCAATTTG
TGTTTGATCTCAGGAGGGTTATTGACTTTCTGCTCGGCAATTGATCTAAG
ATTTAATGCATTTATTGCTGTTATTCAACAAAATTTATTTTGGGTTTGAA
CTAAGTTATTTTGAGGGGCAGTTGATCGAGTTAATTGCTTGATTTATTTA
CTACCAAAATCTATCCTATAATTATGATATTGGGTTGCTTTTTATTTTTG
ATTTTTCTGCTATTTATTAATGTCTTGTTTGGGATTGCAGGGGCTGGTAA
ATCCCAATACCAATCTCTTTAGAAAAGTATTAGGGTTTTCTAAACTTTCA
TCTATTAGATATCAATCCATAGTTTATGAGTGTAATTAGCATCAGTATTA
GTGTTATATTTTTGGGTATCATCACCATTGGAGTCCAAGATCCCTTTTGC
TTCTATTCTGTTCTTTCCACCTTCCCTGTTTTCTCATTGTTCTATGTAAA
TTACTTTTTCTTTTGATGGTGGTGGTGGTAGTGTGTGTGTTTTCTTTTTT
GAGAGGATGGGGGCTCTGCTATGTGCTATTGTTTTATTAATCTCTGTATG
CGTGCACGTATGATCTTACATGGTTAATGACAAAAAAAAAAATTCTATGG
GGCTAAAATTGCGGACCCTACCATATCAGCTTAACTGTTAACTTATACGG
AGATTGTTGATAAGTACCGCAGGTTTTAGAATTAGAGGACACACTTCTCT
CGGGTGTTGATTTTCTTGGCTTCATATTTAGATTGTTTTTTCTTGGATTC
ACTTCTTGTTTAGGTTTGTTTTTCATGTGCAGAGCTAAGAATTTGATTTT
CTTCTGCTTAACTGTTCACTTTGTGCATGTAGTTTTTGTGTTTATGACTT
ATTTTTGTATGTAGCTTATTGTGTCCTGTGAATCTTGTCAGCGCTCTGCA
TATTTAGGGAGGCGGGCCACAGTGAATCCTGAAACTCTTCCTTTTCTGGA
TACGGACCCTGCTTTTGTAGCATCTTACCCTGAATCTGAAGTCTTTGGAA
GTAGATATTACCGGCATGTTCGGCATCCTTCTCCTGATGGTTTAGCTGAG
GTGTGCCCATTGCTTAAAGTTTTTCTACTCTAATGTCTCTGTGTGTCATG
TTATCTTGGCGTGCTTGTGCTTCCACTGGGTGATCAGAGAGCACTGCATT
ATGAATAGGTGTTGATTATTATGGTGGATAGGCTGATTTTCTCATGGAAA
TGATTTTTCTTTATTGAAACATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATATATTA
GATAACTAAATTTGATTTTTAATATACAACAACAGCCCTCAACTTAAATT
TAATGATTTCTTCTGTACTTCTTGTCATAGGGGAGTGAAGAGGATGGAGA
ATTGTTACTTTTATCTTTTTTAATCTCCACTGTTATCCTAGTGTCAATTT
TTCTCAATTTTCAATTTCTTGTTGGAGAGGGGGAGAGATAGAGATTGTTT
CTGGGTTAACAGTTTGAGGGCCAGCTAGCAACCAAGTTGTGAAAACGGAA
GTGAATCCTCTATAACCCTGATGTTTGATATTGATCTGCTTAGAAGAAGA
AACTATTACGATTTAAAGTGTTCAAAGCTTGTAAGCTGTTTCCTTCTTTC
ATCTTGCTTTGTCAAATATTGCAACATATAATTCTACCCGGGNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGTTAAAGGGTGATGTTTCAATGGGACATAACGATATC
CTAAAGATTGAAACAAGAACTCAAAGATGGGCTAAGAAATGACACTTTGC
AGGTATTCCGTAATGACATTGCTGGTTGAATTCTTAGTTTGCATTAGTTT
ATTTGCCTACATTGTTTAGGATTTTGATCATTCGTAAGCTACAAACCGAG
TTGTATCATGACTTGCGGATTAGGACAGGGCAAGTTGAAGTTTTGTTTCA
GTTCACTTATTCCTAACTTTGGCCAAAGAAATTAAGATGTCTATGATCTT
TTCTAAAAAAATTATTTCTTAAAGGTTTGGTGAATGAGTTATAACTTATA
ATTAAGAGTCTGTTGGGTGGAAGCTTTCAATCATATGTTTCTTAAATTGC
TCTTTGGAATATTTCTTCTTGGAATTTAAGACAATTTAAATCCCCTTTGC
TAAATTGCAGATAATGATGCTCCAGAATAGTTTTATGATGGGAGGAAGGT
TGGATAGATATAGCGACTGGAGGCTCGATATCGATCACATGTCATATGAG
GTAGTTTATATCCCTTTAGTTGCCTTTTATTTCGATTATACTTCCTGGCA
ATGGTGTGTCGGGCTACTGAGTGCAAATCGGAGGGGTTCGGTTCTTCCGG
TGGGCAATTTTGTAAGTAAAATGCTGAAGAGTGGGAGTGGAATTGTATTG
TGGGAACCCCTTTTTCAGTCTCTGCTTAAGCTTGTCCACCAGGCTCACTA
TAGCTATGTTATATCACGCAATGCTGGTAAAATAATTTAGAATTTCTTTG
TCTTGGTGCTAACAGCAACTGCTGGAGTTAGGTGAGAGAATTGGTCATGT
GAGTACTGGACTGAAAGAAGATGAAATGAGCCAATGTGTCAGGAAAATGA
AGCTCTCAATTATCAACGACCTTTCATCACATTTACCCATAATACCGGAT
AAGAACTGCAGCATTTGTCAGGTAATACTTCCAGCATCATATTTCATCTC
TCATTTCTTTAATTATCTCATCATTGCTCTCATTTACACGTCTATATACA
GGAGGATTATGAAGCAGATGATGAGCTGGGGAAGCTGGATTGTGGACATG
GCTTTCACATGCAATGTATAAAGCAATGGCTTGCACAGAAAAATATTTGC
CCGGTTTGCAAGACTGAACCGGTGGCTCGAGGATAAAGCCGGTGTTCTTT
CATTATCGTCTTGGATGTAGTTCTTTCAGATTGCTGCTGCTCTTTAGTCC
TCTCCTCGTCTCCCAACATGGTGTATAGATTTTACCAGTATACATAATCT
GAATTCATTCATTGGTGTGAAGCTTCAAATTTTTGAGTTGAAATGATAGG
GGTCCGGACGATTTAGCAGTTCATGCTTATTGAAATTATAGTACTGGAAT
TTTTATGGAAATGATTTATTTTGATATTCA