Manes.01G014400.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G014400
Unique NameManes.01G014400.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length3238
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:2411345..2414582 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
AncestorIdentifiercassava4.1_024214m.g.v4.1
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G014400.1Manes.01G014400.1.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G014400.v6.1 ID=Manes.01G014400.v6.1|Name=Manes.01G014400|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=3238bp
ATGAAGAATAGAGAACAGCAACTGCGATCCAAGCTCATCAATGGCGGCCA
AGTCCACCTCCATCACTTCATCTCCTATATCCTTCTCTTCGGCTGCGGCT
TAGCCTTCGGTTTCTATCTCAAAGACATTTCTTTCAACTTTCAACTCAAC
CAAATCTCCATCCAAACCCAGACTTCACTATCTAAACCTCCTTCTCCCCC
GCCGCAGCTTTTACATTTGGGAGTGGTCCTGAATCAAACCAGGAACCGAA
CCGGTTTAGAAGAGTTCTTAAAACCACCAAACTTGTCCCATGATATGCAA
GAAAAAGAACTGTTATGGAGAGCGTCAATGGTTCCTCGTGTAAACGAATT
TCCATTGAAGATTGTCCCAAAGGTTGCATTTTTGTTCTTGACGAGAGGGC
CTTTGCCTTTGGCTCCTCTTTGGGAGTTGTTCTTTAAAGGTCATGAAGGT
TTTTACTCAATTTATGTCCATTCAAGTCCATCATTCAAGGGCACAGTGCC
CTCCAATTCTGTGTTCTATGGCAGAAGGATCCCAAGCAAGGTCAGTTTAT
TTATTTCTATTTTTTTTTATATATTTTATCATTTCATTTTTCTGTCTTGT
TTTCTTCATTATTTATTAGATAATTATACATTTAGTCCAAAATTTACTAA
ATTATTAATTAAAAAAATAATAGTCTTAAATCTCACTCATATACAGAGGT
TTGGCTGCCTAACTGTTACTAACGCTCAAGACATTATGATTGTTATTATT
AGACAAAATATATTATTTTATATCATGGATTTTAATTTTATTAAAATACC
TTAATCTTTAAGATTGTTATTATTAAATAATTAGGGTGAGTAATTCGATC
CGTTCAATTTAAAATTAAATTGAATTGAATAAATTAAAATTTAAAATTTT
AGTATTTATAAAAATTAAATTGATTTCGATTTAATTTAATTGGTTTTAAT
TTTTAATAAATTTTTTATTTTTTTACACTTTATTTTTAATATTTTAAAAT
TTAATTAAAATATTTTAATTTTAATACAATTTAATTTCTTTATATTATTA
AAAATAATATATTATTATCACTAATTTAATTCGATTTTTTCAATTTTTTT
CTAATTAAAATTGAATCAAACAGAAATAATTAAAATTTTTAAAATTAAAA
ATTAAACTAAATCAAATCAAAATAAATAAAAAATTAAATTAAAATTTTAA
ATTAATTTAATTCGATCAATTTTTTTAATTTTAATCTAAAACGGCTTCTC
CTTCAAAATAAATATAGAAATATTGACGGAATGAAAGCAAAATCAATAGA
TTAAATAGTCTAATTTCTAGAATATAGTTATTAAATTGCTATTAATAATA
AAAGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAAAAC
CTATGCAGTTGTAAAGGTGACAAGTGGGGTATGGCTAGCTAATAGTTCAT
GTGGTCACGATGGAACCTATGCAGTTGTATAGATTTTATTGTCTGAATAA
ACCTGGAGTTCTGTTTTGCGTACTGAATTAGGTCAAGTAACCAAGCCTAC
CAACTCGGCTTGAAAACTATTTTTATTTTTATTTTATTTTTTTGTGTAAT
TGGGGAGGGTCTTATCTTAAGTTTTCATGTAGCTTCTTATGCTAATTTAG
AGAAAGAAATTTCCTGGTCAATTTTTTAATCTATAATTTAGTGAAAGAAA
TTGTATTAAACCTCTAAATTAATTCAGTCTTTTTTATAAGTAATAATTAT
TTTATTAATAATAAAATTTCGACCTAATTATATTTAATTAGAGTAACTCA
AATAGAAAATTTAAATTTTTAAAAAATATAAAAATTTTATTTTATTTAGT
TGATATTTCTTCTTTAACTTTTTGAAAAGTTAAGGATTTTATTTTTTTTA
ATAATCTAATTTAATTAAGTTATTTCATGAGAAATTAATAGGAAAGTATT
TGGTCGGTTCGATTTAAAATTAGACCGAACTGAATAAATTGAAAATTGAA
ATTTTAGTATATATAAAAATCGAAATGAATTGATTCTGGTCAGAAACCGA
ATTGAACCGAACCAATCTGATTCGGTTCAATTTAGTTTGATTTTATCAAT
TTGAATTTTTAATAAATTTTTTATTATTTACACTTTATTTTTAGTATTTT
AAAATTTAATCAAAATATTTTAACCTTGATCTAATTTCTATATTATTGAA
AATAATATATTATTATCAATGATATATTCGATTTAATTTTTTTAATTTTT
TTAATTTTTTTTTATTAAAACTGAACCAAATCGAAATAACTAAAATTTTT
GAAATTAAAAATCCAATCGAACTGAAATAAATAAAAAATTAAACTAAAAT
TTTAAATTAATTCAGTTTGATCGATTTTTTTATTTGAACCGAATACTACT
CGCCTCTAAAAATTAATTTCAAAGAGGATTATAGTATTTTTTATCGAATT
TAAAATAATTTTAATTAATTTAAAATAAAATTTACTTGAATTTAAAAAGT
TTGAATATGAAAAATGTGTTTAAATTCGAGAAGATAATCATGGCATATGT
TCTATTTATTATCATTTCTAATCAAGCATAACATCTAATGCAGGAGGTAC
AATGGGGAAAATTTACAATGGTTGAAGCAGAGCGTCTCCTATTGGCAAAT
GCACTGCTGGATTTCTCCAACCAACGCTTTGTTCTCCTCTCAGAGTCTTG
CATTCCTCTGTTCAACTTCTCAACAATCTACCATTACCTAATGGGCTCTT
CGAAATCTTTCCTAGAGGTCTACGACCTGCTTGGGCCAGTCGGCCGTGGC
CGATACAACTCACGAATGAGGCCAACAATTCAGCTTCATCAATGGCGAAA
GGGCTCCCAATGGTTCGAAATGGATCGGAAGCTCGCCGTCGAGGTAGTCT
CTGACCGAAAATATTTCGATATATTTCGGAGACGTTGCAAGGGATCTTGT
TATGGTGATGAGCACTACTTGCCAACTTTTGTTAGTATCAAGTTTTGGAG
GTGGAATTCAAACAGGACAGTGACATGGGTTGACTGGTCAAAGGGTGGGC
CCCATCCAAACAGGTTTGGGAGGATGGAAATCACTAGGGATTTCTTGGAC
AGGCTGAGAAGCAATGGAAATAAAGGATGTGAATACAATGGGAAGAAGGT
TCATATTTGCTTCTTATTTGCTAGAAAGTTTATGCGTAATGCTTTGGATA
GATTGCTAAGATTTGCTCCAAGAGTTATACAATTTTAA
back to top

gene from alignment at Chromosome01:2411345..2414582+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G014400.v6.1 ID=Manes.01G014400.v6.1|Name=Manes.01G014400|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=3238bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:2411345..2414582+ (Manihot esculenta)
ATGAAGAATAGAGAACAGCAACTGCGATCCAAGCTCATCAATGGCGGCCA AGTCCACCTCCATCACTTCATCTCCTATATCCTTCTCTTCGGCTGCGGCT TAGCCTTCGGTTTCTATCTCAAAGACATTTCTTTCAACTTTCAACTCAAC CAAATCTCCATCCAAACCCAGACTTCACTATCTAAACCTCCTTCTCCCCC GCCGCAGCTTTTACATTTGGGAGTGGTCCTGAATCAAACCAGGAACCGAA CCGGTTTAGAAGAGTTCTTAAAACCACCAAACTTGTCCCATGATATGCAA GAAAAAGAACTGTTATGGAGAGCGTCAATGGTTCCTCGTGTAAACGAATT TCCATTGAAGATTGTCCCAAAGGTTGCATTTTTGTTCTTGACGAGAGGGC CTTTGCCTTTGGCTCCTCTTTGGGAGTTGTTCTTTAAAGGTCATGAAGGT TTTTACTCAATTTATGTCCATTCAAGTCCATCATTCAAGGGCACAGTGCC CTCCAATTCTGTGTTCTATGGCAGAAGGATCCCAAGCAAGGTCAGTTTAT TTATTTCTATTTTTTTTTATATATTTTATCATTTCATTTTTCTGTCTTGT TTTCTTCATTATTTATTAGATAATTATACATTTAGTCCAAAATTTACTAA ATTATTAATTAAAAAAATAATAGTCTTAAATCTCACTCATATACAGAGGT TTGGCTGCCTAACTGTTACTAACGCTCAAGACATTATGATTGTTATTATT AGACAAAATATATTATTTTATATCATGGATTTTAATTTTATTAAAATACC TTAATCTTTAAGATTGTTATTATTAAATAATTAGGGTGAGTAATTCGATC CGTTCAATTTAAAATTAAATTGAATTGAATAAATTAAAATTTAAAATTTT AGTATTTATAAAAATTAAATTGATTTCGATTTAATTTAATTGGTTTTAAT TTTTAATAAATTTTTTATTTTTTTACACTTTATTTTTAATATTTTAAAAT TTAATTAAAATATTTTAATTTTAATACAATTTAATTTCTTTATATTATTA AAAATAATATATTATTATCACTAATTTAATTCGATTTTTTCAATTTTTTT CTAATTAAAATTGAATCAAACAGAAATAATTAAAATTTTTAAAATTAAAA ATTAAACTAAATCAAATCAAAATAAATAAAAAATTAAATTAAAATTTTAA ATTAATTTAATTCGATCAATTTTTTTAATTTTAATCTAAAACGGCTTCTC CTTCAAAATAAATATAGAAATATTGACGGAATGAAAGCAAAATCAATAGA TTAAATAGTCTAATTTCTAGAATATAGTTATTAAATTGCTATTAATAATA AAAGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAAAAC CTATGCAGTTGTAAAGGTGACAAGTGGGGTATGGCTAGCTAATAGTTCAT GTGGTCACGATGGAACCTATGCAGTTGTATAGATTTTATTGTCTGAATAA ACCTGGAGTTCTGTTTTGCGTACTGAATTAGGTCAAGTAACCAAGCCTAC CAACTCGGCTTGAAAACTATTTTTATTTTTATTTTATTTTTTTGTGTAAT TGGGGAGGGTCTTATCTTAAGTTTTCATGTAGCTTCTTATGCTAATTTAG AGAAAGAAATTTCCTGGTCAATTTTTTAATCTATAATTTAGTGAAAGAAA TTGTATTAAACCTCTAAATTAATTCAGTCTTTTTTATAAGTAATAATTAT TTTATTAATAATAAAATTTCGACCTAATTATATTTAATTAGAGTAACTCA AATAGAAAATTTAAATTTTTAAAAAATATAAAAATTTTATTTTATTTAGT TGATATTTCTTCTTTAACTTTTTGAAAAGTTAAGGATTTTATTTTTTTTA ATAATCTAATTTAATTAAGTTATTTCATGAGAAATTAATAGGAAAGTATT TGGTCGGTTCGATTTAAAATTAGACCGAACTGAATAAATTGAAAATTGAA ATTTTAGTATATATAAAAATCGAAATGAATTGATTCTGGTCAGAAACCGA ATTGAACCGAACCAATCTGATTCGGTTCAATTTAGTTTGATTTTATCAAT TTGAATTTTTAATAAATTTTTTATTATTTACACTTTATTTTTAGTATTTT AAAATTTAATCAAAATATTTTAACCTTGATCTAATTTCTATATTATTGAA AATAATATATTATTATCAATGATATATTCGATTTAATTTTTTTAATTTTT TTAATTTTTTTTTATTAAAACTGAACCAAATCGAAATAACTAAAATTTTT GAAATTAAAAATCCAATCGAACTGAAATAAATAAAAAATTAAACTAAAAT TTTAAATTAATTCAGTTTGATCGATTTTTTTATTTGAACCGAATACTACT CGCCTCTAAAAATTAATTTCAAAGAGGATTATAGTATTTTTTATCGAATT TAAAATAATTTTAATTAATTTAAAATAAAATTTACTTGAATTTAAAAAGT TTGAATATGAAAAATGTGTTTAAATTCGAGAAGATAATCATGGCATATGT TCTATTTATTATCATTTCTAATCAAGCATAACATCTAATGCAGGAGGTAC AATGGGGAAAATTTACAATGGTTGAAGCAGAGCGTCTCCTATTGGCAAAT GCACTGCTGGATTTCTCCAACCAACGCTTTGTTCTCCTCTCAGAGTCTTG CATTCCTCTGTTCAACTTCTCAACAATCTACCATTACCTAATGGGCTCTT CGAAATCTTTCCTAGAGGTCTACGACCTGCTTGGGCCAGTCGGCCGTGGC CGATACAACTCACGAATGAGGCCAACAATTCAGCTTCATCAATGGCGAAA GGGCTCCCAATGGTTCGAAATGGATCGGAAGCTCGCCGTCGAGGTAGTCT CTGACCGAAAATATTTCGATATATTTCGGAGACGTTGCAAGGGATCTTGT TATGGTGATGAGCACTACTTGCCAACTTTTGTTAGTATCAAGTTTTGGAG GTGGAATTCAAACAGGACAGTGACATGGGTTGACTGGTCAAAGGGTGGGC CCCATCCAAACAGGTTTGGGAGGATGGAAATCACTAGGGATTTCTTGGAC AGGCTGAGAAGCAATGGAAATAAAGGATGTGAATACAATGGGAAGAAGGT TCATATTTGCTTCTTATTTGCTAGAAAGTTTATGCGTAATGCTTTGGATA GATTGCTAAGATTTGCTCCAAGAGTTATACAATTTTAA
back to top