Manes.01G012800.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G012800
Unique NameManes.01G012800.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length11621
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:2159043..2170663 -
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
AncestorIdentifiercassava4.1_007795m.g.v4.1
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G012800.1Manes.01G012800.1.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G012800.v6.1 ID=Manes.01G012800.v6.1|Name=Manes.01G012800|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=11621bp
AGAAACCATTTCCATATTTAATCTGTCCAGTTCCAATTCGATTCATAGTT
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AAGTCACATAAATTATCAACAAGTGAATGATAATTCAAGAGTCCCAAAAG
AGCAATTGTTAAACATCCACAAATCAAAAGAAAATTAACGCCATTTTACA
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TCACAGCACTCAAAAAGTTATATCAGATTACATAGAATTTCACAAGCAAA
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AAGCTACTCAGCCAGTATCTATACTGGGAAACAAGATATTGCAAGAGACT
TACTGGCCATCAGGAAGCTCATATGGAGTCATTGGAATATTTGAATATGC
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ATTGACGAATTCTGAAACAAGAAGCCATCTCATCCACTCTGGACTTATGG
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GATATCACTTGCAATGACCCTCTGTTTCCAAAGAAAAGTTCAATAAATGT
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GGATGAGAAAAGATGCAACTCTAAGAGTCCCAATCAAACTCTAGGAACTT
AAAAAGTTGTATTAGAGTTTAGCAGTACGGATCAGTTTCGCACCTCATAA
TTTCATGTCCTTAGTTAAAAGTAGCACCAACCATTATAAAAGGAGCCTGG
TGGATTTTCAAGTGCATTCAGATCATAAAAACAGCCCCCTTCTTCTGACC
AAGTAGATACATTTATAAAGAAATGAACATTCCTAGAACACTGAATTCAA
TGCGACTTTGTTTCGAAGATGCTTAAAGCTTCCAAAAGTTTTGTAAGTTG
TAGAACTGTGATTTGTTTTATAAATCAATACACAATAGCATGCAAGACTT
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CTACCTGCATTCTTTACCCAGTATTTACTATATCATCAAATTAACCTGTC
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AATACCAGAGACCTAACTCCTTTTTCAATAAAGTCTAAGCATTAACCAAT
GAACATTTGCTCAATGGTATCAATCATATTCAGGCTATGAGTTCTCAAGG
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GTTAAACTGCCCAACTCATTTTTCAATAAAGTCTAAGCATTAACTAATGA
GCACTAGCTCAATGGTAACCAGTCACATTCAGGCTATGAGTTCTCAAGGT
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CAAGCTTTTCATCAAGCAATCAGTAAGAAACTCTCCTCCTATTGGTGAAG
AAGACACTGCCTATTATAACAAGGGGGAAAAGTTCATCAGTTTGTCTAAA
TTCTCTGAAAGCGTTAATATTCTGGTTTTGTTAAGGGCCTTGAAAAACTT
TTGCATTAGATGCATAATGCTCCTAAATTCTCTTGAAATTCATTTTTGTT
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GCAACAACAATAAGAGTTAAACAAACATAGTAGTAATATTTATCTCTATG
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AAGTCATATGACACTTGAATGTAAAAGGAAAAATACCTTTTGGAGGACAT
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GACAAATAAATGACATGCTATCTTATCATAATGAGAGGAGTCGGATCAAA
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GCTTTTTGAAACCAATATAAGTCAACCCTCTAAAAGTTCAATAACTTTAA
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AATTGGAGCTCAGCAAACAAGAATCACCCTTTTCGAAACATTATCAATTC
TTATCAATGAAAAAATGGGAGTAAGGATTGAATTTTGCAAACCCAATTAG
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GACAATGCAACTAAATGTAGATGAAATAAGAGATACTAACAGAAGGAAAC
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GCCCAGGTCAATCACTATAGCTGATACTTCATCTGCATTCCAAACAGAGA
ATTATACCAATTACTCACGCGAAGCTGCAAAATTACAGTAGATAGGTGGG
TATAGATGGAGAGATTTTGCACTCACCACCTCCATACATGATTCCACGTT
TCTTTGAGAATTTTCTTCACAACTGAATAGCTGTTGTTAGGGTTTTAGAA
ATTAGAAAATGGAGGTTGTCGAACCTGCGTAGGGACTGATCGGTGGGAAA
GGAGCAGCGGGCTGATGGAGGATGGAGGCTGGCGGCGAGGCAGATGGTGG
TCGGCAGTGAGAGTGTAGGGAATGGGATGCGGATGTGAGAGCCTAGGGAA
TTCGTGAGCGGCTGGCTGTTG
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gene from alignment at Chromosome01:2159043..2170663-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G012800.v6.1 ID=Manes.01G012800.v6.1|Name=Manes.01G012800|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=11621bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:2159043..2170663- (Manihot esculenta)
CAACAGCCAGCCGCTCACGAATTCCCTAGGCTCTCACATCCGCATCCCAT TCCCTACACTCTCACTGCCGACCACCATCTGCCTCGCCGCCAGCCTCCAT CCTCCATCAGCCCGCTGCTCCTTTCCCACCGATCAGTCCCTACGCAGGTT CGACAACCTCCATTTTCTAATTTCTAAAACCCTAACAACAGCTATTCAGT TGTGAAGAAAATTCTCAAAGAAACGTGGAATCATGTATGGAGGTGGTGAG TGCAAAATCTCTCCATCTATACCCACCTATCTACTGTAATTTTGCAGCTT CGCGTGAGTAATTGGTATAATTCTCTGTTTGGAATGCAGATGAAGTATCA GCTATAGTGATTGACCTGGGCTCGCATACTTGCAAAGCTGGCTACGCTGG CGAGGATGCACCTAAGGCCGTGTTTCCTTCTGTTAGTATCTCTTATTTCA TCTACATTTAGTTGCATTGTCAAATTTCCCAGTGTTTTTCTTTAATTCTT TTTTTTTTTTTTGGGAAGAGGCTAATTGGGTTTGCAAAATTCAATCCTTA CTCCCATTTTTTCATTGATAAGAATTGATAATGTTTCGAAAAGGGTGATT CTTGTTTGCTGAGCTCCAATTCAAGTATTACAGTGTAGAATGGAATAATA ATTGTATGCTATATTCATAAAAAGAAAGATACTATTTTTACTTTTTTTTT TGGCAGAGTTAACTATACCATTTAAAGTTATTGAACTTTTAGAGGGTTGA CTTATATTGGTTTCAAAAAGCTTTGCCCTGGCCTTAAGAACTCTGGTGCC CAAAACAGTGAAATGAGAGAAGTTAACAGCTTCAGCCAATTTGCATATTG GTGATTTGAGGGAATTAATGAATCTTTCCTCTGCTGTTGATGGGAGTTCC TCTCTTAATGGATCCAGAGATCAGTTGCCTGGTTATGTATGTTGAAAAGG 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