Manes.01G011000.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G011000
Unique NameManes.01G011000.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length5840
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:1967503..1973342 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
AncestorIdentifiercassava4.1_001516m.g.v4.1
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G011000.1Manes.01G011000.1.v6.1Manihot esculentamRNA
Manes.01G011000.2Manes.01G011000.2.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G011000.v6.1 ID=Manes.01G011000.v6.1|Name=Manes.01G011000|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=5840bp
TCACCCTCAAATTTTCTCGCCATCCAAACAAAACTAACAGATGAAAACAG
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GTTTTATTGTCATTTGTCACTCACATTATAAATTGGTTGCCTTTCATTTT
ATGGTTGATGCTATTTTATGTGCTTGCTTAGTAGTCTGGTGTAAGAACTT
TGGATGCTCTTCCTGCTCAATGTAAATCGTGCATATTTAGGAATAATATA
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TTGTGTACCGAGGAAGTAACTATGAAGGGCCTTCATCCAAATCTCGAACT
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GAAGAGGAAGCTGAATTCAACCATCTGCTTGATGGTCTAGGCCCTCGTTT
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GAAGCATGTTACTCTTGCAAATTAAAATTACTTTATAGTGTCATAAAATT
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GCACAATGAAGGAAAGGCCCTTGCAGGTACCTTGGCAGAGTTCTATGAGG
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TAAAGCACTCTCAGGTCTCTTTTTTAGAGAAAACATTTTTTTTGAGTTTC
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AAATTATTTGTTATTGAAATAACAGAGGTTAAGTTGTGGGTTTTGCTAAA
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TTGGTTGTTTTAATTATTCTAAAGGGCCAATATCTAGTGCAATTGTAAAA
TTCTTTTATTTGCATCTTGCAACCATGACATGCGAGTTTGGAATCCAAAG
AATAGCTACTTTATGTTAAATATTGAAGAGAAGCTTCCTGCTGGTATTCC
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ATCACTTTATTTTCTTTCTTTATGCTGCCATAAGATCCTATGTGCTAGTC
TAACCATGCAAATTTTCTTCTTCTTTTTTTTCTTTTTCTGCTCTACTAGA
CAGTCATCTCTTAGCATTGGAGCTTATTATTTCCATGGTTTAATGTTGCT
TGGACAGGCCCAAGCCAAAAAGCTTAGAGCAGAAAGACTGTTAGCCAAGA
TAGAAGCCTCTATGGTTCCTTCTGGTCCTGATTATGACCAAGAAACAATT
ACTGATGAGGAACGGGCAATGTTTCGTAGGGTTGGCTTAAGAATGAAAGC
ATACTTGCCTCTAGGTGGGTGACTTAGTCACAGAGCAAGCTTTGAAAGTG
TAACTAAATATTTGATAATCCTTATTTAATGATGTGCCAGGAATTCGTGG
TGTTTTTGATGGTGTCATTGAAAATATGCATTTGCACTGGAAGCACAGAG
AACTAGTGAAGCTGATATCCAAACAAAAGACTCTTGCATTTGTTGAAGAT
ACAGCTAGGCTGTTGGAATATGAGAGTGGAGGGATACTAGTGGCAGTTGA
AAGAGTACCCAAAGGATTTGCTCTTATTTACTATCGGGGAAAGAACTATC
GACGGCCTATTAACTTGAGGCCAAGAAATCTCCTGACGAAGGCAAAAGCA
CTGAAACGTTCTGTGGCCATGCAACGCCATGAGGTATCAATTTTGTCCTG
AGCTTTTGCTATCATATTTTTCCTGACAACGTTAGAAGTCCCTGAAACAA
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TTTTTGTCCATTACTATGATATGCATCCTATATATTACATGACTTTATGT
GAAACATGCAGGCTCTTAGTCAGCACATATCTGAATTGGAAAGAACCATA
GAGCAAATGAAGAAAGAAATTGTAAGTATTATTTTCCTTTTTCTTCGTTG
AAATGAGGCCAAACTCATCCTCATGGGTTTTTGGCGCATTATGGTAACAG
ATATGATTTTGAAAAGTTCCCCTTATTACAACTTGCCGTGAGAGGATGGT
GTAGGGGAGTGGGTGTGGAGGAGCAAGGGTAGTTCTTATAGTTGGTGATA
TTTCTGGTATTGTTTGTGTAGAATGTTTCGATCACTGATATTTAGATATG
AACTTTTTGTGGTTGCCTATCATTATTTAGCTTGTTATCATCGTCATCAT
CGCTTGCAATTAATAAACTGGAGTTCTTTTTGTTGATCTACAGGGTCTTC
CTCTAGAAGAAGATGACAAGAATAATTGGACCTCAGAGGAACAGGGGCAG
TTAAATCATGTCTCAGAATTCAGCCAGGTTAAATATTATGCTTTTTTCCT
TTGCTATTTATTCATCTTTATACTTTTTTCCTGTTATGGATGATGGATAG
ACCAAATCCATAAAAAACAGATTTTATTTATCTAGTAGTTTCTACTTGTT
ATGGATTTGGTCTATCCATTATCCATAACATTTCCCCTCTGATACAATAG
GGTATTATTTCCTGCATGGTCATCTCGACTTCTATTTCTACTTTTCTTGC
TATGATGAAAGAATGAATAGTTTCTTGCAATGTAAAATATCTGCTTTTTT
TGCAGAGAGAGGATGAATCTGCATTTTTTGGATCTGATGAGGAAGGGGAT
CATGATGACATTGATGAAGATGACGATGATGACATTGATGAAGATGATGA
TGATGACCTTGATGATGATGATGAGGATGATGCTGATTGGGAATCCAGTG
GAGATTTTGAATTTTTAGGCTTGCAAGATGGTGATCATCCTTTGGACAAA
AATGGTTGACAGGTCTTTGAATTTTTGAAGTGACTGGATGGCATTTTTTC
TTGCATATGTCAAAATGCAGGTATTCATTATGCTTCATGCTGTTTCACCA
GTTCAGTCTTCTTTTAGATGTTATCATACAAGTCAATGCTCAAACTATAT
TCACCTCTTTGGGATTTGAAACCTTCTGTTATTTTTTTAAACAAATGAAT
GAATCTAGATCTTCTGCCGTCATTTTGCTCCCCATTTTCTAGCATCAGGT
TGACACAGCTTGGATGATTCTATGGATGATGTAGCTGTTCGAGCATTATC
TGGGCTAAGCTGGAAGACAATTTTGATTTGATCATTAAATACCTACATGT
TGACTTCATCACAAGCACCCTTCATTGATCAAATGCTTTACTGTGTTCTA
TGAGCTCGCTATTTGTCTGAAACCCTTTTTTTTTTCCTTTAAATCTTCAA
TGACAACAAAACCAAACCGTCGTGACCATGTATTCAACGACTAGTGTGCC
AAAGTGAGGAGCTTTTTCCAAGATAAAAGTTGTGTAGCGTACTAGTAAGG
ATGACGATGGCTTCCATTTTGTAGTGTTATGATGTCTCTGTTTGATATGT
AGAGCATTCTATCATCTTTATTATTGTATATTGTTTTGGGGTAACAAAAT
CGAATTCAAATATATTGTTCGGTTACAGTTGCACTTTTGA
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gene from alignment at Chromosome01:1967503..1973342+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G011000.v6.1 ID=Manes.01G011000.v6.1|Name=Manes.01G011000|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=5840bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1967503..1973342+ (Manihot esculenta)
TCACCCTCAAATTTTCTCGCCATCCAAACAAAACTAACAGATGAAAACAG ATCCTCCCAATTGAACTGAATCTGCTAATTGTCAAATGGCAATTGCAACC GCAAAATTATCAGAATTGCCACTGAGAAATTCACTGCCATTCCCACTCAC CTGCCACTCCCTTTTCTCTTCTACGTTAAAGCCGCCCTTTCAATCCCTCA GAAAGTCTTTCCGTCTTTCCTCTTCACTTCAAACCAACGAAAACCCTAAA CCTACGAATCATATTCCCTCCCCCAAGGCCCCCTGGCTCTCCAAATGGGG CCCTGATAATCCCCCTCCTCCTCCGGCTACCGCTTCTGCTCCGGCTCCTA GAAAGGTTACTCAATCCAGTTTTCAAGATAAAACTCGGTATTTGAACAAA GACAAAGGGCTAAACGCGATAGAGAGAATCGTGCTCCGATTGAGGAATTT GGGGTTAACTTCCGACGATGAGGGTGATGAAGAAGAAGAGGCAGCGGAGG AAATTGAATTCAGAGGTGGCGATTTAGCGCCAGTAACCGGGGAGGAGAGA TTGGCAGATCTATTGCAGCGAGAGTGGGTTCGGCCAGACACTATCTTTAG CAATCAGGACGATGAAGAGGACGATGACATGGTATTGCCGTGGGAGAGAA AGGAAAGCGAGAGGAAGGGCAGAGAGGAGGGAGAGGGAGGGAGGGAAAGG AAACGAACTGTCAAAGCTCCAACATTAGCTGAATTGACCATAGAAGATGA GGAGCTGAGAAGGCTGAGGAGGATGGGGATGTTTGTAAGAGAGAGAGTTA GCATTCCGAAAGCCGGACTCACGAAGGATGTATTGGAGAAGATTCATGAT AAATGGAGGAAGCAGGAGTTGGTTAGGCTTAAATTTCATGAGGTGCTCGC CCATGATATGAAGACTGCCCATGAGATCACTGAGGTTGGTAGGCTCCTTT GTTTTATTGTCATTTGTCACTCACATTATAAATTGGTTGCCTTTCATTTT ATGGTTGATGCTATTTTATGTGCTTGCTTAGTAGTCTGGTGTAAGAACTT TGGATGCTCTTCCTGCTCAATGTAAATCGTGCATATTTAGGAATAATATA GAGCATAAATGGTAAAATTTTGGAAGTGTAACTAACTGTTGGCATGATGG TCAGCGTCGGACAGGGGGATTAGTCATATGGAGGGCAGGAAGTGTTATGG TTGTGTACCGAGGAAGTAACTATGAAGGGCCTTCATCCAAATCTCGAACT GTTGATAGAGAAGGGGATGCTCTTTTTGTTCCAGATGTTTCTTCTGCTGA CAATGCAGCAGTGACAAGCGACAATGTTGCACTTGCAGCTTCGACTCCTG AAAAGAGGGAACCAACAATGGGAATGATAAACCGTGCTGAGAACATGACA GAAGAGGAAGCTGAATTCAACCATCTGCTTGATGGTCTAGGCCCTCGTTT TGAAGAGTGGTGGGGCACTGGAATACTGCCAGTGGATGCTGACTTACTTC CTCCAAAAGTTCCTGGTTATAAAACACCTTTTAGGCTTCTTCCTACTGGA ATGCGGTCAAGGCTTACGAATGCAGAGATGACTAATTTGCGAAAACTTGC TAAAACGCTTCCTTGTCATTTTGCCCTTGGTATTGCTCACCTTATATAAA ATATTTTCTTTACATTGTCAATTCATTGAATTATTTTGTCCTTAATTTTG TTTTATAGGGAGAAACAGAAACCACCAAGGTTTGGCAGCTGCAATACTCC AGCTTTGGGAGAAAAGCCTTGTTGCAAAGATTGCTGTGAAACGAGGTATC CAGAATACAAATAATAAACTAATGGCTGAGGAGATAAAGGTTAGTTGCAT GCTTCTTGTGAAGGCATTATTTATTTGTAGTTTCTCAGAACGTATTATCC 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