Manes.01G008500.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G008500
Unique NameManes.01G008500.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length13783
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:1438306..1452088 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G008500.1Manes.01G008500.1.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G008500.v6.1 ID=Manes.01G008500.v6.1|Name=Manes.01G008500|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=13783bp
CTCGCAAATATAGCGGTTAAATCTCAAAGATTGTCACTGGCAGAGAGTCC
GATTGGACGGCAGGGATCGGTGCCGGGGAAAATTGAAGACCGGGAATACG
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ATTTGAGCCAATTTAGAATAAACAAAATCTAAAGTTTTTTTCCTTTTCAA
ATTGGGATGAGGAGAAGTTCGAGTTGTTTAGGGCTGGAACAGCCAAGGAA
ATCGTTCCATCGCTGAAATATGTTGCAGTTTTTCTATCTATAAAGAAGAT
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TTCTATGTTTTCACCGCCCAGGCCAAAAAAAAAAGTCTGATGTTTGCGGA
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TAGCTATATATCTGAGAGAAGTCTTTGGACTTATCTTCAAGGGTAACTCA
ACAATGATTTTAACCTTTTCTTTGGAAAAAAATTGAAACATTTACTATTA
ATGAAAATATCTTCAAATTCATAAGATGTAGCTCAAAGTCCCCCCTGAGA
GTCACCTTTCTTGCAATGATCTTTTGATTAATGCATGTTTGTTTCAAGGG
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GACCTTTTAACCTTTTTTTTTTCTCCCCCAATGGCTTGATAATTGCTACT
ATGAGTCTATGATACACATGGATCTTTGGTTTTGAATGCTTCTTTTCTTA
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TTACTAGTATTGGTGTTTTGGTATAGATTGAATTGTATTTAATTGATATT
TAAATTGAGCAAGTAAAAGCATAATTAAAATTTGAAATGTTTATTTTTTA
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TATTAATGTATCTTTAAACCTCAACAACATTGTTTCATTTGATTTTTGTT
TTTATTTTTAACATTCATCTAATTTACTAATGCAACATCCAAGAAGAGTT
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TAATAGTTATTGAGTTGGCTTATAACCTAATTAAATCCACACTTGGCTCA
AATTTGAATCCTACTCTGTTGTGTTTCCATGTCTGTTTCAAATGATATTT
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TGCATCACTCGTGCTCATCCTCCTCTCACAGCGGCTGTCTCTGCATGAAA
TCTTATTTCAATTAGCTAACATCTGTCTTTTACATCTACACAGTTTGTTT
GGATGAATGGGTATGAAAAGGAAAATAAAGGAAAAGGGATGATAGATATC
CCTTGAAACTCCTATATGATTTCCCCTCAAAACAAAAGCCATTGTATAAA
ATAAGTCTCTTTAACTTTAACATTTAGAATCCTTTCTTATCCTATGAAAC
TTCTGAATATGCATTGGTGTTTAATCCCTCGGTTCTTTTCTTTTCCTATT
CCATGTGTTACAGGCTATTATTTCTCATTCCAATTAATTTGCAAACATTG
TGATAGACTATTATTCAATCTAAAAGTTACAGTTAGGTGGGGGCCGAAGA
ATAGGTTTAAATTGTAATATGGGTGCTCACATGGAAGCCTGTATGGTTTG
AAAGTAATGGATGAAACACAATACAATACTTTGTGCAAGCATATGGTACC
AAAGTTTGAATATGGACATGTAGATCATAGAGAGTTTAATAAAATATTAG
CAACAACTCAACCTTTTAGTTTTTTGGGGTGAGGGCCTAAGAGTAGCTTT
TAATTCTTTACCAATTTCTTTTGAAGAAAGTATATATGCCCATTCATATT
TATCTGGTATAGTTAGGTATTGTGCTTTATAGTTCATCATGAACAATCTA
GGACATTATACTACTGGGAGGCATTGTTCAATACACGCCTAATCACTGAA
AAATATTACTTGTATGCAGGTTTTTAAAACTTTACCAAATATTTTAATTT
TGGCAATTTTAGCCTGATATGAAAACATAGTTCCACCGGTCAAAATTGAA
AAAGGGAAATTTATTACTAATTGGAACAACAAAATAGTTTTTAATAATCC
CCACTATTTCACTGCCCCAGCTCCACCTCTGCTGCTCTCTCTATTTTACC
TCTTTCTCCTTGAAACCTTTTGCTGATGGTTGTCCCATAATCATCAACCA
GGCTATGAGCCAATTTATTCTTTCTGCAATTGCAAACTTCTATAGTAAAT
GCTCTTGTTTAAGTATTTCAATGCAGAATGCTAAGCTTAAATTAGGGAAA
TATGGAATTCATGGTGATGGTGAAAAGAGAAACCCTATAACAGGTAAAGC
AAACCCTAAAGAGGACAAGTGTTAATGAACTTTTATTAATAGGTTTAATG
ATGCAAACCTAACAGAGAGAGGGAGGAAACAGAAAGAGGAGTGTTGGAGA
GAGAAAGTGTTGGGGGGAGGGGAGGACAAGTAGTTATGGAGAGGAAAATT
GATAGAGTAAGGGGAAAGAAGGAAAAGAGATTTTGTATTCAAATCAATAA
AAAAAAAGAGTAACAAGAGAATCAAGCTTTAATGAACACACTTTTCATGT
CATTCAATTCATTCATTCCCTAGTAATCAATAGATACCCAACACTCAAAA
AGAAACACTAAAAAGATAAAGAACAAGAAAGACTAATGATGAAAGAAAAC
CATATTCAAGACACCCTGGATATTCTCCCAGCAGATAGCAATACTCTGCC
CCTCAACTGTATGATAATTTTGTATGCCAATGTTACCTCCTTTCCTCTCC
TTAAATGCTGGAGAAGGAATATTTTTTGTTAGCCCTTTTGTGCCAAGTGT
CCTCCCTCCTCTCTTTTCGTACTAGCCAGCTGTCTATGAGATTCCCACAT
TCCCTTCCCCTTCCTCTGCCCTTTTAGCCTTGTCGAATAAACCTTAAAAG
GCTTCGTAATATTTCCAGCTTCATTATGGGCCCCTTGTCATTACTGTCTT
CTTTTAAATCAGCCTTGTCCTTAAGGCTGAAATAAGAAAATTGTCATTAA
AAATCGGCTTGATCAATCCAAGTAGCTTCCTTTGCATACTGTTCTTTCCA
CTGTACTAGCACTTGAGAGACTGTCTCGTTGTTACAAAGGATGTTCCTTT
TCCCACAGATCCATTTTGGTTCTATCATTCGTTCTTTATATACATTTAAG
TGGGCTAGCAAATCCTGAACTACTTGATATTCCCCTACCGCCTTCTTAAG
CTGTGATATATGAAATCCTGTATGAAGCTGGTAGCTTTCAGCTTGTATGC
AATAGCTCCTTCTCAACTTATAGTTTCTAATGGTCCAAAGTAACGTGCAA
CTAATTTTGCATAGTTTCTGCCAACCACTGAAGTCTTTCTATGAGATCTC
ATTTTGGCTCCTACTACAAACTCTATATCCCTTCTCTTTTTATCAGCATG
CTTTTTCATCAATTGTTGTGCCTGAAGCAAATGGAAGTTAAGTTGCCGAA
TAGACTCATCTCGGCGCTATAGTTGTTCAGATGCAGCCTCAACTCTAGTT
TCTCTTGGCAAAATGTTTGCAATATTGGTGGAGGCCTACCATACACGACT
TCAAAAGGGGTTTTCCCAATTGCAGGCTAGTAACACGCATTATACTAGTA
CTCAGCCCAACAAAGCCACTTAGTCTATCCCTTTGGTTGTCCATTTGTTT
ATCGATTTGAAACCTTTGTTTGTCCATCCGTTTGTGGATGATAAGTAGAA
TTAAGTTGGGTCCCTTGCATTGGAGATAACTCACTCCAGAAATTACAAAG
ACATACTGGGTCCCACTCACTTACAATTGTTTTTGGAATACCATACAGCT
TTACTATCTCTCTTGTGAAAACTTCGGCCATTGTTCTTGCAGTAAAAGGA
TGGCGAAGATTAAGGAAGTGAGCTAATTTGGATAAGCGATCTACTCCCAT
TAGTATACAATCTACCCTATGGGACCTTGGCAAGCCTGTTATGAAGTCAA
TGGAGATATCCTCGCAAATGGAGTTTGGAATGGGAAGTGATTGTAGCAAA
CCTACTGGTGATTTGTCTTTCTTGTTGCCATCATTCCCAGCCAATAAAAA
TTTGAAGCCATGCGACAATAAGTGCGGAAGGCTCCTAAGTGTCCGTCTTG
AGGTGTGGCATGAAATTCAGCTATAAGTTTCGAAATTCAAACTGAACCAG
CCGGCAAGACCAGCCTCCCCTTGTAGTATAACCTATCATGAACTATTGAA
TAATGCTTATGAGATGTGGTCCATTCTTTAACTTCCATAATTATTTTGCC
GATTTATCATCTTATAGCACCTCCTGTGTTATCAACTACCAGTCAGCCCA
TTGAGCAATAGAGATTGCAAATACTTCAGCTTCCTCGACCCTTCTTGACA
AGCCATAAGTTGCCCTATTTGTGCAACCAACTTTATATTCAATGAAAAAA
TTGTATTCCATTAATTTAGAGAGCCAGTATTGTTGGGCGGGTGTGCTGGT
CTGTTGTTGCAGGAGATGCCTTAGATTTCTATGGTTCGCACATACTGTGA
ATTTCCTTCCTATTAAATAGGGCCTCTAGTGTTGAATGGCAAGAACCAAA
GCCATTTAACTCCATTTTATAGGTTGACCTAGCCATTGATTTATCCTAAA
TAGCTTTACTAAAATAAGCCACTAATCGCATAAGTACAGCCCTTACTCCA
CTTGTTGAAGCGTCACACTCAACCACAAAATGTAAATTGAAATCAAGCAT
TATTAGTACCGAAGATGAGATAATAGCCCGCTTGAGAGCTTCAAAGGATT
GTTCTGCCTCAGTTGTCCACTAAAAATTTTTAATATTTCTTCTTTAATAA
TTTTGTTAAAAATTTCGCAAGCTGTCTGTATTGATTGATGAGTCTCCAAT
AATACCCTGTTATTCCTAGAGAAACTCTAACTGTCTTGATTGAAAATCTT
CCATGGACCCGTTTCCACCTCTATGAGAGATGTGGATTTTCTTATTGAAC
ACCTCTTTTGATCAACATGGAATTAATTTCTGCAAAGTAATTCAAACACA
ACCTATAGATGCTTCAAGTGCTCTTCCCAATCCTTGTTGTAAACCAATAA
ATCATCAAAAAATACAAGAATGAATCTGCGTAGATGGGATGACATAAATT
ATTTATCATTGCCTGCAAGGTTGCCGATGCATTCATTAACCCGAAAGGGA
TGACTATAAACTCATAATTGCCTGAATGTTGCGGCTACTCTAATACGGTG
ATAGCCCGATTCTATATCCAACTTCGAAAATAACAAGCTCTGCTCAATTC
ATCAAGAAGCTTTTGGATGACTGGAATAGGATTCTTATTTGAGATTGTGG
CTCGATTCAGTTGATGATAATTCATGCAGAACCTCCAGCTACCGTCCTAT
TTCTTGACTAAACAATAGATGCTTGGCCTGATCACACCCGTAGACTACAT
CTTCGACACCAGTTTCTCGATCTTATCTTTCTGAATATGCTCGTATTTAT
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TCGTCTTTCTTATGGGGAGGTAGCCGCTTGATCTTATTAAATACATCGTT
GCAGTGGTTCAAGAGTTGTGCTAGATTTTGTTGCTATTGGAATGTCAACT
GCTCTTCCGCTCTTCCGTTGATCCAGCAGTTATCTTAATCTCCTTCGGCC
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TGGAACCTTAGTGTCATCTTTTGCTAATTTGCTTGAATGTCCTCTAAGGT
TTCTAACTATGCAATTCCTAAAGGCAACACATAATAATCTGTCTCTATGT
TGAAATCTTCCGCATCTAATTCCAACCCTTTGCAAATTCCTTCAAATGGA
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CATGCACACTACCACGGAATTTCATCATTTTGGGTTGATGAATTCCCCCC
ACAGAATAAAGTAGAAGCTTTAGCTGCGAGAAAGGGCTTCATCTTCACCT
CCAATTAGAGCCCTCAAGGATCAATTTGGACAATCATGCAAAGGGTAGTA
AGGCTGTTTATATTTAAAGCATAAACTCGTCGCCCTAAGCTCTTGATACT
CCTGGTGCGAATACTGTCTTAACCTCCTATGTCGATTCCGATGGTTTGAT
TCTTTGAAAGAAATAGGTGGTAAGGCTAGGGTTTTAGGGCTTAAATAGCC
GTTCTCGCGAGGTTTTTGTGGTGGCCCATCTTTCTTTTGATAGGTTATAG
CCAAAGTTACCAAGGCCTTTGTTCCAGCCTATGGGAGATTCTTTTCTCCT
TTCTTCCTTCCATCATCCATGTCTTCTCTCTTCCCCTCAACGGATACATT
CTCTGCCGTTCCATTTCCCTAGTTAGCTTCATAGTTTTGTACAGATCAGT
CGTTTCATGCGATTGATGCCTTAGATGAAGGCCTTCTCTCAATCCATTCA
GAAAGAACCCCAAACTTTGTCTATCTTAAACACTCGATACCAGTGATGCC
CTTGCTACAAATTCATTAATGTATTATGCTATTGTGCCCATTTGTTTTAG
AGCCACCAAATGCTCATAAGGATTTTCGGAAATATCATTGGTGTATCGCT
ACATCAATTATTCCTTCAAAAGAGTCCATGAGAGCTACGGGTTCCTCTGT
CGCATCCATCTTAGCCAATGCAAAGGAGCTCCCTCCATACTTATGAGGGC
CAGTGAGATTTTTAACTCTTCAGGAATATTTTGAATCTTGAAGGATTGCT
CTGTTCTTGCTATCCACTCGATTGGATCAGTTCCATCGAAATTGGGCTTT
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GATCATGCTTTCCAAACACCTGAGGCGCTCCTCCTGCTCTGCTCACATCT
GTTCTTGGCCTAGTTGTATTGCAATGACAGCCTCTCCAATCCAATAAGTC
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ATGCCCATGTTACCTCCTTTCCTCTCCTTAAATGCTGGAAAAGGAATATT
TCTTATTAGCCCTTGTGTGCCAAGTGTCCTTTTTCGTTTTTTCTTTCCGT
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TTAGCCTTTAGAATAAACCTTAAAAGGCTTCGTAGTGTTTCCAGCTTCAT
TATGGGCCCCCTTATCAAAAATACATTTTTTTTTAATTTCAATTGATACT
AAAATATTATTTCATTTATGTCAAATTTGACTAGTCGGACACTTGCAAAT
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ACAGTATGTAAATGCAGTGTATAGTTATAGTATATGATATTTTATTCCCA
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ATTGGATAAGTGATCCGGTGTGAATAGCTTGAAATGGCCAGTTGGATCTG
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AAAAATTTTCTCGACTTGGCAAGAGCAATTGAATCCAAGACCTCATGAGA
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CATATAGAATTCTTTTCTATGGATTACTCATTAGTGTTACAAAAAATTTA
ATAGTAATATTTAAAAAATAATACTTTTGTATGACCTTCAAGAACCCCAT
TAAAATATATTTGAATATTACCTAATAATTATTGATAATTAAAATTATCG
AATTTTATCTTTTTATATTAATTGGTGTTGTGTGTAATTAACTTTTTGAT
AACCCACTGATCAAGTCTGTGACTGATGGTCCTGGACCTCCTGGTCCCTC
CAATGGGTCAAACCCTGTGCAGGGTTCAATAGCACCTATCTATTTGTTTG
TTCTATAAACATCATTATACTTGCTTTTTCTTTACTTGAAAGGAAGAAAG
TACGAATTAGTACAGCTGAAATAGTATGCATCTATAATACATACTAATGT
AGGTTAGTTTCATTTATCTGCAGTGGCTGCTCATCTTACTGGTTTGCATA
GTGCCATCAAGATGCTGAATAGCAGAATCAGGGTGCTTCATCACTATCTT
GTTGCAATGCAGAAAGGTATATGCATTTCTTTTTGATGGAAAGTGCCATT
GATTCAATAATTTACAGCTCTTGTCACTAAAGGGTGCATGGATATTTTCT
TGATAGGAGTCTGAAACTCAAAAAAGAAGAGTTTAGCAATCTGGAGTTGT
CCCCTTTAAATATTTTATATCCTTAGATTATTAGTCCGCTACTTCTCATC
TTTGATGGAACTAGATCTGTCATTTGCTCCAATCCAACAGTAATGGACTC
TCAGCTGCCATTGGCCAAATCACAAATGAACCCTGTTGAAGGATCATCCC
AGCACTGGTTGGAGGGGTTGAATGAAGGGCCATTATAATTAAAAGAAAAG
GGGAAAAGTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGGAT
TATTTTGGAGGCAGATGCATTTGCTGTTGAAAAGTTGATGGCAATATGTA
TAGCATTGATAGTAGTTGTGTTTGTGTTATTCAGGTGAAATTCCTTGTGA
GAACTCATTATTAAGACAAGTATCAAGCCTTTTGAGAAGATTGCCAGCCA
TTGAATCAGAAAAATTTCAAGATGATTTCTTGATGGTGAGTAGTGCTATT
TGTTGCTTGTTTGGGAGATATGTTAAAAATTTTAATCATATCGATGAATT
ATCTGCATAAATTACTTTCCATAATTTAACTTCCTATCTGCTGCCTGAAC
CACTTTCTTAAAGAATGTTCTATGCCACTTGAAAATTTTGTATCTTGTTG
TGAGCTGGACTATTTTGCTCGAGAGACTGATTTTGAAAGTGTTGTCAGTC
AAAGTGAATGAAGTGAGAATTTTGCCTGCGTAGAAGGAATTAGTTTGTTG
ATTACAGGAAGGGGGAGGGGGGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGGCTGACTGCCAAGCCAATTCCTATTTAAATTCTCTCTGTTGCTCC
CTCAATGGATTTATTGTAATCCAACCTTGTACTAGTAACTCCATGCCCAA
ACCCAGCTACAACTCTTTTGGTCTTTCCACTACATGTCTACAGTTAAACC
AGGAGGAATTGACAACCATTTCAGGCTTTCAACAGTACGTATGCATGATG
ATGAGAAATAATAGGAATCTATTGTAGTGTTGAAGCTTGATGATTAAAAG
ATGGATAATGAACTAATGATGTCACTTTGCAGTTTCTGAGTGTAATGCTT
TTGTTGATAATTTGTTTTTTGTTCACAGGATGATGATTGTATTTGGATTT
CTGCTTTTGAGATACATGTTGCTGTATTTAATTTGGAGATGCTGTGATAT
AAAAATGTTGTCTTTGTATTATTGTTCTATACAATAATTGCATTGTCCAC
TTCTGTGCAGGAATACAATGATACGTTATTGATCACTTACCTGGCCATGT
TTACCAACTGCTCAAGGTATCATACATGCTCCTTTTGTGGAATTTCTCTA
TCTTTCATGTGTTCTTTATACTTTCTTTTGGGGTAAACCAATTTGTGTGA
TTAATGAAAAATATAGCTCAAGGAAGTGACAAGAAGTTGATTAATTGCCG
TACACCATATAGTGAAGCACTTGAGACCTTATCTAATTGTATGGTACACG
TTTAACTTTATAATTTTGCTGAACAAAGGAATCACAAGTACCGTATTTCT
ATTTTGATGAAAATATTACAATATTATTGTCCTCCAGTAAGATGTGACAT
CTACTTGATCATTGGCATAATAAATTTTTTTATGCTTATAGTAGGAAAGT
GTAAAGGGGTACTTGGGGCTACATTTGCATTCATACGGGTGCATGTCTCT
GGGTTAAAGATATAGATACAGATGCATCCCGGCACATCTGATTACAGATG
TGAGAAATTGCAATTTCATGAACGTAACCAAAATTATAAAATTCTATCAC
TTGATGTCTTCTTCATCTTTTATCTATGACAAAGCTAACTGTGGTTCCGT
TTCCTTGGATCCAGCACAATGAATGAGGTAGTCGACAAATTCAACACTGC
CTACGACAGGCATAGTCGAAGGGGTGGACGAACTGCTTTCATCTGAAAGT
TCCTATAGTTCCCCTCCCTTTCTCCCTCTGAAACTGAATAATTCAAAAAG
AAATAACAGGTTTTTTTTGCTCTTTCCTTGCACATTGTGCTGTTAGATTG
TAATTGAATTCTTAGAGATGCAGATAAAAATGGCCTTACTGGTAGATTCT
GGTGTTTGTTTCCTGTTTGGTCTCTCTCTTTTATTTTTTTATTTTTTTAT
TTTAAATATAAATATTGTATGCTATGGGTTGCTCCGTATCAGAAAAAAGA
GCGGAAAAATGTGTTGGGCATTCACGGATAACCTCACCATGTCTTTGATG
TAATTAAGGTTACAATATAGCCAAGAAAATCGAAGGAGCTTCAAGGGATT
AAGTGTTAGAACAGTGGGACTTTGGTTTGAAGC
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gene from alignment at Chromosome01:1438306..1452088+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G008500.v6.1 ID=Manes.01G008500.v6.1|Name=Manes.01G008500|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=13783bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1438306..1452088+ (Manihot esculenta)
CTCGCAAATATAGCGGTTAAATCTCAAAGATTGTCACTGGCAGAGAGTCC GATTGGACGGCAGGGATCGGTGCCGGGGAAAATTGAAGACCGGGAATACG ACAATGGCGTCCTCGTCCACTAGCGGTTTAACGTTCAAGCTACACCCACT TGTTATAGTTAATATATCCGATCACTATACTCGGGTTAAGTCTCAGATAA ACCCTCCCGTTCCCTCCACCGCTAATACTGTTTCCAGCAACACCAACGGC GCCGGCGATGGTGTCAGCACTGCTGTTTCAGCTGCAACGCGGCCAACGAG AGTCTATGGATGCGTTATAGGAGTGCAGAGGGGACGCACCGTTGAGATTT TCAATAGTTTTGAACTTCTCTATGATCCCATCACCCACTCTCTACACCGA GCTTTCCTTGAGAAGAAGCAAGAGCTCTGTAATTTTCCTATATAACTTCC TTTTTTGGGGGATTGTTAATTTGTTTAATTGTGGTGTGGTAGTTCCTAGG ATTCCATAAATTAATTGAAAATCTTGTGATTCTATTACAGATAAGAAGGT TTTCCCTCATTTTTACGTCTTGGGATGGTATTCAACGGGTAGTGATGCTG AGGAATCCGATATGCATATTCACAAGGCTGTATGTTTTTTCCCTTCTCCT TTTTCTGAATCATGCCTTTTGTTGTTAAATTATTTTCAATGTTTTTCTAA ACGTTTTTAAATTGAAAATTCAGTATAGTGAGGGAGGTAATTTATAGAAA TGGTGATGTGAGATGTGAATATACCTGGTTTTGCTACCCTCTTGTAGAGA AGCTGCTTGCGTTGCTTCATGCTGCAGTTGGATGTAATACTGATTTACTT ATTTGAGCCAATTTAGAATAAACAAAATCTAAAGTTTTTTTCCTTTTCAA ATTGGGATGAGGAGAAGTTCGAGTTGTTTAGGGCTGGAACAGCCAAGGAA 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