Manes.01G007300.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G007300
Unique NameManes.01G007300.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length7036
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:1210643..1217678 -
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
AncestorIdentifiercassava4.1_002620m.g.v4.1
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G007300.3Manes.01G007300.3.v6.1Manihot esculentamRNA
Manes.01G007300.2Manes.01G007300.2.v6.1Manihot esculentamRNA
Manes.01G007300.1Manes.01G007300.1.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G007300.v6.1 ID=Manes.01G007300.v6.1|Name=Manes.01G007300|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=7036bp
AATAATATAAAAATAATAAAATAATATTTTATGTGATGCAATTAAAAAAT
TCAAAGTTAAACGCTGTGAGTGAAAATTAAATAATAATAATAATAACAAG
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CTGTTGAGATTACTACTTGAATTTACATTAGCTTACAAGCTTTAGATTAT
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GGCTTCCCGTACCCCTGTGGTGTTGGCTGCTCCCAGGCTGGTATGAAGCC
TATGAAAAAAAAAAAAGTAAGAAAGTTACCAAAGAAGGAAGGTAGGTTTA
AAGAATCATAAAAAGGTATTGCAAACTTAAACTCATGAGAAATAAGCTAT
ATATTGACTCAGGTAAGAAAAAGTACCATGCAAGCTAAAATTGAATTCTT
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GATGCTATTCAGTTCTTAACTGAACAAAATTTCCCTACTCTGAAGGCAAA
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AAAAAAGCTACATGTTATAAAAAAAAAACCTCAAAAATGCCTTGTGCACA
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GCACTAGATAACAGTTCTTTATGAAAAATGAGGATATTTTTGCTGCATTT
CCTCTCCCTCTCTCCCTCTCAAAATTTAATAACTAAGGAAAGAAAATACA
AACCAAAGACAGTTTACTCCCGCCATAGAAATACAGGAGGGAAAAGGTAA
AATTGCAGAACAGCTCTCTGACCTCATTGTATGCATCCATGTTAGACAAC
TATATCCAAACATAAAATAAATCTCTCTCGCTCTCCGCCACCCTCCCCCC
TTTTCCAAAATTTAATAACTAAGGAGAGCAATCCAAACCAAAGACAATTT
ACTCCCTCCATAGAATTCCAGGAGGGAAAAGGTAAAAACACAGAATAGCT
CTCTGACCTCATTGTACGCATCTAAGTAAAGCACTTACAAAATAAGGACA
ATTATCAGAGCTGCATATCAAAATATAAAATAAATTTGGAAGAGATAACC
AAAGACATAACTTTTATGATGATATTGTGCTGGATCAATCAGATCATATT
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GTTGAGGCTTAATCCTTTCTTTGAAAAAAAGGAAAGAAATATGGTTTGGC
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ATTCAATGCAACTCCCAAACATCACCAATCCCCATCTTATACTATATGTA
TCTACTACAATAGCAGACCTCGAAATAAGTCCTTTAACCATTAATTGAAT
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TCAACTCTAAATCAACTTTTAATACACTCTAACCAACATTTTTTTTTAAA
AAAAAAAGTGTTCTACTCAACATCACTTTCAATTGCAGTGCCAATAGACT
CTAACTTGCTATTGCAAAATCATATTAGGCATGTCTACCACATGCAATCT
AGACTTTTTATTAAGAAAACAAACCATGAAATTAAATATCTGGCATACTT
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TAGAATTAACCATTTAAGAACAAAATTTGACAAGCATCAAAAACAGAACC
CAGTAAGCATCAGTGCATATAAGATGAATAGTTAAATAAGAAAGCAGAGG
GTTAATTCAAGGACAAACTAAAATTTAATCTACTTGTCGGCACTTGGAAT
TTTCTTAAGGAAAATATCAAATTTCACTCCTGAAATTAGGGTTCGAGATA
ATGAAATTCAGTAACAAAAATCATGTCGTAAAGAAGACTATTTCTATAGT
ACCTCTCCATTATGAAGACTCATCTCATTCTGCAGTGGGTTGATGTCCTC
TGCTGCAGAAGGACAGTTTGAAAAAGTGGTAAGGAACTCCGAAATCATAA
GACCATCATAGCCATCTGGAACCTCGGTTATATCTCCAGCGTTCTGTGCA
TTATTGGGAAGCACCTCTGTGCCAGTAAATGTTGTTTCCCTGAATAACTA
AAATACTTAGACCAAAAACAGAAATGCAAACTTTGCAGAAACTAACAATT
GCGTCTCACTTACGAACTAGAACCAACACAGGAGAAGAGTAATAGACTAT
ATATTTTCATTTGAGAAGTTGAGAAACATATAGAATAAGAAAATAATGAT
AAGAGGGACATACTCTTGCTGTGAATTATCAAAAGCCTTATCTCCTGAGT
TGGAATCATTCTCCAAATCAATGACTTCAATATGTTTGCCATTATTTGCA
TTGCTTATTGACAAATCAATGTCAACCTGTGCTGCTTCCTTTTTGCTTGC
TGGAATAGACGGGTACACGAGGATTGGATCATTACAATGATAATCATTCA
TATCAGCAGCCTCCATTAAATTGAGGTCACAGATCTTAAACGAACTCGGA
AAAAGTTGTTTCTCTTGTGTGTACCCGAAACTTGGTTCACTACCTGCGTT
TTGAAATTGATGACTATGAAACGAGCGGTCTCGAGTGACAGCAATACTTA
CTGGATGATCAGGTGAAGGCTTCCCCGCTTGTGAGCTATCTTGGTCTTGA
CTAAAATTAGAGAGATGAAGCTGGTCATTGGCTGTACTAACCAATGATGG
AAAACATTCTCTAGGCTTCTTGGTTGCCTCATTCATATCAGAATCTTCAG
CAGTTCGTTTCTCACCTCTCTCCTTAACTGACATGGACCTTCCAAAGCTC
GCCATCCCCTGACTTAATTCTTGCTTGCTGTCACACATAAAAGCCCTAGC
TGGAAAGGATTGAGACCTCATGCATTTACCCTTGCCAGAAACAAATGGGG
GGCCTATTTCTCCAATATCCCCATCAGAATGTACAGGCACTACTACTTTA
GACATTTCAACATCACATTTTGCATCGTTAGTTGTATTTGGCAGTGAATC
ACCCATTGAGAAATCAAGAGTGCCATCTGGAACTGAGACTTCAGATCCTT
TGGGAGGCTCAACATCAGATGGATTTTCCTCTTCCTTGTTAGGAACTTGT
TCAACCTTGGGGACCCTGTACGTCAATGAAGACCGTGTTTTAGTAGGGAC
CTTCACAAATTTGCAGAATGTTAGTAAATCAGATCCATGCTTGCTAGAGA
GATCACCATCCACTGCAAAGGACTGGATATGTGAGTCCTCAGAAATAATT
AGTTTCTCAGTTTCATGCCTATGATTGTAATCCATCTCCTTCCCAGAATT
CAATTTTGCCAAATCAACAGACGCCTTGGAAGGTTCCGCATCAGTCTCAT
CTTTCTCAATGATAAAAGAATTTTCCTTGGAACCCATGTCATCTTTGAAC
TCTTCTCCTGATTCAATTTCAGTTGCTTCCTCACTTTCTGGTGCTGACCC
ACACTGACCAAACTTCCCATCAACATCTTCACCAACTTGATGCTCTTCAT
AATGTTCAGAAATTGAATCATCATCCCCCTCCGTATCAAGTGACATCTGA
TTTCGATCTGACCACCACCCGCTCCTCCCATATTCTCTGCCCCAATCCGA
GCTATAATTCCGATGATAATTCTCTCCTCTCCTCCTACCTTTTACATGAT
TTCTCGAATTGAAGTCATCAGAATGCCTTCTCCTACCTGTTCCAGCATCA
GAAACAACACTTCCTAGGCGGAAACGGGCAGATGTTCGGCCCTCCTGTGC
AAAGTCCTCTTGTACCCTAAAATCCTGATAGTCTCCAGCTTGCTTCCTTA
AACTACCATTCTGCCACTTACCAGAAAGTGCATTCTCAGGTAACAATCCC
TTGGACACTAAATATTCAGCTGCAAGTCTACCCGCTTCCATCAAAATATC
TCCTTTGCGTGTTGGTGGCTGAGGTGGCTGTTGAAAAGATTTGGGCTGAA
CCTGGCCACGGCCAAAGCCCCGATTATTGAAGCTTCTGTATTCAGAATTG
TAAAAGCCATAGCCTCTGGCTGAGGTATCTGGGGATATCCTCGAGGCACC
CATCCCCATCGAACTAGACCTGTACCCATTTCCAGGACTTCGGTGCCTAG
CATGCATCTTTGGCTTCCTGATTATTCTCAAAACTACAACAATCAATCAA
AGTTTAAGAGAAAATAGCAGGTCCTTGTAGCTCCCATACATCGAGGACAG
GTTGCACAGAAATAAGAAATTGCGATCAAGTAAAGCTTTCAATTAGGTAC
TCATAAATTAAATAATAAGGTTTTATCCGGTTAAAGACGAGCAAATTAAC
CCAGCAATAAATTGTAGAGCCAAAATGGCAGCTAACTGGTGCTTAACAAT
CAATACATGTAGTAATCTAATTCTTTTGCGCACTTTTGAGGTCAAGGAAT
CAAAGAGTCAAAATCAACCAATCCAAGAGTAAAAAACCAAGAAATGAGAT
AGACAGAAATCAGAGGTGATCTTGGCTCCAAGGACAGTAAATATCTGACC
TTTCCTTCGTTCTCTGTTTTTGGGTCTTCACCTGAGGCTGTCTATTCGTT
TTTTATGTTTGTCGACCAAGAAGAAAAGAAAATTCAGCTCTGGTCATGTT
AGTGTGCCAGATCCAAGTAGGCCAGATTTATGGCCACCCCCTCTACCTAC
CTCAACACTTCATCATCTACATCAAACCTAAAAGAAGCCCTAAATTTTCC
AATTGAAGACTTATTAAAATCTTCCACGATGCAAAGGTAATTGCTTTAGG
TCAAAAGGAAAAAATCTTGCAGCAATCAGAAAGTTTGATGCTTTCTGCAG
CCAAGCAGACAAGGAATACTAAACAGTACCATAACATCCATCCATGGCCG
TTACAGTAGCTGACAAACCTCGACTTGGCCCTAAAATAAGATTACTCGTG
GCTTTTTTCAACAGAAAATGTACCGGTAACCTGTAAATTCCAGTTGCACA
AAACCCCAACACCTCTTTTTTGGTAAAAGCGAGAAGAAAACAAAACAAAT
CAACACAACTAGAGAGCTTCAGTGCACGAGACCATCGAATCGTCTTCTGT
TCGCAATTGGATAAGAACAATGACAATTCCAGTTATTGGATTATGTTAAT
TCTGAGATTCCTCCTCCTCCTACCCAACTCACCATCTCACTTCAATTTGA
TTTTGTTCGATAATAAACTCTCCTTCCACTCCATTCCTGTACAGCTTTGT
ATCAACACCCATTTCGCAATTGATCCCAGATATCCACCTAAATTGAGGTT
TGAGGAGTTGAATTTCCGGCGAAACCAGGTCCAGTGGAGACAGAAGTGTA
TTAAGCAACGTCGTCTGTAGAGTTTCGGTTTAGGTCTCAGAGTGACTTTT
CGCTATCTATCTCACAGCAAGGAAAGTACTGAGTCT
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gene from alignment at Chromosome01:1210643..1217678-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G007300.v6.1 ID=Manes.01G007300.v6.1|Name=Manes.01G007300|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=7036bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:1210643..1217678- (Manihot esculenta)
AGACTCAGTACTTTCCTTGCTGTGAGATAGATAGCGAAAAGTCACTCTGA GACCTAAACCGAAACTCTACAGACGACGTTGCTTAATACACTTCTGTCTC CACTGGACCTGGTTTCGCCGGAAATTCAACTCCTCAAACCTCAATTTAGG TGGATATCTGGGATCAATTGCGAAATGGGTGTTGATACAAAGCTGTACAG GAATGGAGTGGAAGGAGAGTTTATTATCGAACAAAATCAAATTGAAGTGA GATGGTGAGTTGGGTAGGAGGAGGAGGAATCTCAGAATTAACATAATCCA ATAACTGGAATTGTCATTGTTCTTATCCAATTGCGAACAGAAGACGATTC GATGGTCTCGTGCACTGAAGCTCTCTAGTTGTGTTGATTTGTTTTGTTTT CTTCTCGCTTTTACCAAAAAAGAGGTGTTGGGGTTTTGTGCAACTGGAAT TTACAGGTTACCGGTACATTTTCTGTTGAAAAAAGCCACGAGTAATCTTA TTTTAGGGCCAAGTCGAGGTTTGTCAGCTACTGTAACGGCCATGGATGGA TGTTATGGTACTGTTTAGTATTCCTTGTCTGCTTGGCTGCAGAAAGCATC AAACTTTCTGATTGCTGCAAGATTTTTTCCTTTTGACCTAAAGCAATTAC CTTTGCATCGTGGAAGATTTTAATAAGTCTTCAATTGGAAAATTTAGGGC TTCTTTTAGGTTTGATGTAGATGATGAAGTGTTGAGGTAGGTAGAGGGGG TGGCCATAAATCTGGCCTACTTGGATCTGGCACACTAACATGACCAGAGC TGAATTTTCTTTTCTTCTTGGTCGACAAACATAAAAAACGAATAGACAGC CTCAGGTGAAGACCCAAAAACAGAGAACGAAGGAAAGGTCAGATATTTAC TGTCCTTGGAGCCAAGATCACCTCTGATTTCTGTCTATCTCATTTCTTGG TTTTTTACTCTTGGATTGGTTGATTTTGACTCTTTGATTCCTTGACCTCA AAAGTGCGCAAAAGAATTAGATTACTACATGTATTGATTGTTAAGCACCA GTTAGCTGCCATTTTGGCTCTACAATTTATTGCTGGGTTAATTTGCTCGT CTTTAACCGGATAAAACCTTATTATTTAATTTATGAGTACCTAATTGAAA GCTTTACTTGATCGCAATTTCTTATTTCTGTGCAACCTGTCCTCGATGTA TGGGAGCTACAAGGACCTGCTATTTTCTCTTAAACTTTGATTGATTGTTG TAGTTTTGAGAATAATCAGGAAGCCAAAGATGCATGCTAGGCACCGAAGT CCTGGAAATGGGTACAGGTCTAGTTCGATGGGGATGGGTGCCTCGAGGAT ATCCCCAGATACCTCAGCCAGAGGCTATGGCTTTTACAATTCTGAATACA GAAGCTTCAATAATCGGGGCTTTGGCCGTGGCCAGGTTCAGCCCAAATCT TTTCAACAGCCACCTCAGCCACCAACACGCAAAGGAGATATTTTGATGGA AGCGGGTAGACTTGCAGCTGAATATTTAGTGTCCAAGGGATTGTTACCTG AGAATGCACTTTCTGGTAAGTGGCAGAATGGTAGTTTAAGGAAGCAAGCT GGAGACTATCAGGATTTTAGGGTACAAGAGGACTTTGCACAGGAGGGCCG AACATCTGCCCGTTTCCGCCTAGGAAGTGTTGTTTCTGATGCTGGAACAG GTAGGAGAAGGCATTCTGATGACTTCAATTCGAGAAATCATGTAAAAGGT AGGAGGAGAGGAGAGAATTATCATCGGAATTATAGCTCGGATTGGGGCAG AGAATATGGGAGGAGCGGGTGGTGGTCAGATCGAAATCAGATGTCACTTG ATACGGAGGGGGATGATGATTCAATTTCTGAACATTATGAAGAGCATCAA GTTGGTGAAGATGTTGATGGGAAGTTTGGTCAGTGTGGGTCAGCACCAGA AAGTGAGGAAGCAACTGAAATTGAATCAGGAGAAGAGTTCAAAGATGACA TGGGTTCCAAGGAAAATTCTTTTATCATTGAGAAAGATGAGACTGATGCG GAACCTTCCAAGGCGTCTGTTGATTTGGCAAAATTGAATTCTGGGAAGGA GATGGATTACAATCATAGGCATGAAACTGAGAAACTAATTATTTCTGAGG ACTCACATATCCAGTCCTTTGCAGTGGATGGTGATCTCTCTAGCAAGCAT GGATCTGATTTACTAACATTCTGCAAATTTGTGAAGGTCCCTACTAAAAC ACGGTCTTCATTGACGTACAGGGTCCCCAAGGTTGAACAAGTTCCTAACA AGGAAGAGGAAAATCCATCTGATGTTGAGCCTCCCAAAGGATCTGAAGTC TCAGTTCCAGATGGCACTCTTGATTTCTCAATGGGTGATTCACTGCCAAA TACAACTAACGATGCAAAATGTGATGTTGAAATGTCTAAAGTAGTAGTGC CTGTACATTCTGATGGGGATATTGGAGAAATAGGCCCCCCATTTGTTTCT GGCAAGGGTAAATGCATGAGGTCTCAATCCTTTCCAGCTAGGGCTTTTAT GTGTGACAGCAAGCAAGAATTAAGTCAGGGGATGGCGAGCTTTGGAAGGT CCATGTCAGTTAAGGAGAGAGGTGAGAAACGAACTGCTGAAGATTCTGAT ATGAATGAGGCAACCAAGAAGCCTAGAGAATGTTTTCCATCATTGGTTAG TACAGCCAATGACCAGCTTCATCTCTCTAATTTTAGTCAAGACCAAGATA GCTCACAAGCGGGGAAGCCTTCACCTGATCATCCAGTAAGTATTGCTGTC ACTCGAGACCGCTCGTTTCATAGTCATCAATTTCAAAACGCAGGTAGTGA 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GATCCAGCACAATATCATCATAAAAGTTATGTCTTTGGTTATCTCTTCCA AATTTATTTTATATTTTGATATGCAGCTCTGATAATTGTCCTTATTTTGT AAGTGCTTTACTTAGATGCGTACAATGAGGTCAGAGAGCTATTCTGTGTT TTTACCTTTTCCCTCCTGGAATTCTATGGAGGGAGTAAATTGTCTTTGGT TTGGATTGCTCTCCTTAGTTATTAAATTTTGGAAAAGGGGGGAGGGTGGC GGAGAGCGAGAGAGATTTATTTTATGTTTGGATATAGTTGTCTAACATGG ATGCATACAATGAGGTCAGAGAGCTGTTCTGCAATTTTACCTTTTCCCTC CTGTATTTCTATGGCGGGAGTAAACTGTCTTTGGTTTGTATTTTCTTTCC TTAGTTATTAAATTTTGAGAGGGAGAGAGGGAGAGGAAATGCAGCAAAAA TATCCTCATTTTTCATAAAGAACTGTTATCTAGTGCACGAAGAATCCCAC AGTTGTGGGCTATGGAGAGGGTTGATGTGCATGAAGCACTCTGAGCTGTA TATAAAAAGTATCTTTTTAATTTGAGATGTGCATAAGAGAAGAGAAGAGG AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACCATATCCTGACATTTCTTAGAAA AATGGTTGCCTAGTGCATGAAGCATCCCACAGTTGTGGGCTATGGAGAGG GTTGATGTGCATGAAGCATTGGGTATTTGGGTTCGGGGATAGGATCTCCC CATTATTGGATAGCTGTTGTTAAACCAGGTAGAATACTTTATGAAATAGG CGGAGTGAGGGTTGATGTGCACGAAGCATTCGGAGTGTTATATAAAAAGT TATTTTGTTTTTGAAATGTGCCACAGGACGAGAGAGAGAGAGAGGAAATG CAGAAATCATATCCTGAGTTCTCATAAAAAAAAAGTGTTATCTAGTGCAC GAAGCATCTCACAATTGTGGACTATGGAGAGGTTGATGTGCACAAGGCAT TTTTGAGGTTTTTTTTTTATAACATGTAGCTTTTTTTGTTTTTTATAATT TGAAACATGCCATAAGACAAAGTGGTGGGTGTCTAGTTTGCCTTCAGAGT AGGGAAATTTTGTTCAGTTAAGAACTGAATAGCATCTTTTGGTCATGATC ATGGTTCTCACTTATCATCAGTCACACGGCAGTGTAAAGAATTCAATTTT AGCTTGCATGGTACTTTTTCTTACCTGAGTCAATATATAGCTTATTTCTC ATGAGTTTAAGTTTGCAATACCTTTTTATGATTCTTTAAACCTACCTTCC TTCTTTGGTAACTTTCTTACTTTTTTTTTTTTCATAGGCTTCATACCAGC CTGGGAGCAGCCAACACCACAGGGGTACGGGAAGCCCTTTTAATCTGCAA GGGAATGCTAGTTGGTATGCTTACTGTTGGTATTGACTAGCTTAATCCAA ATTCAACCCTGCTTTGTTTTTTATTTTGAAGTTGCTCGTAAATGGTGCAA GCAACCGTCTCTTATAGCAATTTTAGTAATGGTGTATGCTTTCCCACTCA TTTAACATATTAGTGAAGTTGTTTACCATATTGATTAGAAATGGCCTGGG GCATGCCTTTTACAGAATTGAAATGGGATGATAATGATAATCTAAAGCTT GTAAGCTAATGTAAATTCAAGTAGTAATCTCAACAGGGCTGCAGACAGAT TAATTCAAGTACTACTTAAGAATTAAGGGTAGACATGCAGCAGCATAGGA GACTATGCGAAGCTCTCTACTGCCTGCAGATTAACTGGCTGCGTTGTAGA CAAACTATTAATTTAACGGTCAAAATTGTCATTGAATTTCTTTTTTCACG ACAATGAAAGTTTGATATAATTTGATTTAATGCAAAATTTTATCCATAGG 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