Manes.01G003700.v6.1 (gene)

Overview
NameManes.01G003700
Unique NameManes.01G003700.v6.1
Typegene
OrganismManihot esculenta (Cassava)
Sequence length1892
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Chromosome01chromosomeChromosome01:718947..720838 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Manihot esculenta (JGI)2015-07-22
Properties
Property NameValue
AncestorIdentifiercassava4.1_023888m.g.v4.1
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Manes.01G003700.1Manes.01G003700.1.v6.1Manihot esculentamRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Manes.01G003700.v6.1 ID=Manes.01G003700.v6.1|Name=Manes.01G003700|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=1892bp
ATGTTGCAGTGCATAGAGGGATTCGTTTCTTCCCTACTACGATGTTTTGA
TCTTGATTTATACAAACAATCAAGAGGCCTTGAAGACCCTGAACGTCTTG
CCCGGGAGACTGTGTGTATGCCACTGACCAATTGTTTATGATAATGTTGT
TAATCTTTAGTTTTATTCACCCAGTGGCATCCTTTAACTTCTAGTGTTTC
TCTGTGTAATGTCTAGATTACTTGCCACATGTTTTGGTCTTTGTTTTAAT
ACAGTTACATTTCTTGCCAAAAAGACCTATTTGTTTCGTGGTTATGGAAG
CCTTGCAAGAAAAAGCATTTAATAGAAATATTAATATAGGGAATGTCTCA
TCTGATACAGTTTGATCATGCAAATATCTACTTATTTAGTAATTTCTTTC
ATCTATCCGTACATTAAAGATAATAGATTTTGTTATTTTATGTTTTCCAT
TAGCACTTTGGTATATTTATTTCCATTGAAGATTGTTGTTTTGTTAATTC
TTGGTGCAGTCAGTGTGAGTGAAATAGAGGCACTGTATGAGCTTTTTAAG
AAGATCAGCAGCGCCGTGATTGATGACGGCCTGATCAACAAGGTTTGCTT
GCTTTTTATAGCACACCATAAAATTTTTTTACTTCAGCTGCAAGTTTGTT
TGGCATGTTTGATTGTTTAGACTTTAGATTCCTGTGAATACAATGGTCCC
TTCTAAATCCTAATATTATATTTTTCATTCTCTTTGTTTACGTGCTGCTT
TCTTGTAATTTATTCAGAAACTTTTGTCTGCATTTTTATTTAACCCCATG
TTACAGGAGGAGTTTCAATTAGCATTGTTCAAGACAAACAAAAAGGAGAG
CTTATTTGCTGATCGGGTACTTTTTTCTGTATTTTATCACAATTTACTCC
GATTGTGTCAGAGCTATTATTCATTCTAATAAAGGGCTACCTGCTGCTGC
CTGCTTTTGCTTATTGATTGCAGGTCTTTGATTTGTTTGATACAAAACAC
AATGGGATCCTAGGATTCGAAGAGTTTGCTCGTGCCCTCTCTGTTTTTCA
TCCAAATGCGCCAATTGAAGATAAGATTGAATGTATGTTTTTTGAGGTTG
ATAATTTTTCGTATTGTAAATTCTTTTGTATTGCTTGAGTTGGGCATATC
TATTGTTGGTTTATTATGCTAGAATGATGAAATCAGCCTTCACTTCTTGG
TGCATTATTCCTATTTATTTGTGTGATGTGGTGTTGCAGTTTCTTTTCAA
CTGTATGATCTCAAACAGCAAGGTTTCATTGAAAGACAGGAGGTCAGTGT
TATTGTTTCAAGATTTTACTATTTGAGTTTTTGGTTCTTCAACTGTCAGG
TGTTGATTATTATTTGATTTAGACTGTTAAAACTGTTATCCACATTTATT
GCTTAGGTGAAACAAATGGTTGTTGCTACTCTAGCTGAATCTGGTATGAA
CCTTTCAGATGACGTTATTGAGAGTATAATTGACAAGGTGCTACCTCAGA
TTAATTCACTTTTTCCTGATAATGACTATAATTTTGGATACTTATTAGGA
TTCGGATACTCTTTCTGCAAGTACTGGTTGGAAAGCTTATATATATTTCT
TCCCTGAATTTCAGACCTTTGAGGAAGCTGATACAAAGCATGATGGCAAG
ATTGACAAGGAAGAGTGGAGAAACCTTGTTCTCCGCCATCCATCTCTTCT
GAAAAATATGACTCTTCAGTATCTCAAGTGAGTTCCAAAATCCTATTGTA
AAAGCAGAACAATATTTATTAATTTTGTTCATGACAGAATTGGCAAATTG
CATGTTTGGATTCTTATCTTTTTCCATTGAACAGGGATATTACCACTACA
TTCCCAAGCTTTGTGTTCCACTCGCAAGTTGATGACATGTAA
back to top

gene from alignment at Chromosome01:718947..720838+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Manes.01G003700.v6.1 ID=Manes.01G003700.v6.1|Name=Manes.01G003700|organism=Manihot esculenta|type=gene|length=1892bp|location=Sequence derived from alignment at Chromosome01:718947..720838+ (Manihot esculenta)
ATGTTGCAGTGCATAGAGGGATTCGTTTCTTCCCTACTACGATGTTTTGA TCTTGATTTATACAAACAATCAAGAGGCCTTGAAGACCCTGAACGTCTTG CCCGGGAGACTGTGTGTATGCCACTGACCAATTGTTTATGATAATGTTGT TAATCTTTAGTTTTATTCACCCAGTGGCATCCTTTAACTTCTAGTGTTTC TCTGTGTAATGTCTAGATTACTTGCCACATGTTTTGGTCTTTGTTTTAAT ACAGTTACATTTCTTGCCAAAAAGACCTATTTGTTTCGTGGTTATGGAAG CCTTGCAAGAAAAAGCATTTAATAGAAATATTAATATAGGGAATGTCTCA TCTGATACAGTTTGATCATGCAAATATCTACTTATTTAGTAATTTCTTTC ATCTATCCGTACATTAAAGATAATAGATTTTGTTATTTTATGTTTTCCAT TAGCACTTTGGTATATTTATTTCCATTGAAGATTGTTGTTTTGTTAATTC TTGGTGCAGTCAGTGTGAGTGAAATAGAGGCACTGTATGAGCTTTTTAAG AAGATCAGCAGCGCCGTGATTGATGACGGCCTGATCAACAAGGTTTGCTT GCTTTTTATAGCACACCATAAAATTTTTTTACTTCAGCTGCAAGTTTGTT TGGCATGTTTGATTGTTTAGACTTTAGATTCCTGTGAATACAATGGTCCC TTCTAAATCCTAATATTATATTTTTCATTCTCTTTGTTTACGTGCTGCTT TCTTGTAATTTATTCAGAAACTTTTGTCTGCATTTTTATTTAACCCCATG TTACAGGAGGAGTTTCAATTAGCATTGTTCAAGACAAACAAAAAGGAGAG CTTATTTGCTGATCGGGTACTTTTTTCTGTATTTTATCACAATTTACTCC GATTGTGTCAGAGCTATTATTCATTCTAATAAAGGGCTACCTGCTGCTGC CTGCTTTTGCTTATTGATTGCAGGTCTTTGATTTGTTTGATACAAAACAC AATGGGATCCTAGGATTCGAAGAGTTTGCTCGTGCCCTCTCTGTTTTTCA TCCAAATGCGCCAATTGAAGATAAGATTGAATGTATGTTTTTTGAGGTTG ATAATTTTTCGTATTGTAAATTCTTTTGTATTGCTTGAGTTGGGCATATC TATTGTTGGTTTATTATGCTAGAATGATGAAATCAGCCTTCACTTCTTGG TGCATTATTCCTATTTATTTGTGTGATGTGGTGTTGCAGTTTCTTTTCAA CTGTATGATCTCAAACAGCAAGGTTTCATTGAAAGACAGGAGGTCAGTGT TATTGTTTCAAGATTTTACTATTTGAGTTTTTGGTTCTTCAACTGTCAGG TGTTGATTATTATTTGATTTAGACTGTTAAAACTGTTATCCACATTTATT GCTTAGGTGAAACAAATGGTTGTTGCTACTCTAGCTGAATCTGGTATGAA CCTTTCAGATGACGTTATTGAGAGTATAATTGACAAGGTGCTACCTCAGA TTAATTCACTTTTTCCTGATAATGACTATAATTTTGGATACTTATTAGGA TTCGGATACTCTTTCTGCAAGTACTGGTTGGAAAGCTTATATATATTTCT TCCCTGAATTTCAGACCTTTGAGGAAGCTGATACAAAGCATGATGGCAAG ATTGACAAGGAAGAGTGGAGAAACCTTGTTCTCCGCCATCCATCTCTTCT GAAAAATATGACTCTTCAGTATCTCAAGTGAGTTCCAAAATCCTATTGTA AAAGCAGAACAATATTTATTAATTTTGTTCATGACAGAATTGGCAAATTG CATGTTTGGATTCTTATCTTTTTCCATTGAACAGGGATATTACCACTACA TTCCCAAGCTTTGTGTTCCACTCGCAAGTTGATGACATGTAA
back to top